More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1708 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  100 
 
 		 110 aa  224  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  60.75 
 
 		 109 aa  156  9e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  69.15 
 
 		 106 aa  149  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  62.86 
 
 		 107 aa  148  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  58.72 
 
 		 109 aa  147  5e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3080  thioredoxin  59.43 
 
 		 108 aa  147  6e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  62.75 
 
 		 106 aa  146  9e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  62.5 
 
 		 107 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  60.95 
 
 		 107 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3067  thioredoxin  58.72 
 
 		 109 aa  144  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.788534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5927  thioredoxin  58.18 
 
 		 110 aa  144  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  61.39 
 
 		 108 aa  144  4.0000000000000006e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  61.39 
 
 		 107 aa  144  5e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  61.39 
 
 		 107 aa  144  5e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  60.4 
 
 		 148 aa  143  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  60.4 
 
 		 107 aa  143  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0404  thioredoxin  55.96 
 
 		 109 aa  142  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2289  thioredoxin  55.14 
 
 		 108 aa  141  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876713  normal  0.363166 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  59.41 
 
 		 107 aa  141  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  59.41 
 
 		 107 aa  141  4e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  59.41 
 
 		 107 aa  141  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  55.05 
 
 		 109 aa  141  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000190247  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  57.84 
 
 		 108 aa  140  5e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  56.88 
 
 		 109 aa  139  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0475  thioredoxin  57.55 
 
 		 108 aa  139  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  56.86 
 
 		 107 aa  138  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2583  thioredoxin  56 
 
 		 110 aa  138  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  57.27 
 
 		 115 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  54.72 
 
 		 108 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  54.72 
 
 		 109 aa  138  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  56.31 
 
 		 107 aa  138  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  53.64 
 
 		 110 aa  138  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  58.59 
 
 		 107 aa  138  3e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  56.57 
 
 		 107 aa  138  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47420  Thioredoxin 1, trx1  55.77 
 
 		 108 aa  138  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5983  thioredoxin  56.31 
 
 		 108 aa  138  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0363  thioredoxin  55.96 
 
 		 109 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000145924  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0300  thioredoxin  55.66 
 
 		 116 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  57.58 
 
 		 124 aa  137  4.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2084  thioredoxin  56.86 
 
 		 107 aa  137  4.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2340  thioredoxin  57.69 
 
 		 108 aa  137  4.999999999999999e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0697906  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  51.4 
 
 		 125 aa  136  7e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  56.19 
 
 		 109 aa  137  7e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  55.05 
 
 		 109 aa  136  8.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  54.13 
 
 		 109 aa  136  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  58.42 
 
 		 108 aa  135  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  56.73 
 
 		 108 aa  136  1e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  57.58 
 
 		 107 aa  135  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69200  thioredoxin  55.34 
 
 		 108 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  56.73 
 
 		 108 aa  134  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  55.34 
 
 		 107 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  58.42 
 
 		 108 aa  134  4e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  53.85 
 
 		 108 aa  134  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  53.85 
 
 		 108 aa  134  5e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  53.85 
 
 		 108 aa  134  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  52.88 
 
 		 120 aa  134  5e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  53.85 
 
 		 108 aa  134  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  53.85 
 
 		 108 aa  134  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  53.85 
 
 		 108 aa  134  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  53.85 
 
 		 108 aa  134  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  53.85 
 
 		 108 aa  134  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0308  thioredoxin  52.88 
 
 		 108 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  56.31 
 
 		 108 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  53.85 
 
 		 108 aa  133  7.000000000000001e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000417679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  52.83 
 
 		 146 aa  133  8e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  52.88 
 
 		 108 aa  133  9e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  52.88 
 
 		 108 aa  133  9e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  52.88 
 
 		 108 aa  133  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  52.88 
 
 		 108 aa  133  9e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  52.88 
 
 		 108 aa  133  9e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  52.88 
 
 		 108 aa  133  9e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  56.57 
 
 		 123 aa  133  9e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  52.88 
 
 		 108 aa  133  9e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  52.88 
 
 		 108 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  51.82 
 
 		 133 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  52.88 
 
 		 108 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  51.43 
 
 		 108 aa  132  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0657  thioredoxin  53.85 
 
 		 108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  51.89 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  50.94 
 
 		 109 aa  132  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1283  thioredoxin 1  52.83 
 
 		 109 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149215  normal  0.0874847 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  54.81 
 
 		 108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5038  thioredoxin  52.83 
 
 		 109 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  55 
 
 		 107 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0806  thioredoxin  53.85 
 
 		 108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  55 
 
 		 107 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0036  thioredoxin  51.89 
 
 		 108 aa  131  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0705575 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2496  thioredoxin  51.82 
 
 		 109 aa  130  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.182202  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  56.57 
 
 		 107 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2195  thioredoxin  50 
 
 		 110 aa  130  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  53.64 
 
 		 109 aa  130  5e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  55.34 
 
 		 108 aa  130  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  52.73 
 
 		 109 aa  130  5e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  55.34 
 
 		 108 aa  130  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  55.34 
 
 		 108 aa  130  6e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  52.88 
 
 		 107 aa  130  6.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1359  thioredoxin  50.91 
 
 		 109 aa  130  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1456  thioredoxin  50.91 
 
 		 109 aa  130  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  53.33 
 
 		 110 aa  130  7.999999999999999e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  50.98 
 
 		 107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>