195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1996 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1996  AMMECR1 domain-containing protein  100 
 
 		 522 aa  1060    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1298  hypothetical protein  53.99 
 
 		 276 aa  302  1e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.495257  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1586  hypothetical protein  37.84 
 
 		 464 aa  237  4e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.251003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2152  hypothetical protein  32.67 
 
 		 481 aa  237  4e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.404851 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2429  hypothetical protein  33.27 
 
 		 484 aa  229  1e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000652798  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1171  hypothetical protein  30.98 
 
 		 447 aa  208  2e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1177  hypothetical protein  31.19 
 
 		 447 aa  208  2e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1299  AMMECR1 domain-containing protein  56.82 
 
 		 187 aa  192  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.107414  normal  0.703155 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2409  hypothetical protein  38.13 
 
 		 284 aa  189  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3512  AMMECR1 domain-containing protein  50.57 
 
 		 182 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0800237  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0529  AMMECR1 domain protein  49.42 
 
 		 181 aa  183  8.000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.673867  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1107  hypothetical protein  49.43 
 
 		 179 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1577  AMMECR1 domain-containing protein  47.49 
 
 		 185 aa  177  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000224473  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0462  AMMECR1 domain protein  50.85 
 
 		 179 aa  176  7e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3068  hypothetical protein  37.63 
 
 		 277 aa  176  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.27957  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0072  hypothetical protein  39.36 
 
 		 267 aa  172  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1094  hypothetical protein  29.05 
 
 		 438 aa  169  1e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2231  AMMECR1 domain-containing protein  50.84 
 
 		 190 aa  168  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1691  hypothetical protein  37 
 
 		 267 aa  167  4e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1122  hypothetical protein  29.96 
 
 		 438 aa  167  5.9999999999999996e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2247  hypothetical protein  36.8 
 
 		 267 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2961  hypothetical protein  35.03 
 
 		 298 aa  166  9e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1313  hypothetical protein  29.47 
 
 		 438 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2447  AMMECR1 domain protein  48.86 
 
 		 183 aa  164  3e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.255289  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0215  hypothetical protein  33.21 
 
 		 275 aa  164  3e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3359  hypothetical protein  35.53 
 
 		 271 aa  164  4.0000000000000004e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1383  hypothetical protein  36.17 
 
 		 284 aa  163  6e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0273  hypothetical protein  39.16 
 
 		 287 aa  162  1e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1046  protein of unknown function DUF52  35.69 
 
 		 284 aa  161  2e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.491451  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1957  hypothetical protein  34.8 
 
 		 267 aa  162  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0594008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2688  AMMECR1  43.5 
 
 		 180 aa  160  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000703212  normal  0.0554703 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1004  hypothetical protein  36.52 
 
 		 270 aa  159  9e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2774  AMMECR1 domain protein  48.62 
 
 		 233 aa  159  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0062  hypothetical protein  35.69 
 
 		 281 aa  159  1e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.853485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1509  protein of unknown function DUF52  35.58 
 
 		 269 aa  158  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0398  hypothetical protein  38.25 
 
 		 274 aa  159  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2214  hypothetical protein  35.64 
 
 		 262 aa  158  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0726  protein of unknown function DUF52  36.65 
 
 		 282 aa  157  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.14688  hitchhiker  0.000000254524 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1162  AMMECR1 domain-containing protein  46.63 
 
 		 184 aa  156  9e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1210  hypothetical protein  44.32 
 
 		 183 aa  155  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000546429  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2620  hypothetical protein  36.23 
 
 		 282 aa  155  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.568978 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2292  AMMECR1 domain protein  44.02 
 
 		 191 aa  155  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.165752  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1105  hypothetical protein  33.92 
 
 		 281 aa  155  2e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0028  hypothetical protein  33.57 
 
 		 281 aa  155  2e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2560  AMMECR1 domain protein  41.34 
 
 		 183 aa  154  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.88938e-32 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4112  AMMECR1  47.57 
 
 		 187 aa  154  5e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.558483  normal  0.706309 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1653  AMMECR1 domain protein  41.9 
 
 		 183 aa  154  5e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000224046  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2377  protein of unknown function DUF52  35.77 
 
 		 262 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0146872  normal  0.265283 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0897  hypothetical protein  36.46 
 
 		 278 aa  153  8e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1651  dioxygenase  33.71 
 
