More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1741 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1741  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 1162 aa  2323    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.616964  hitchhiker  0.00243499 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1315  ATP-dependent nuclease subunit A  31.19 
 
 		 1110 aa  333  8e-90  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1375  UvrD/REP helicase family protein  31.19 
 
 		 1110 aa  333  1e-89  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.134048  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1708  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit  30.15 
 
 		 1118 aa  314  6.999999999999999e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0973  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  32.29 
 
 		 1155 aa  310  9e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117254 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1975  UvrD/REP helicase  32.62 
 
 		 1132 aa  310  2.0000000000000002e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.109081  normal  0.151355 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0988  UvrD/REP helicase  30.2 
 
 		 1146 aa  304  6.000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.181635  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1776  hypothetical protein  30.95 
 
 		 1076 aa  293  2e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1775  hypothetical protein  30.65 
 
 		 1076 aa  292  3e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0723  UvrD/REP helicase  28.63 
 
 		 1196 aa  291  4e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3622  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  31.1 
 
 		 1135 aa  277  8e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.750566 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0468  UvrD/REP helicase  31.06 
 
 		 1134 aa  265  3e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1751  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  32.27 
 
 		 1129 aa  262  3e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.910924 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2005  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  26.07 
 
 		 1155 aa  261  8e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1697  UvrD/REP helicase  29.66 
 
 		 1182 aa  256  2.0000000000000002e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1498  UvrD/REP helicase  28.49 
 
 		 1080 aa  208  6e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0202  UvrD/REP helicase  26.85 
 
 		 1159 aa  203  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0629  UvrD/REP helicase  26.88 
 
 		 1161 aa  195  4e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.590503 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2124  UvrD/REP helicase  27.58 
 
 		 1147 aa  193  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0090  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  27.21 
 
 		 1156 aa  192  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195606  normal  0.386807 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0058  UvrD/REP helicase  26.54 
 
 		 1162 aa  190  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.106754  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0050  UvrD/REP helicase  26.76 
 
 		 1202 aa  189  3e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.253682 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0387  UvrD/REP helicase  27.89 
 
 		 1164 aa  185  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0077  double-strand break repair helicase AddA  27.31 
 
 		 1161 aa  181  9e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.458203  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0138  double-strand break repair helicase AddA  27.62 
 
 		 1156 aa  179  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727377 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3581  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  27.91 
 
 		 1177 aa  171  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2794  UvrD-like DNA helicase domain-containing protein  28.11 
 
 		 1124 aa  170  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.370193 
 
 
-
 
NC_004310  BR2103  UvrD/Rep family helicase  27.3 
 
 		 1180 aa  168  4e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.664576  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0551  UvrD/REP helicase  25.44 
 
 		 1149 aa  168  5.9999999999999996e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0345301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1322  hypothetical protein  26.46 
 
 		 1057 aa  167  6.9999999999999995e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2020  double-strand break repair helicase AddA  26.32 
 
 		 1180 aa  166  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.411715  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0359  UvrD/Rep/AddA family helicase  25.14 
 
 		 1089 aa  161  6e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5412  UvrD/REP helicase  26.03 
 
 		 1117 aa  159  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1357  double-strand break repair helicase AddA  24 
 
 		 1155 aa  153  2e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2325  UvrD/REP helicase  27.14 
 
 		 1087 aa  151  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293004  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4286  double-strand break repair helicase AddA  26.95 
 
 		 1183 aa  149  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.564831 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0641  UvrD/REP helicase  25.83 
 
 		 1173 aa  148  7.0000000000000006e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0566745  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1377  Exodeoxyribonuclease V  26.4 
 
 		 1226 aa  147  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.246845  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2114  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  27.48 
 
 		 1197 aa  146  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0387  ATP-dependent DNA helicase UvrD  21.78 
 
 		 860 aa  143  1.9999999999999998e-32  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0523  UvrD/REP helicase  23.41 
 
 		 1121 aa  141  7.999999999999999e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1276  UvrD-like DNA helicase, C terminal  27.34 
 
 		 1230 aa  139  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1295  double-strand break repair helicase AddA  25.69 
 
 		 1185 aa  139  4e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0489  double-strand break repair helicase AddA  27.4 
 
 		 1157 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.127792  hitchhiker  0.00205602 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0004  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  22.6 
 
 		 1203 aa  136  1.9999999999999998e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1285  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  28.76 
 
 		 1086 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.196421  normal  0.100578 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4066  UvrD/REP helicase  27 
 
 		 1120 aa  135  5e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.160711 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1481  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  26.42 
 
