More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1780 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  100 
 
 
245 aa  499  1e-140  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0302  uridylate kinase  65.4 
 
 
251 aa  324  1e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0280  uridylate kinase  65.4 
 
 
251 aa  324  1e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0291  uridylate kinase  65.4 
 
 
251 aa  324  1e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  62.92 
 
 
241 aa  322  4e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0304  uridylate kinase  64.96 
 
 
249 aa  320  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336367  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  63.09 
 
 
239 aa  320  9.999999999999999e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23620  uridylate kinase  64.94 
 
 
238 aa  320  9.999999999999999e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  64.66 
 
 
240 aa  319  1.9999999999999998e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3779  uridylate kinase  63.49 
 
 
244 aa  320  1.9999999999999998e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591518 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  63.4 
 
 
239 aa  319  3e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  63.4 
 
 
239 aa  319  3e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  63.14 
 
 
242 aa  316  2e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4636  uridylate kinase  62.71 
 
 
242 aa  314  7e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3731  uridylate kinase  61.97 
 
 
239 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3707  uridylate kinase  61.28 
 
 
240 aa  311  5.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0190689  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0575  uridylate kinase  62.93 
 
 
236 aa  311  7.999999999999999e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000374821  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2803  uridylate kinase  61.28 
 
 
245 aa  309  2e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00682301  normal  0.644518 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0066  uridylate kinase  63.56 
 
 
242 aa  309  2e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.815822  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2559  uridylate kinase  62.71 
 
 
240 aa  308  5e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3547  uridylate kinase  62.71 
 
 
240 aa  308  6.999999999999999e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1588  uridylate kinase  61.11 
 
 
250 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10521  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0506  uridylate kinase  62.71 
 
 
253 aa  306  2.0000000000000002e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  62.45 
 
 
237 aa  306  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1487  uridylate kinase  60.43 
 
 
240 aa  305  4.0000000000000004e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0028883 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1446  uridylate kinase  61.37 
 
 
241 aa  305  4.0000000000000004e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1162  uridylate kinase  61.37 
 
 
241 aa  305  4.0000000000000004e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07670  uridylate kinase  60.34 
 
 
239 aa  305  4.0000000000000004e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000164144  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2754  uridylate kinase  60.43 
 
 
240 aa  305  5.0000000000000004e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0522  uridylate kinase  60.61 
 
 
234 aa  304  9.000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05481  uridylate kinase  61.04 
 
 
234 aa  304  9.000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.35761  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1744  uridylate kinase  60.52 
 
 
238 aa  303  1.0000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1897  uridylate kinase  60.34 
 
 
235 aa  304  1.0000000000000001e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12781  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2697  uridylate kinase  61.86 
 
 
240 aa  303  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1648  uridylate kinase  62.45 
 
 
237 aa  303  2.0000000000000002e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1421  uridylate kinase  62.24 
 
 
244 aa  302  3.0000000000000004e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0926362  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1528  uridylate kinase  60.09 
 
 
238 aa  302  3.0000000000000004e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286053  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05781  uridylate kinase  60.17 
 
 
234 aa  302  4.0000000000000003e-81  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.155099  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0884  hypothetical protein  63.83 
 
 
238 aa  301  8.000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1464  uridylate kinase  61.41 
 
 
246 aa  300  9e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05861  uridylate kinase  60.61 
 
 
234 aa  301  9e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1004  uridylate kinase  60 
 
 
235 aa  300  1e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000758242  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0884  uridylate kinase  57.45 
 
 
237 aa  300  1e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2037  uridylate kinase  60.34 
 
 
237 aa  299  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865842  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1854  uridylate kinase  60.7 
 
 
237 aa  300  2e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05791  uridylate kinase  60.7 
 
 
237 aa  300  2e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6060  uridylate kinase  60.34 
 
 
237 aa  299  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1259  uridylate kinase  60.34 
 
 
237 aa  299  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.370411  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2017  uridylate kinase  60.34 
 
 
237 aa  299  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1143  uridylate kinase  57.98 
 
 
240 aa  298  4e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000986718  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0707  uridylate kinase  60.61 
 
 
274 aa  298  5e-80  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000695592  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2378  uridylate kinase  59.07 
 
