131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1852 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1852  ThiJ/PfpI domain-containing protein  100 
 
 
312 aa  644    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0384  ThiJ/PfpI domain protein  66.99 
 
 
308 aa  427  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00197683  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1929  ThiJ/PfpI domain protein  58.39 
 
 
527 aa  349  4e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1905  ThiJ/PfpI domain protein  58.39 
 
 
521 aa  349  4e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0357  ThiJ/PfpI domain-containing protein  57.1 
 
 
500 aa  338  5e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2868  ThiJ/PfpI domain protein  51.97 
 
 
273 aa  287  1e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.653619  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4703  ThiJ/PfpI domain protein  48.53 
 
 
288 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0819  hypothetical protein  48.38 
 
 
288 aa  280  2e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0139271  unclonable  0.00000805455 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0828  hypothetical protein  26.28 
 
 
254 aa  85.1  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.775057  unclonable  0.0000112363 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2725  ThiJ/PfpI domain protein  25.7 
 
 
228 aa  63.9  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.693547 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1929  ThiJ/PfpI domain protein  26.69 
 
 
226 aa  63.2  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1174  ThiJ/PfpI domain protein  26.29 
 
 
227 aa  61.2  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1737  ThiJ/PfpI family protein  24.88 
 
 
228 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0276901  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0774  ThiJ/PfpI domain protein  23.08 
 
 
254 aa  57.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.561024  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1312  ThiJ/PfpI  27.18 
 
 
227 aa  57  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3700  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.41 
 
 
228 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2247  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.36 
 
 
227 aa  56.2  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1370  ThiJ/PfpI  25.82 
 
 
229 aa  56.2  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0958  ThiJ/PfpI domain protein  21.92 
 
 
225 aa  55.5  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01950  conserved hypothetical protein  31.18 
 
 
233 aa  55.1  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1700  DJ-1/PfpI family protein  23.2 
 
 
227 aa  55.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.600879  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3240  ThiJ/PfpI domain protein  26.76 
 
 
233 aa  55.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4178  ThiJ/PfpI domain-containing protein  23.94 
 
 
228 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0933  ThiJ/PfpI family protein  23.61 
 
 
229 aa  54.7  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1380  ThiJ/PfpI domain protein  22.61 
 
 
257 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1020  ThiJ/PfpI domain protein  26.76 
 
 
226 aa  54.7  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.276045  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1353  ThiJ/PfpI family protein  24.37 
 
 
225 aa  54.3  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4210  ThiJ/PfpI domain protein  23.86 
 
 
225 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.414893 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0683  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.54 
 
 
229 aa  53.5  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1386  ThiJ/PfpI  25.13 
 
 
226 aa  53.1  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.694621  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2067  ThiJ/PfpI domain protein  25.77 
 
 
261 aa  53.1  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06796  ThiJ/PfpI family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G01430)  32.32 
 
 
237 aa  53.1  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0364048 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0019  ThiJ/PfpI  25.58 
 
 
230 aa  53.1  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1710  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.44 
 
 
231 aa  53.1  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605014 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0780  ThiJ/PfpI domain protein  25.6 
 
 
250 aa  53.1  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0630  DJ-1/PfpI family protein  25.6 
 
 
250 aa  53.1  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2163  ThiJ/PfpI  27.94 
 
 
251 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.843992  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1011  ThiJ/PfpI  24.87 
 
 
225 aa  52.8  0.000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl402  putative PFPI-like cystiene protease  32.35 
 
 
226 aa  52.4  0.000009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3911  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.53 
 
 
224 aa  52.4  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0266  ThiJ/PfpI domain protein  22.12 
 
 
230 aa  52.4  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3480  ThiJ/PfpI  35.71 
 
 
241 aa  52  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.782484 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4797  ThiJ/PfpI domain protein  22.62 
 
 
223 aa  52.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13301  hitchhiker  0.0019745 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4361  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.62 
 
 
228 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0376  ThiJ/PfpI domain-containing protein  22.58 
 
 
230 aa  51.6  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6825  ThiJ/PfpI domain protein  26.86 
 
 
233 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.397498 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  23.5 
 
 
230 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0791  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.77 
 
 
229 aa  51.6  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.196046 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  22.58 
 