 		 267 aa  153  8e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  9.23672e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1088  hypothetical protein  33.57 
 
 		 274 aa  151  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1971  hypothetical protein  36.82 
 
 		 267 aa  151  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.307446 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1590  hypothetical protein  31.58 
 
 		 282 aa  152  2e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0059  hypothetical protein  34.4 
 
 		 282 aa  151  2e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0213251 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0632  hypothetical protein  35.34 
 
 		 284 aa  152  2e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.339724 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1286  hypothetical protein  35.34 
 
 		 284 aa  150  4e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1422  hypothetical protein  35.93 
 
 		 265 aa  150  6e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00741798 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0860  hypothetical protein  35.21 
 
 		 277 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.671091  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0931  hypothetical protein  37.32 
 
 		 266 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0572  hypothetical protein  36.03 
 
 		 264 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.277433  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0477  hypothetical protein  36.73 
 
 		 269 aa  147  6e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1811  hypothetical protein  33.09 
 
 		 262 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0191  hypothetical protein  34.63 
 
 		 284 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.528017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0837  hypothetical protein  34.86 
 
 		 277 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.543815  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0307  protein of unknown function DUF52  33.93 
 
 		 265 aa  146  8.000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000324759  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1264  hypothetical protein  32 
 
 		 267 aa  146  8.000000000000001e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000472011  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2295  protein of unknown function DUF52  33.09 
 
 		 266 aa  146  9e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1885  protein of unknown function DUF52  33.72 
 
 		 267 aa  146  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00286837  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2215  protein of unknown function DUF52  37.5 
 
 		 274 aa  146  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1057  hypothetical protein  33.45 
 
 		 268 aa  145  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0697  hypothetical protein  32.86 
 
 		 284 aa  144  3e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1268  hypothetical protein  33.7 
 
 		 265 aa  143  9e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2994  protein of unknown function DUF52  35.79 
 
 		 283 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.255109  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1830  hypothetical protein  31.68 
 
 		 267 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0272  protein of unknown function DUF52  32.52 
 
 		 287 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00648873  hitchhiker  0.000150956 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1301  protein of unknown function DUF52  36.88 
 
 		 271 aa  140  3.9999999999999997e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0694479  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0033  protein of unknown function DUF52  34.05 
 
 		 263 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1928  protein of unknown function DUF52  31.97 
 
 		 266 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2683  hypothetical protein  36.86 
 
 		 274 aa  140  6e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.235336  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1832  AMMECR1 domain protein  42.16 
 
 		 193 aa  140  7e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.262195  normal  0.158131 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2830  AMMECR1  44.57 
 
 		 187 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.472988  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0124  hypothetical protein  43.09 
 
 		 208 aa  139  1e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2394  hypothetical protein  35.19 
 
 		 264 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00099938  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1061  AMMECR1 domain-containing protein  41.3 
 
 		 203 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1122  AMMECR1  46.48 
 
 		 191 aa  137  4e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1312  AMMECR1 domain-containing protein  43.09 
 
 		 191 aa  137  4e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.134499 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1848  hypothetical protein  33.33 
 
 		 262 aa  137  7.000000000000001e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2139  hypothetical protein  30 
 
 		 282 aa  136  8e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000979295  hitchhiker  0.0000710104 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1122  AMMECR1  46.07 
 
 		 184 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.486493  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3293  protein of unknown function DUF52  36.57 
 
 		 274 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1206  hypothetical protein  41.21 
 
 		 188 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.623161  normal  0.104237 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0216  AMMECR1 domain-containing protein  43.66 
 
 		 205 aa  134  3e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0346  AMMECR1 domain-containing protein  41.08 
 
 		 208 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.325278  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1871  hypothetical protein  34.67 
 
 		 268 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0180  protein of unknown function DUF52  32.73 
 
 		 285 aa  134  6e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.578209  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1565  AMMECR1 domain-containing protein  40.76 
 
 		 208 aa  133  7.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.326234 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1182  AMMECR1 domain protein  46.07 
 
 		 184 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1288  AMMECR1 domain-containing protein  44.26 
 
 		 186 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00113527  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5677  protein of unknown function DUF52  32.97 
 
 		 275 aa  131  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0901572 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0138  AMMECR1 domain-containing protein  39.13 
 
 		 199 aa  131  3e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.495335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>