 
239 aa  298  5e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3194  uridylate kinase  58.9 
 
 
241 aa  298  5e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0115  uridylate kinase  60.17 
 
 
235 aa  298  5e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2046  uridylate kinase  58.9 
 
 
239 aa  298  5e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1161  uridylate kinase  60.43 
 
 
242 aa  298  5e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5327  uridylate kinase  59.91 
 
 
237 aa  298  6e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0388616  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0580  uridylate kinase  59.09 
 
 
255 aa  298  7e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1825  uridylate kinase  57.98 
 
 
240 aa  298  7e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.537862  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05241  uridylate kinase  59.31 
 
 
237 aa  298  8e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.87702  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2035  uridylate kinase  58.4 
 
 
240 aa  297  9e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1495  uridylate kinase  59.07 
 
 
245 aa  297  1e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0659  uridylate kinase  58.12 
 
 
238 aa  297  1e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1280  uridylate kinase  58.55 
 
 
236 aa  296  1e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.23079 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0574  uridylate kinase  61.21 
 
 
235 aa  297  1e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1861  uridylate kinase  58.58 
 
 
242 aa  297  1e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57108  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1382  uridylate kinase  60.43 
 
 
263 aa  297  1e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.1666  normal  0.0472283 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1344  uridylate kinase  58.55 
 
 
236 aa  296  1e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0291388  normal  0.514352 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  58.87 
 
 
240 aa  296  2e-79  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1760  uridylate kinase  59.23 
 
 
236 aa  296  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0656922 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1919  uridylate kinase  59.91 
 
 
237 aa  296  3e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.302064 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0078  uridylate kinase  57.76 
 
 
236 aa  296  3e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1943  uridylate kinase  59.66 
 
 
239 aa  295  3e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.782338 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1879  uridylate kinase  58.55 
 
 
236 aa  296  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.422558  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0405  uridylate kinase  58.44 
 
 
235 aa  295  3e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.899064  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1437  uridylate kinase  58.55 
 
 
258 aa  296  3e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.439884  hitchhiker  0.000435544 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2050  uridylate kinase  59.91 
 
 
237 aa  296  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1406  uridylate kinase  58.12 
 
 
236 aa  295  4e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1225  uridylate kinase  57.14 
 
 
240 aa  295  4e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0229654  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2583  uridylate kinase  57.14 
 
 
240 aa  295  4e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.284597  normal  0.0617202 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2054  uridylate kinase  59.48 
 
 
286 aa  295  5e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1326  uridylate kinase  59.48 
 
 
237 aa  295  5e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.280205  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1553  uridylate kinase  59.48 
 
 
237 aa  295  5e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2491  uridylate kinase  59.48 
 
 
237 aa  295  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4946  uridylate kinase  57.14 
 
 
240 aa  295  5e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.723957 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2581  uridylate kinase  59.48 
 
 
237 aa  295  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2029  uridylate kinase  59.48 
 
 
237 aa  295  5e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3257  uridylate kinase  59.48 
 
 
237 aa  295  5e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2435  uridylate kinase  59.48 
 
 
237 aa  295  5e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0771842  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1371  uridylate kinase  58.12 
 
 
244 aa  295  6e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184523  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2693  uridylate kinase  59.83 
 
 
236 aa  295  6e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.506156  normal  0.870267 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1958  uridylate kinase  58.8 
 
 
241 aa  294  7e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1684  uridylate kinase  59.91 
 
 
237 aa  294  9e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.193496 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1336  uridylate kinase  59.91 
 
 
237 aa  294  9e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399857  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2453  uridylate kinase  59.91 
 
 
237 aa  293  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176053  hitchhiker  0.00168891 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0476  uridylate kinase  59.23 
 
 
245 aa  293  2e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0113998  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1991  uridylate kinase  57.56 
 
 
240 aa  293  2e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0462  uridylate kinase  57.45 
 
 
237 aa  293  2e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531009  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0803  uridylate kinase  57.26 
 
 
241 aa  293  2e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000782599  hitchhiker  0.00000000000212773 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2008  uridylate kinase  58.44 
 
 
236 aa  293  2e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>