258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1701 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1701  ModE family transcriptional regulator  100 
 
 
125 aa  249  1e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.540153  normal  0.344174 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0066  ModE family transcriptional regulator  44.04 
 
 
108 aa  102  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000184024  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0330  putative transcriptional regulator, ModE family  40.54 
 
 
116 aa  94.7  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000263512  normal  0.179413 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0983  putative transcriptional regulator, ModE family  43.86 
 
 
134 aa  89.7  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2059  regulatory protein LysR  34.48 
 
 
245 aa  87.8  5e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000246336  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1572  ModE family transcriptional regulator  45.45 
 
 
123 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.113677  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1565  putative transcriptional regulator, ModE family  43.75 
 
 
139 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0360  putative transcriptional regulator, ModE family  36.13 
 
 
242 aa  80.9  0.000000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2172  putative transcriptional regulator, ModE family  44.55 
 
 
131 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.890438 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2202  putative transcriptional regulator, ModE family  36.36 
 
 
111 aa  79.3  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2877  ModE family transcriptional regulator  40.95 
 
 
125 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.795322  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0212  CBS domain-containing protein  29.41 
 
 
247 aa  77.8  0.00000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0023  ModE family transcriptional regulator  46.15 
 
 
135 aa  77.4  0.00000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3521  Fis family transcriptional regulator  42.06 
 
 
125 aa  77  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0054  ModE family transcriptional regulator  39.81 
 
 
138 aa  77  0.00000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0286693 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4071  putative transcriptional regulator, ModE family  38.1 
 
 
115 aa  76.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0460  ModE family transcriptional regulator  36.11 
 
 
127 aa  76.6  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000661787  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0057  ModE family transcriptional regulator  40.82 
 
 
137 aa  75.5  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0650  putative transcriptional regulator, ModE family  40.16 
 
 
136 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.33047 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1100  ModE family transcriptional regulator  37.84 
 
 
145 aa  74.7  0.0000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.87335  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  37.37 
 
 
276 aa  74.7  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50680  Mo regulation, Mo processing homeostasis  37.76 
 
 
270 aa  73.9  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438349  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33430  Molybdenum-binding ModE protein  36.73 
 
 
270 aa  73.2  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1394  ModE family transcriptional regulator  43.33 
 
 
171 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3511  Fis family transcriptional regulator  42.86 
 
 
155 aa  71.6  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  37.23 
 
 
263 aa  71.6  0.000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0533  putative transcriptional regulator, ModE family  37.23 
 
 
118 aa  71.2  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1680  molybdate transport repressor  28.1 
 
 
245 aa  70.5  0.000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1499  molybdate transport repressor  28.1 
 
 
233 aa  70.5  0.000000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.890291  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  34.91 
 
 
272 aa  70.1  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1859  molybdate transport repressor  28.1 
 
 
233 aa  70.1  0.000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0033  ModE family transcriptional regulator  47.19 
 
 
155 aa  70.1  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0601173  normal  0.403792 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5199  transcriptional regulator, ModE family  42.86 
 
 
263 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2404  putative ModE family transcriptional regulator  38.53 
 
 
115 aa  68.6  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.424301  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3515  ModE family transcriptional regulator  38.95 
 
 
112 aa  68.2  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000445767  normal  0.258614 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0856  ModE family transcriptional regulator  42.86 
 
 
263 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0962  molybdate transport repressor  42.86 
 
 
263 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1405  putative transcriptional regulator, ModE family  35.48 
 
 
126 aa  67.4  0.00000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.518534  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0705  ModE family transcriptional regulator  37.5 
 
 
263 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  35.42 
 
 
236 aa  67  0.00000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2144  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  33.67 
 
 
195 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.947345  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1642  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
128 aa  66.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.986241 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  37.66 
 
 
270 aa  66.6  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0482  putative transcriptional regulator, ModE family  32.41 
 
 
128 aa  65.5  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000243706  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5511  putative transcriptional regulator, ModE family  34.07 
 
 
114 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0658  putative transcriptional regulator, ModE family  43.68 
 
 
115 aa  65.1  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3706  putative transcriptional regulator, ModE family  34.07 
 
 
114 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6143  putative transcriptional regulator, ModE family  32.99 
 