 
232 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0262  ThiJ/PfpI domain-containing protein  22.58 
 
 
230 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3926  ThiJ/PfpI domain-containing protein  22.05 
 
 
225 aa  50.8  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4323  ThiJ/PfpI domain-containing protein  23.94 
 
 
228 aa  50.8  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.224439 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6748  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.15 
 
 
230 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4593  thiJ/pfpI family protein  35.21 
 
 
220 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4578  thiJ/pfpI family protein  35.21 
 
 
220 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3319  ThiJ/PfpI  23.5 
 
 
227 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.262803  normal  0.267473 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0285  ThiJ/PfpI domain-containing protein  21.54 
 
 
225 aa  50.4  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000246139 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4627  thiJ/pfpI family protein  35.21 
 
 
220 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3350  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25 
 
 
231 aa  50.1  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.097714  normal  0.411486 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0431  ThiJ/PfpI domain protein  24.62 
 
 
227 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2491  ThiJ/PfpI family protein  23.94 
 
 
225 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2975  ThiJ/PfpI domain protein  23.61 
 
 
230 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.420811 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3144  ThiJ/PfpI domain protein  23.61 
 
 
230 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0854  ThiJ/PfpI domain protein  26.54 
 
 
224 aa  49.3  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3245  ThiJ/PfpI domain-containing protein  23.47 
 
 
228 aa  49.3  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.433904  normal  0.585476 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10123  ThiJ/PfpI  24.62 
 
 
267 aa  49.3  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882112  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22600  putative intracellular protease/amidase  26.63 
 
 
232 aa  49.3  0.00008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5801  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.13 
 
 
227 aa  49.3  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.716355  normal  0.558329 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3509  DJ-1/PfpI family protein  27.39 
 
 
270 aa  48.9  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.962862  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0592  ThiJ/PfpI domain protein  38.27 
 
 
228 aa  48.5  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0349  ThiJ/PfpI domain protein  25.38 
 
 
225 aa  48.9  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00734  DJ-1/PfpI family protein  25.79 
 
 
223 aa  48.9  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4094  ThiJ/PfpI  23 
 
 
228 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19903  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4272  ThiJ/PfpI domain-containing protein  23 
 
 
228 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1713  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.19 
 
 
231 aa  48.1  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.45636 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4224  thiJ/PfpI family protein  33.8 
 
 
220 aa  47.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1406  DJ-1/PfpI family protein  23.86 
 
 
226 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0819  ThiJ/PfpI domain protein  33.75 
 
 
221 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2295  peptidase  23.86 
 
 
226 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2230  ThiJ/PfpI  20.7 
 
 
225 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.346275  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0524  DJ-1/PfpI family protein  23.86 
 
 
226 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0124  DJ-1/PfpI family protein  23.86 
 
 
226 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1062  DJ-1/PfpI family protein  23.86 
 
 
226 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0976  DJ-1/PfpI family protein  23.86 
 
 
226 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1490  DJ-1/PfpI family protein  23.86 
 
 
226 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4383  thiJ/pfpI family protein  33.8 
 
 
220 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4722  thiJ/pfpI family protein  33.8 
 
 
220 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.477028  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4110  ThiJ/PfpI domain-containing protein  23.61 
 
 
227 aa  47  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2068  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.15 
 
 
228 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0627  ThiJ/PfpI domain protein  33.78 
 
 
223 aa  46.6  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3438  intracellular protease/amidase-like  32.43 
 
 
366 aa  46.6  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000319638 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5542  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.1 
 
 
224 aa  46.6  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.126229 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0627  thiJ/pfpI family protein  32.39 
 
 
219 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2815  PfpI family intracellular peptidase  31.73 
 
 
186 aa  46.6  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2898  PfpI family intracellular peptidase  31.73 
 
 
186 aa  46.6  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4608  thiJ/pfpI family protein  33.8 
 
 
220 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2185  ThiJ/PfpI domain protein  24.62 
 
 
246 aa  46.2  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1094  ThiJ/PfpI domain-containing protein  23.08 
 
 
225 aa  46.2  0.0007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.226669  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02417  ThiJ/PfpI family protein  21.13 
 
 
232 aa  46.2  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.847717  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1724  ThiJ/PfpI  35.71 
 
 
225 aa  45.8  0.0009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>