 		 1230 aa  133  2.0000000000000002e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0629  UvrD/REP helicase  21.61 
 
 		 854 aa  132  5.0000000000000004e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4954  double-strand break repair helicase AddA  29.38 
 
 		 1147 aa  132  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.218744 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2175  double-strand break repair helicase AddA  26.8 
 
 		 1164 aa  131  9.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2846  UvrD/REP helicase  26.62 
 
 		 1121 aa  130  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.347056 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0309  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  23.27 
 
 		 1186 aa  129  4.0000000000000003e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1190  hypothetical protein  27.85 
 
 		 1177 aa  127  9e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4440  double-strand break repair helicase AddA  28.05 
 
 		 1147 aa  126  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.548671  normal  0.292809 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4904  double-strand break repair helicase AddA  27.88 
 
 		 1147 aa  125  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.921527 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0860  recombination helicase AddA  24.08 
 
 		 1242 aa  125  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1157  hypothetical protein  26.64 
 
 		 1061 aa  124  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0782  UvrD/REP helicase  26.47 
 
 		 1107 aa  120  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.685172  normal  0.12668 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1805  UvrD/REP helicase  31.1 
 
 		 1184 aa  119  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2629  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.59 
 
 		 787 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0417333  normal  0.559326 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0817  double-strand break repair helicase AddA  26.16 
 
 		 1180 aa  119  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2039  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  26.38 
 
 		 1251 aa  119  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0555  exonuclease RexA  23.4 
 
 		 1218 aa  118  6e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1061  ATP-dependent nuclease subunit A  24.09 
 
 		 1241 aa  117  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1142  ATP-dependent nuclease subunit A  24.09 
 
 		 1241 aa  117  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1297  ATP-dependent nuclease, subunit A  24.09 
 
 		 1241 aa  117  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0967  recombination helicase AddA  24.73 
 
 		 1217 aa  117  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4148  ATP-dependent nuclease, subunit A  23.93 
 
 		 1241 aa  117  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0986  recombination helicase AddA  24.73 
 
 		 1217 aa  117  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0857621  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1220  ATP-dependent nuclease, subunit A  23.9 
 
 		 1240 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1245  ATP-dependent nuclease, subunit A  24.09 
 
 		 1241 aa  117  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1041  ATP-dependent nuclease, subunit A  24.09 
 
 		 1241 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0671  recombination helicase AddA  26.72 
 
 		 1244 aa  115  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0648  UvrD/REP helicase  27.3 
 
 		 1140 aa  115  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464664  normal  0.326348 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1412  double-strand break repair helicase AddA  27.32 
 
 		 1151 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0085  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.83 
 
 		 1139 aa  113  2.0000000000000002e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  24.2 
 
 		 744 aa  112  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0874  exonuclease RexA  22.25 
 
 		 1207 aa  112  3e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.149314  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1034  UvrD/REP helicase  27.62 
 
 		 1173 aa  112  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0891257  normal  0.693052 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2449  ATP-dependent DNA helicase UvrD  27.34 
 
 		 726 aa  111  8.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.170877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3438  double-strand break repair helicase AddA  28.46 
 
 		 1125 aa  111  8.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1525  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.26 
 
 		 772 aa  111  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3377  double-strand break repair helicase AddA  29.16 
 
 		 1165 aa  110  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.291395  normal  0.767589 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1571  UvrD/REP helicase  26.49 
 
 		 1110 aa  111  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4853  double-strand break repair helicase AddA  28.16 
 
 		 1157 aa  110  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.744046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1474  UvrD/REP helicase  23.64 
 
 		 781 aa  109  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.517963 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1142  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.43 
 
 		 788 aa  110  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.140222 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1486  recombination helicase AddA  25.87 
 
 		 1242 aa  108  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.48 
 
 		 763 aa  108  5e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00770  ATP-dependent exonuclase V beta subunit, helicase and exonuclease domain-containing  26.92 
 
 		 1262 aa  108  8e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1126  UvrD/REP helicase  27.74 
 
 		 1173 aa  107  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.443367 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1997  UvrD/REP helicase  25.65 
 
 		 1161 aa  107  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.283179  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  22.93 
 
 		 724 aa  106  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0090  putative recombination protein RecB  26.77 
 
 		 903 aa  105  4e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  22.58 
 
 		 731 aa  105  4e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2131  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit A  24.58 
 
 		 1187 aa  105  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.564437  normal  0.516906 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1610  double-strand break repair helicase AddA  28.15 
 
 		 1157 aa  105  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.97 
 
 		 795 aa  105  7e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1455  UvrD/REP helicase  23.37 
 
 		 715 aa  104  8e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>