183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1965 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1965  Ferritin, Dps family protein  100 
 
 
177 aa  367  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0514  Ferroxidase  63.31 
 
 
171 aa  227  7e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0298672  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0183  Ferroxidase  52.35 
 
 
171 aa  199  3e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000415099 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2466  Ferroxidase  54.82 
 
 
168 aa  191  4e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00000323257  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0118  Ferritin, Dps family protein  55.36 
 
 
172 aa  189  1e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.38357  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0879  Ferroxidase  53.05 
 
 
171 aa  186  1e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000223127  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0794  Ferritin, Dps family protein  56.52 
 
 
162 aa  182  3e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.413552  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1580  Ferroxidase  52.8 
 
 
161 aa  180  9.000000000000001e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0136  ferroxidase  53.75 
 
 
163 aa  179  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1565  Ferritin, Dps family protein  56.8 
 
 
169 aa  176  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.464439  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1199  ferroxidase  51.79 
 
 
169 aa  176  1e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0733743  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0328  ferroxidase  49.39 
 
 
170 aa  176  1e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.962185  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1381  ferroxidase  51.55 
 
 
162 aa  176  1e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000220076  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2519  Ferritin Dps family protein  52.07 
 
 
172 aa  176  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00323772  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1700  Ferroxidase  52.07 
 
 
172 aa  176  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000548628 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2555  cytoplasmic ferritin (an iron storage protein)  49.13 
 
 
174 aa  175  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000856866  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1307  ferritin  49.7 
 
 
173 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.757359  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0044  Ferritin and Dps  53.8 
 
 
175 aa  171  5.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.311572 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1791  ferritin  55.42 
 
 
186 aa  169  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000512633  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3808  Ferroxidase  48.77 
 
 
166 aa  167  9e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.057799  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3795  Ferritin Dps family protein  48.45 
 
 
164 aa  166  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1617  ferroxidase  51.83 
 
 
163 aa  165  4e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1683  ferroxidase  51.22 
 
 
163 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1120  Ferritin and Dps  45.78 
 
 
176 aa  164  8e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0668  Ferritin, Dps family protein  48.19 
 
 
173 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000253889  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3287  ferroxidase  47.17 
 
 
167 aa  162  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0940  Ferritin Dps family protein  46.58 
 
 
162 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0847106  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1697  Ferritin, Dps family protein  44.19 
 
 
173 aa  159  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000265061  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0043  Ferritin Dps family protein  45.03 
 
 
171 aa  154  7e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0617  Ferritin Dps family protein  45.96 
 
 
165 aa  153  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.433385 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0596  Ferritin, Dps family protein  44.1 
 
 
164 aa  153  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0556  Ferroxidase  44.72 
 
 
164 aa  152  2e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.729145 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1855  ferroxidase  45.28 
 
 
167 aa  152  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.185397  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2222  Ferritin Dps family protein  45.24 
 
 
176 aa  150  8.999999999999999e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000624545  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4070  Ferroxidase  43.21 
 
 
163 aa  150  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000582999  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5201  ferritin  48.81 
 
 
168 aa  150  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000941544  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0046  ferritin  48.81 
 
 
168 aa  150  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000030835  hitchhiker  1.9165399999999998e-20 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4880  Ferritin Dps family protein  48.81 
 
 
168 aa  149  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00199979  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5211  ferritin  47.59 
 
 
168 aa  149  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000025071  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5196  ferritin  48.21 
 
 
168 aa  149  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00124859  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4919  ferritin  48.21 
 
 
168 aa  149  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4764  ferritin  48.21 
 
 
168 aa  149  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000763521  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4783  ferritin  48.19 
 
 
168 aa  148  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31249  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5296  ferritin  48.21 
 
 
168 aa  149  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123556  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5164  ferritin  48.21 
 
 
168 aa  149  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.57868e-47 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2910  ferroxidase  49.71 
 
 
171 aa  148  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00246323  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0479  Ferritin Dps family protein  41.21 
 
 
168 aa  147  5e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.918864  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0866  ferroxidase  45.12 
 
