119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1904 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1904  OsmC family protein  100 
 
 
193 aa  387  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.576095  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0897  OsmC family protein  38.1 
 
 
145 aa  99  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669017  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1670  OsmC family protein  29.84 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0539264  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  28.46 
 
 
170 aa  66.2  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3793  OsmC family protein  30.17 
 
 
185 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.242728 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3413  OsmC family protein  29.51 
 
 
171 aa  62  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1919  OsmC family protein  44.26 
 
 
131 aa  62  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.148561  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3485  OsmC family protein  30.17 
 
 
185 aa  62  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6241  OsmC family protein  29.37 
 
 
182 aa  61.6  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0196837  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0441  OsmC family protein  24.78 
 
 
189 aa  60.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  24.44 
 
 
177 aa  61.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  30.77 
 
 
145 aa  58.9  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04790  OsmC family protein  25.71 
 
 
144 aa  57.4  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3867  OsmC family protein  28.7 
 
 
185 aa  57  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0319528 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1143  OsmC family protein  24.6 
 
 
142 aa  55.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000523467  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0969  OsmC family protein  25.42 
 
 
182 aa  55.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.298439 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2488  OsmC family protein  27.73 
 
 
172 aa  56.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0230337  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1071  OsmC family protein  24.6 
 
 
142 aa  55.8  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000601559  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6854  OsmC family protein  28.57 
 
 
186 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521419  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1075  OsmC family protein  24.6 
 
 
142 aa  55.8  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2325  OsmC family protein  27.27 
 
 
180 aa  55.8  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5418  hypothetical protein  29.73 
 
 
180 aa  54.7  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1865  OsmC family protein  27.12 
 
 
185 aa  54.7  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128326  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2488  hypothetical protein  22.52 
 
 
202 aa  54.3  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0039  OsmC-like protein  37.88 
 
 
179 aa  54.3  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2212  OsmC family protein  29 
 
 
159 aa  53.9  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4241  OsmC family protein  26.72 
 
 
202 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0586  OsmC family protein  26.92 
 
 
179 aa  54.3  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.128993  normal  0.0133234 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1026  OsmC family protein  25.42 
 
 
206 aa  54.3  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2794  OsmC family protein  24.39 
 
 
142 aa  53.5  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0623  hypothetical protein  31.25 
 
 
176 aa  52.8  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0005983  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3007  OsmC family protein  22.7 
 
 
146 aa  52.8  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2175  OsmC-like protein  30.14 
 
 
185 aa  52.4  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.416909  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  33.82 
 
 
405 aa  52.4  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4264  hypothetical protein  25.21 
 
 
184 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0304  hypothetical protein  31.18 
 
 
190 aa  51.6  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0049  OsmC family protein  38.18 
 
 
406 aa  51.2  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2557  OsmC family protein  34.21 
 
 
138 aa  51.2  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000559572  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0921  OsmC family protein  27.27 
 
 
136 aa  51.2  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2254  OsmC-like protein  24.79 
 
 
199 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0977605  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  26.32 
 
 
147 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1978  OsmC family protein  21.93 
 
 
186 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0541  OsmC family protein  32.39 
 
 
151 aa  50.8  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.489752  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1613  OsmC family protein  44 
 
 
133 aa  50.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2612  OsmC family protein  27.43 
 
 
208 aa  50.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4617  OsmC family protein  46 
 
 
133 aa  50.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.327663 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4668  OsmC family protein  29.13 
 
 
183 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.35857  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2836  OsmC family protein  32.61 
 
 
177 aa  50.4  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5247  OsmC family protein  23.76 
 
 
187 aa  50.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.402263 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1151  OsmC family protein  31.63 
 
 
183 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.824502  normal  0.359642 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1310  OsmC family protein  29.92 
 
 
183 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.47097  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3495  hypothetical protein  23.81 
 
 
142 aa  49.3  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0706  redox protein, regulator of disulfide bond formation  23.57 
 
 
136 aa  49.3  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000956908  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6160  OsmC family protein  20.49 
 
 
182 aa  48.9  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76501  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5957  OsmC family protein  24.8 
 
 
190 aa  49.3  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6453  OsmC family protein  20.49 
 
 
182 aa  48.5  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16719  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1892  OsmC-like protein  27.72 
 
 
148 aa  48.5  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0395  OsmC family protein  35.38 
 
 
138 aa  48.5  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1673  OsmC-like protein  36.84 
 
 
409 aa  48.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0235  OsmC family protein  27.27 
 
 
147 aa  48.1  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0443  OsmC-like protein  34.29 
 
 
176 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4895  OsmC-like protein  23.48 
 
 
184 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2348  OsmC family protein  29.37 
 
 
163 aa  47.4  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.684792  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3268  OsmC family protein  23.48 
 
 
184 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  35.19 
 
 
408 aa  47.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2788  hypothetical protein  21.93 
 
 
186 aa  47  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6912  OsmC family protein  23.48 
 
 
184 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1058  OsmC family protein  22.92 
 
 
200 aa  47  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.333829 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2100  OsmC family protein  21.74 
 
 
185 aa  46.6  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3965  OsmC family protein  23.58 
 
 
132 aa  45.8  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4791  OsmC family protein  27.17 
 
 
187 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361207  normal  0.435509 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1923  OsmC-like protein  29.82 
 
 
127 aa  45.1  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0361  OsmC family protein  33.78 
 
 
140 aa  45.1  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4432  OsmC family protein  24.47 
 
 
184 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670087  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3421  OsmC family protein  24.47 
 
 
184 aa  45.1  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320541  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4465  OsmC-like protein  41.18 
 
 
248 aa  44.7  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1270  hypothetical protein  26.95 
 
 
144 aa  44.3  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00225413  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1727  hypothetical protein  25.17 
 
 
138 aa  43.9  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7506  hypothetical protein  26.67 
 
 
188 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101926  normal  0.551931 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4851  OsmC-like protein  28.33 
 
 
187 aa  44.3  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.137347 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1917  OsmC family protein  33.33 
 
 
130 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591016  normal  0.655521 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6635  OsmC family protein  34.55 
 
 
411 aa  43.5  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  hitchhiker  0.00000360166 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1267  OsmC family protein  33.33 
 
 
130 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13840  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  21.49 
 
 
145 aa  43.9  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0982  OsmC family protein  26.23 
 
 
127 aa  43.5  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1301  OsmC family protein  33.33 
 
 
130 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0499071 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3081  OsmC-like protein  30.61 
 
 
134 aa  42.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344842  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0908  OsmC-like protein  33.33 
 
 
130 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1390  OsmC family protein  33.33 
 
 
130 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51882  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1368  OsmC family protein  33.33 
 
 
130 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0210899 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1644  OsmC family protein  19.64 
 
 
193 aa  42.4  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2280  OsmC-like protein  31.58 
 
 
406 aa  42.4  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1777  OsmC-like protein  34.55 
 
 
410 aa  42.4  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4072  hypothetical protein  28.79 
 
 
134 aa  42  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0853904  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2279  OsmC family protein  32.76 
 
 
155 aa  42  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0377998  normal  0.182149 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0351  OsmC family protein  26.09 
 
 
134 aa  42  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.999657  normal  0.881663 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1403  OsmC family protein  22.33 
 
 
132 aa  42  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655694  normal  0.111545 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1082  OsmC-like family protein  32.73 
 
 
141 aa  42  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0521945  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1436  OsmC family protein  36.07 
 
 
134 aa  42  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4533  OsmC-like protein  31.48 
 
 
130 aa  41.6  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.257374 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>