184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1749 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1749  BioY protein  100 
 
 
182 aa  354  2.9999999999999997e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.969315  normal  0.0325978 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  42.26 
 
 
187 aa  144  5e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  43.6 
 
 
187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  41.72 
 
 
184 aa  127  6e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1318  BioY protein  46.54 
 
 
189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324631 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  38.98 
 
 
178 aa  121  5e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  39.88 
 
 
184 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0476  BioY protein  46.15 
 
 
182 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.014299 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1651  BioY family protein  38.02 
 
 
203 aa  115  1.9999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000463296  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  43.9 
 
 
192 aa  116  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  40 
 
 
179 aa  114  6e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  45.21 
 
 
197 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1014  BioY protein  40.91 
 
 
169 aa  112  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.842683  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2213  BioY protein  38.37 
 
 
182 aa  111  7.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012911  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  40.78 
 
 
187 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2544  BioY protein  37.08 
 
 
192 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269732  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  39.66 
 
 
187 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0996  BioY protein  42.94 
 
 
191 aa  107  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1788  BioY protein  36.69 
 
 
169 aa  106  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3685  BioY protein  36.9 
 
 
189 aa  106  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1719  BioY family protein  41.18 
 
 
191 aa  104  9e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1662  BioY family protein  41.18 
 
 
191 aa  104  9e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  31.84 
 
 
182 aa  104  9e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000940294  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3231  BioY protein  33.33 
 
 
184 aa  103  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000266759  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0539  BioY protein  41.57 
 
 
193 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.252714  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0539  BioY protein  40.96 
 
 
203 aa  102  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2725  BioY protein  40 
 
 
195 aa  101  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  34.94 
 
 
169 aa  101  6e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1953  hypothetical protein  34.86 
 
 
189 aa  101  6e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.327178  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  34.94 
 
 
169 aa  101  6e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2954  BioY family protein  41.25 
 
 
180 aa  101  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.716157  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3444  BioY protein  41.52 
 
 
181 aa  100  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3648  bioY family protein  35.67 
 
 
191 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0243  BioY protein  42.86 
 
 
190 aa  99  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00131705  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  40 
 
 
199 aa  99  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1198  BioY protein  38.31 
 
 
191 aa  98.6  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  40.94 
 
 
197 aa  97.8  8e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0571  BioY protein  41.21 
 
 
193 aa  97.1  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1580  bioY family protein  35.09 
 
 
191 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000070307  normal  0.0383655 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0132  hypothetical protein  31.95 
 
 
176 aa  96.3  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0568  BioY protein  40.96 
 
 
193 aa  96.3  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.936427  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3315  BioY protein  35.06 
 
 
191 aa  95.9  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000166456  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0463  BioY family protein  37.93 
 
 
179 aa  95.1  4e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0516  hypothetical protein  38.55 
 
 
180 aa  95.1  5e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0355774  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2134  putative BioY protein  38.82 
 
 
197 aa  95.1  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  38.51 
 
 
189 aa  94.7  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1597  hypothetical protein  34.73 
 
 
177 aa  92.4  3e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839094  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0230  BioY protein  38.95 
 
 
204 aa  92  4e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.949273  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  35.94 
 
 
210 aa  92  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0061  BioY protein  32.04 
 
 
182 aa  92  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000303529  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1004  biotin synthesis BioY protein  39.05 
 
 
187 aa  92  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2735  BioY protein  36.94 
 
 
195 aa  91.3  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3107  Na+/H+ antiporter  39.76 
 
 
192 aa  91.7  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3097  BioY protein  35.16 
 
 
187 aa  91.3  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2307  BioY protein  34.91 
 
 
184 aa  91.3  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.366824  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2349  BioY protein  34.91 
 
 
184 aa  91.3  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1588  BioY protein  35.06 
 
 
167 aa  90.5  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000111141  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1068  BioY protein  39.33 
 
 
192 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4332  BioY protein  37.29 
 
 
188 aa  89  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000491401  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1647  BioY protein  36.55 
 
 
169 aa  89.4  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4131  BioY protein  42.42 
 
 
189 aa  88.6  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1864  BioY family protein  33.14 
 
 
182 aa  88.2  6e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0018  BioY protein  37.58 
 
 
205 aa  88.2  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3005  BioY protein  38.24 
 
 
200 aa  87.8  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.312874  normal  0.884214 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3287  BioY protein  40.25 
 
 
192 aa  87.8  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508525  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4638  BioY protein  41.22 
 
 
203 aa  87.8  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1515  bioY family protein  38.27 
 
 
184 aa  87.4  9e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00248245  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02210  hypothetical protein  36.41 
 
 
194 aa  87.8  9e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0169  BioY protein  38.82 
 
 
187 aa  86.3  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000989963  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2320  BioY protein  36.05 
 
 
180 aa  86.3  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4523  BioY protein  34.39 
 
 
206 aa  86.7  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0610  BioY protein  33.9 
 
 
174 aa  86.3  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000775885  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3688  BioY protein  38.51 
 
 
190 aa  86.3  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.983357  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2889  BioY protein  35.29 
 
 
197 aa  85.9  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0659  BioY protein  33.97 
 
 
171 aa  85.5  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.728186  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4329  BioY protein  40.67 
 
 
212 aa  85.9  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.373185 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0575  BioY protein  40.99 
 
 
185 aa  84.7  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0991  BioY protein  38.75 
 
 
199 aa  84.3  8e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3659  BioY protein  35.06 
 
 
179 aa  82.8  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07160  hypothetical protein  38.12 
 
 
205 aa  83.2  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1671  BioY protein  36.36 
 
 
207 aa  82.8  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000998664 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4601  BioY protein  37.42 
 
 
197 aa  82.8  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.440698  normal  0.800249 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3737  bioY family protein  37.36 
 
 
191 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.776545  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8405  BioY family protein  43.62 
 
 
189 aa  83.2  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0398  BioY family protein  32.73 
 
 
179 aa  81.6  0.000000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000949175  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1159  BioY protein  33.33 
 
 
231 aa  81.6  0.000000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.934928  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_002978  WD1206  bioY family protein  36.48 
 
 
175 aa  80.9  0.000000000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0357  hypothetical protein  34.42 
 
 
182 aa  80.9  0.000000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02230  hypothetical protein  36.47 
 
 
188 aa  80.9  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1123  BioY protein  36.07 
 
 
197 aa  79.7  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.432616  normal  0.483731 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0233  BioY protein  34.32 
 
 
197 aa  79.7  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2875  BioY protein  36.3 
 
 
202 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000912957  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3528  BioY protein  30.34 
 
 
198 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3020  BioY protein  37.3 
 
 
201 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0501  BioY protein  37.87 
 
 
187 aa  79.3  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0382459  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0886  BioY protein  33.79 
 
 
235 aa  79  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.452064  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3331  bioY family protein  34.5 
 
 
191 aa  78.6  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000423922  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2901  BioY protein  48.39 
 
 
208 aa  78.6  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000326686  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3640  bioY family protein  34.5 
 
 
191 aa  78.6  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0498  BioY protein  34.44 
 
 
193 aa  78.6  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.583343 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>