 
172 aa  147  6e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761126  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0449  ferritin, putative  43.12 
 
 
160 aa  145  3e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000133256  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2418  Ferritin Dps family protein  44.1 
 
 
165 aa  144  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.47265 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1983  Ferritin Dps family protein  42.77 
 
 
172 aa  144  5e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0282013  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1047  ferritin family protein  41.76 
 
 
170 aa  144  9e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000219081  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1703  Ferroxidase  44.79 
 
 
164 aa  144  9e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.428586  hitchhiker  0.0000000000044787 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1236  ferritin family protein  41.76 
 
 
170 aa  142  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000720561  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0407  Ferritin Dps family protein  41.14 
 
 
175 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.179307  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1512  Ferritin Dps family protein  42.42 
 
 
175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2778  Ferritin and Dps  46.41 
 
 
168 aa  137  6e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1860  Ferritin Dps family protein  46.58 
 
 
164 aa  136  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00316362  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0428  Ferritin, Dps family protein  41.21 
 
 
175 aa  135  2e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1417  Ferritin, Dps family protein  46.25 
 
 
477 aa  134  5e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.672338  normal  0.285216 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2915  Ferritin Dps family protein  41.4 
 
 
172 aa  133  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2683  Ferritin Dps family protein  39.63 
 
 
168 aa  132  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000192038  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0827  ferritin  44.31 
 
 
164 aa  131  6e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1838  Ferroxidase  38.69 
 
 
168 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1570  Ferritin Dps family protein  35.93 
 
 
170 aa  127  7.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2122  Ferroxidase  38.69 
 
 
168 aa  127  8.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1286  ferritin  38.75 
 
 
160 aa  127  9.000000000000001e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7185  Ferroxidase  44.65 
 
 
165 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0136  Ferroxidase  37.85 
 
 
178 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4222  ferroxidase  37.85 
 
 
178 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0132  ferroxidase  37.85 
 
 
178 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0137  ferroxidase  37.85 
 
 
178 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01880  ferritin-like protein  37.11 
 
 
171 aa  125  3e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2236  Ferroxidase  38.1 
 
 
169 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.694695  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0132  Ferritin, Dps family protein  37.85 
 
 
178 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2260  Ferritin Dps family protein  38.55 
 
 
170 aa  125  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739627  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0139  ferritin  37.29 
 
 
178 aa  123  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4374  ferroxidase  38.75 
 
 
175 aa  123  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0134844  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0133  Ferritin, Dps family protein  37.29 
 
 
178 aa  122  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416166 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0127  Ferritin, Dps family protein  37.29 
 
 
178 aa  122  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0132  Ferritin, Dps family protein  37.29 
 
 
178 aa  122  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0123196 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0042  Ferritin, Dps family protein  38.75 
 
 
174 aa  122  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.97905  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1942  ferroxidase  39.24 
 
 
172 aa  123  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295968 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0129  ferroxidase  38.12 
 
 
175 aa  122  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0921  ferritin like protein 2  38.36 
 
 
165 aa  120  9.999999999999999e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.454183  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2124  Ferroxidase  38.61 
 
 
166 aa  120  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.959014  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0804  ferritin  41.03 
 
 
164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2437  ferritin  38.36 
 
 
181 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1624  ferritin  38.61 
 
 
169 aa  119  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1921  Ferroxidase  40.88 
 
 
175 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0331787  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4766  ferroxidase  35.43 
 
 
175 aa  119  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.266112  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2341  ferritin family protein  38.61 
 
 
169 aa  119  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.410916  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2438  ferroxidase  38.61 
 
 
169 aa  119  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001945  ferritin-like protein 2  36.88 
 
 
175 aa  118  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0141  ferritin  36.48 
 
 
175 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0308  ferritin  37.18 
 
 
162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.25083  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00534  ferritin  36.88 
 
 
175 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2055  Ferritin, Dps family protein  39.75 
 
 
180 aa  115  3e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0142  ferritin 1  36.88 
 
 
175 aa  114  8.999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30880  ferritin-like protein  37.89 
 
 
173 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>