More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1963 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1963  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 382 aa  772    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.503489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5634  extracellular solute-binding protein  27.35 
 
 		 376 aa  124  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3185  extracellular solute-binding protein family 3  29.91 
 
 		 386 aa  122  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0319469  normal  0.327167 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4470  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 360 aa  120  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.643517  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0989  ionotropic glutamate receptor  30.06 
 
 		 385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00799659  normal  0.390721 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2998  extracellular solute-binding protein  26.88 
 
 		 354 aa  110  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.593817  normal  0.519466 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4522  extracellular solute-binding protein  27.05 
 
 		 375 aa  106  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.45812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17521  GIC family ligand gated channel  27.14 
 
 		 333 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0766  ionotropic glutamate receptor  24.04 
 
 		 357 aa  98.6  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0534  extracellular solute-binding protein  28.01 
 
 		 378 aa  97.1  4e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000119937  normal  0.231064 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0243  extracellular solute-binding protein  27.73 
 
 		 352 aa  96.7  6e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.461233  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2108  Ion transport 2 domain protein  26.27 
 
 		 380 aa  94.4  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.64507  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4230  extracellular solute-binding protein  27.93 
 
 		 396 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.062377 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3401  extracellular solute-binding protein family 3  28.63 
 
 		 345 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288087 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3087  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 		 360 aa  80.1  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.332328 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2561  extracellular solute-binding protein  23.4 
 
 		 367 aa  70.1  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1093  extracellular solute-binding protein family 3  32.17 
 
 		 247 aa  65.5  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253807  normal  0.019092 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2141  extracellular solute-binding protein  38.89 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0343212 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1918  extracellular solute-binding protein family 3  37.8 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2979  extracellular solute-binding protein  33.67 
 
 		 265 aa  62.8  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1231  extracellular solute-binding protein  24.38 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.196544  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2855  extracellular solute-binding protein  39.02 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18770  extracellular solute-binding protein family 3  33.33 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06570  ABC amino acid transporter periplasmic ligand binding protein  22.46 
 
 		 363 aa  57.8  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1779  extracellular solute-binding protein  34.62 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3045  extracellular solute-binding protein  41.33 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.29813  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1495  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.73 
 
 		 247 aa  57  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000566563  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1600  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.73 
 
 		 247 aa  57  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1773  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.73 
 
 		 247 aa  57  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000148695  normal  0.114873 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1924  glutamine-binding periplasmic protein/glutamine transport system permease protein  25.41 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0906  extracellular solute-binding protein  24.64 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.663665  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1466  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein/permease protein  34.95 
 
 		 727 aa  56.2  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2367  extracellular solute-binding protein family 3  36.25 
 
 		 246 aa  55.8  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2450  extracellular solute-binding protein  37.36 
 
 		 271 aa  55.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3298  extracellular solute-binding protein  33.08 
 
 		 254 aa  55.8  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3397  extracellular solute-binding protein  35.37 
 
 		 245 aa  56.2  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0168  extracellular solute-binding protein  34.15 
 
 		 247 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2878  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.73 
 
 		 248 aa  55.1  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0116852  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1584  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.73 
 
 		 248 aa  55.1  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118123  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0438  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  36.36 
 
 		 480 aa  55.1  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.126368  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1538  extracellular solute-binding protein  36.26 
 
 		 292 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133709  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27710  amino acid-binding protein  38.46 
 
 		 304 aa  54.7  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.620875 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3441  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.02 
 
 		 250 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1961  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.78 
 
 		 250 aa  54.7  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4024  extracellular solute-binding protein  29.47 
 
 		 270 aa  54.3  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400278  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4284  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.02 
 
 		 250 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4082  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.02 
 
 		 250 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.314608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1593  extracellular solute-binding protein  36.26 
 
 		 271 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227678  normal  0.74753 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1137  extracellular solute-binding protein  36.26 
 
 		 271 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3053  extracellular solute-binding protein  35.37 
 
 		 244 aa  53.5  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000807518  normal  0.0316275 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  34.38 
 
 		 266 aa  53.9  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1617  extracellular solute-binding protein  36.26 
 
 		 271 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4703  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.6 
 
 		 492 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1044  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  35.37 
 
 		 244 aa  53.5  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  32.93 
 
 		 250 aa  53.5  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1487  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.62 
 
 		 250 aa  53.5  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2537  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.41 
 
 		 248 aa  53.5  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0919  extracellular solute-binding protein  35.37 
 
 		 244 aa  53.5  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1515  extracellular solute-binding protein  36.26 
 
 		 271 aa  53.5  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0413  homoserine kinase (HSK; HK)  35.53 
 
 		 256 aa  53.5  0.000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.862983  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3166  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 		 242 aa  53.5  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.190587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3158  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.62 
 
 		 250 aa  53.5  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0137955  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00778  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.41 
 
 		 248 aa  53.1  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2831  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  32.41 
 
 		 248 aa  53.1  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0546212  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0867  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.41 
 
 		 248 aa  53.1  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156347  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0835  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.41 
 
 		 248 aa  53.1  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000431676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00795  hypothetical protein  32.41 
 
 		 248 aa  53.1  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2832  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.41 
 
 		 248 aa  53.1  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.220182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3027  extracellular solute-binding protein  34.15 
 
 		 244 aa  53.1  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1818  extracellular solute-binding protein family 3  28.57 
 
 		 273 aa  53.1  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0079129  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0880  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.41 
 
 		 248 aa  53.1  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000245333  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0960  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.41 
 
 		 248 aa  53.1  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000163371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4762  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  35.48 
 
 		 271 aa  53.1  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1621  extracellular solute-binding protein  36.26 
 
 		 271 aa  52.8  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0810697  normal  0.181323 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2357  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.32 
 
 		 253 aa  53.1  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3319  lytic transglycosylase, catalytic  34.94 
 
 		 718 aa  53.1  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0894  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.71 
 
 		 248 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0866  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.71 
 
 		 248 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.717155  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3392  extracellular solute-binding protein  32.93 
 
 		 244 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0624048  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0553  hypothetical protein  33.73 
 
 		 244 aa  52.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0529  hypothetical protein  33.77 
 
 		 244 aa  52.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0957  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.71 
 
 		 248 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0849319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2051  extracellular solute-binding protein  36.26 
 
 		 271 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0325389  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0835  extracellular solute-binding protein  36.26 
 
 		 271 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1883  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  36.26 
 
 		 271 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1385  extracellular solute-binding protein  31.76 
 
 		 271 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00529871  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0326  polar amino acid ABC uptake transporter substrate binding protein  36.26 
 
 		 271 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.178009  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0925  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.71 
 
 		 248 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0376492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0986  extracellular solute-binding protein  32.93 
 
 		 244 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3272  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.62 
 
 		 250 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1344  extracellular solute-binding protein family 3  31.4 
 
 		 272 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.752805 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1670  extracellular solute-binding protein  36.26 
 
 		 271 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.720486  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1895  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  36.26 
 
 		 271 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.299924  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1479  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.07 
 
 		 247 aa  52.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1452  amino acid ABC transporter periplasmic protein  31.78 
 
 		 264 aa  52.4  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000020347  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0951  extracellular solute-binding protein  32.93 
 
 		 244 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2802  extracellular solute-binding protein  37.18 
 
 		 294 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.228556  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1124  extracellular solute-binding protein family 3  28.46 
 
 		 289 aa  52.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.901238  normal  0.221919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0882  extracellular solute-binding protein  35.37 
 
 		 244 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00121366  normal  0.225798 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0978  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.71 
 
 		 248 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0375425  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>