27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1746 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1746  hypothetical protein  100 
 
 		 614 aa  1266    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000631337  hitchhiker  0.00120069 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0012  integrin-like repeat-containing protein  28.6 
 
 		 565 aa  200  5e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257714  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0311  hypothetical protein  27.08 
 
 		 535 aa  186  8e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000410606  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2025  hypothetical protein  27.34 
 
 		 554 aa  184  6e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1882  hypothetical protein  26.5 
 
 		 552 aa  178  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785906 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0197  hypothetical protein  26.29 
 
 		 555 aa  169  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0121  hypothetical protein  25.18 
 
 		 558 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2324  FG-GAP repeat protein  25.76 
 
 		 561 aa  139  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000100122  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3256  hypothetical protein  23.23 
 
 		 510 aa  88.2  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000373547  hitchhiker  9.15864e-19 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0567  hypothetical protein  22.77 
 
 		 476 aa  87  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.15788e-22 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3306  hypothetical protein  20.58 
 
 		 505 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00244316  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  35.34 
 
 		 888 aa  79  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0554  hypothetical protein  23.19 
 
 		 476 aa  78.6  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000494552  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0660  hypothetical protein  21.67 
 
 		 492 aa  77  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00298688  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3253  hypothetical protein  21.32 
 
 		 510 aa  71.6  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000436664  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0939  FG-GAP repeat protein  24.06 
 
 		 568 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.659758  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1368  OMP85 family outer membrane protein  33.61 
 
 		 893 aa  67.4  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2185  hypothetical protein  24.9 
 
 		 498 aa  65.9  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000017001  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0520  hypothetical protein  19.3 
 
 		 505 aa  63.5  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000613286  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2996  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.14 
 
 		 895 aa  58.2  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3381  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  32.31 
 
 		 895 aa  55.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.59 
 
 		 892 aa  55.5  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0891  surface antigen (D15)  29.1 
 
 		 896 aa  55.5  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2475  hypothetical protein  24.62 
 
 		 312 aa  52.8  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000341463  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0611  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.16 
 
 		 920 aa  50.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.310998  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0323  TPR repeat-containing protein  27.89 
 
 		 212 aa  46.6  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00135307  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1310  hypothetical protein  19.9 
 
 		 376 aa  46.2  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>