 
114 aa  64.3  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.144159  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2664  ModE family transcriptional regulator  35.71 
 
 
118 aa  63.9  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.554277  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2293  ModE family transcriptional regulator  31.52 
 
 
115 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.11585  normal  0.260705 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1265  putative molybdenum transport protein ModA  39.6 
 
 
195 aa  63.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4205  putative transcriptional regulator, ModE family  33.98 
 
 
125 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.590179  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0723  helix-turn-helix domain protein  30.53 
 
 
123 aa  62  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523038  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0871  putative transcriptional regulator, ModE family  30.53 
 
 
123 aa  62  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.741628  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3881  putative transcriptional regulator, ModE family  34 
 
 
119 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180792  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4319  ModE family transcriptional regulator  35.06 
 
 
129 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0494502  normal  0.0757875 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2041  putative transcriptional regulator, ModE family  36.17 
 
 
118 aa  60.8  0.000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2794  ModE family transcriptional regulator  37.97 
 
 
107 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3409  ModE family transcriptional regulator  31.68 
 
 
116 aa  60.5  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0426925  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2824  ModE family transcriptional regulator  35.23 
 
 
152 aa  60.8  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.812847 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4419  ModE family transcriptional regulator  32.43 
 
 
125 aa  59.7  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.675399  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1573  putative molybdenum-binding protein  35.96 
 
 
265 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163171  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1927  ModE family transcriptional regulator  36.04 
 
 
129 aa  59.3  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  35.06 
 
 
262 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1343  molybdenum transport protein, putative  35.16 
 
 
177 aa  58.5  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  35.06 
 
 
262 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2068  TOBE domain protein  33.64 
 
 
257 aa  58.2  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1989  ModE family transcriptional regulator  35.8 
 
 
263 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.455542  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2476  molybdate transport repressor  37.04 
 
 
263 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.240008  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4134  putative transcriptional regulator, ModE family  31.31 
 
 
121 aa  58.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0113407 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0934  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
134 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.102124  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2247  transcriptional regulator, ModE family  37.8 
 
 
266 aa  57.8  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3075  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  42.67 
 
 
346 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0506443  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2849  regulatory protein LysR  44.78 
 
 
345 aa  57  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.312034  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0566  putative transcriptional regulator, ModE family  34.45 
 
 
114 aa  57  0.00000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.454266  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05434  putative molybdenum-pterin-binding protein  40.62 
 
 
269 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2967  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  40.48 
 
 
353 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.23709  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1779  LysR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
95 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.027196  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5342  putative transcriptional regulator, ModE family  35.05 
 
 
114 aa  56.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2514  ModE family transcriptional regulator  27.88 
 
 
125 aa  56.6  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.217491  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2953  ModE family transcriptional regulator  38.3 
 
 
263 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
268 aa  56.6  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0974  molybdenum-binding transcriptional repressor  33.67 
 
 
132 aa  56.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0173  ModE family transcriptional regulator  38.81 
 
 
109 aa  55.1  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.727956  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2203  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  30.91 
 
 
260 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4329  transcriptional regulator, ModE family  41.05 
 
 
270 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00653536 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2496  ModE family transcriptional regulator  38.55 
 
 
115 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4219  transcriptional regulator, ModE family  41.05 
 
 
270 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1577  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  36.05 
 
 
369 aa  54.3  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0203  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  39.53 
 
 
374 aa  53.9  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.433996  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13050  molybdenum-binding protein  36.96 
 
 
115 aa  53.5  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.803513  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4259  ModE family transcriptional regulator  33.66 
 
 
138 aa  53.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459196  normal  0.100548 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  32.48 
 
 
269 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2092  hypothetical protein  43.08 
 
 
366 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.306178  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1537  ModE family transcriptional regulator  36.17 
 
 
258 aa  52.4  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0339  molybdate metabolism transcriptional regulator  42.37 
 
 
358 aa  51.6  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1822  molybdate metabolism transcriptional regulator  46.03 
 
 
386 aa  52  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00250223 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1335  molybdate metabolism transcriptional regulator  40.28 
 
 
340 aa  52  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1919  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  41.54 
 
 
366 aa  51.2  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.360263  normal  0.895882 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2243  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  41.54 
 
 
366 aa  51.2  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.963081  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>