53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1893 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1893  Phage-related protein tail component-like  100 
 
 
1644 aa  3372    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0293426 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2762  hypothetical protein  26.97 
 
 
1159 aa  99.4  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.619674 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2873  hypothetical protein  26.64 
 
 
1159 aa  98.6  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00489128 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0708  host specificity protein  26.32 
 
 
1120 aa  98.6  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.024039 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3120  hypothetical protein  26.64 
 
 
1157 aa  98.6  9e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0703076 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3188  hypothetical protein  26.97 
 
 
1158 aa  98.2  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000183265 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2168  host specificity protein  26.64 
 
 
522 aa  97.8  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.524267  normal  0.854577 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1878  hypothetical protein  26.97 
 
 
1158 aa  98.2  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.1744 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1203  fibronectin type III domain-containing protein  25.06 
 
 
1159 aa  97.4  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.272473  normal  0.0174889 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2796  host specificity protein  25.99 
 
 
1120 aa  97.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1201  hypothetical protein  26.64 
 
 
1157 aa  97.1  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2109  hypothetical protein  25.06 
 
 
1159 aa  95.9  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000420238  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1638  hypothetical protein  24.81 
 
 
1132 aa  95.5  8e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.498718 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0913  hypothetical protein  24.81 
 
 
1137 aa  94.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10054  tail:host specificity protein  24.81 
 
 
1132 aa  95.1  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00750  hypothetical protein  24.81 
 
 
1132 aa  95.1  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1158  host specificity protein J  24.21 
 
 
1116 aa  94  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.410108  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1474  fibronectin type III domain protein  24.81 
 
 
1012 aa  94.4  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1086  host specificity protein J  23.95 
 
 
1116 aa  93.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0880  host specificity protein  26.32 
 
 
1157 aa  93.2  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1634  hypothetical protein  25.69 
 
 
1133 aa  91.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154038  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1639  fibronectin type III domain-containing protein  31.89 
 
 
881 aa  84  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.994447  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3882  hypothetical protein  23.34 
 
 
1100 aa  82.4  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.673506  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3527  Fibronectin type III domain protein  23.74 
 
 
3521 aa  81.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1062  host specificity protein J  24.13 
 
 
1101 aa  81.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3882  Fibronectin type III domain protein  22.78 
 
 
3238 aa  80.5  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1694  hypothetical protein  23.35 
 
 
1092 aa  79.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2167  hypothetical protein  29.55 
 
 
837 aa  79.7  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.981242  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5750  Fibronectin type III domain protein  22.78 
 
 
3286 aa  79  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4057  Fibronectin type III domain protein  22.82 
 
 
2900 aa  78.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5047  Fibronectin type III domain protein  22.54 
 
 
2899 aa  77.8  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2685  Phage-related protein tail component-like protein  31.29 
 
 
1171 aa  77.8  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0663  gp29  21.82 
 
 
1059 aa  77  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000117932 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1698  bacteriophage protein  23.41 
 
 
1051 aa  73.6  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.0762686 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1639  Phage-related protein tail component-like protein  24.84 
 
 
918 aa  73.2  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6657  hypothetical protein  26.84 
 
 
782 aa  72.8  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.121029  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2576  Protein of unknown function DUF1983  21.96 
 
 
1816 aa  72.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.191174 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2940  prophage LambdaSo, host specificity protein J, putative  22.84 
 
 
1341 aa  72.4  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3382  Phage-related protein tail component-like protein  24.09 
 
 
1103 aa  68.9  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000619193 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7024  Fibronectin type III domain protein  23.13 
 
 
3006 aa  67.8  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6222  Fibronectin type III domain protein  22.53 
 
 
2140 aa  67.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0094  fibronectin type III domain-containing protein  20.6 
 
 
1543 aa  64.3  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000020422 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0785  carbohydrate-binding family V/XII protein  21.18 
 
 
1221 aa  62.4  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08300  putative phage-related protein, tail component  21.18 
 
 
1219 aa  62  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0627181  hitchhiker  0.0000838912 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3721  hypothetical protein  25.76 
 
 
774 aa  59.7  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.492236  normal  0.337138 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2426  type III fibronectin  22.57 
 
 
1188 aa  57.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.506749  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2374  fibronectin type III domain-containing protein  22.15 
 
 
1067 aa  57  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.213672  normal  0.639425 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2772  fibronectin, type III  21.53 
 
 
1194 aa  55.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00979345 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2219  fibronectin, type III domain-containing protein  21.43 
 
 
1061 aa  54.7  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3498  Phage-related protein tail component-like protein  22.03 
 
 
960 aa  52  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0443  putative prophage LambdaSo, host specificity protein J  19.03 
 
 
1057 aa  50.4  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3534  hypothetical protein  27.68 
 
 
1438 aa  48.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3927  hypothetical protein  21.68 
 
 
2007 aa  45.4  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.202078  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>