130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1696 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1696  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
336 aa  693    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1790  Radical SAM domain protein  60.61 
 
 
307 aa  370  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2282  radical SAM domain-containing protein  57.43 
 
 
313 aa  360  2e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1956  Radical SAM domain protein  57.49 
 
 
301 aa  344  1e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1488  Radical SAM domain protein  54.01 
 
 
323 aa  320  3e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1372  radical SAM domain-containing protein  58.82 
 
 
298 aa  318  9e-86  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1072  radical SAM domain-containing protein  53.33 
 
 
306 aa  318  9e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1225  Radical SAM domain protein  46.78 
 
 
301 aa  312  5.999999999999999e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4174  radical SAM domain-containing protein  51.5 
 
 
305 aa  306  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000899263  hitchhiker  0.0000122101 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4313  radical SAM domain-containing protein  52.72 
 
 
305 aa  305  9.000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1667  radical SAM domain-containing protein  51.84 
 
 
312 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1745  Radical SAM domain protein  47.81 
 
 
303 aa  295  8e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0609211 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1076  Radical SAM domain protein  49.29 
 
 
327 aa  290  2e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3220  radical SAM family protein  52.36 
 
 
312 aa  287  2e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0910246  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1859  radical SAM domain-containing protein  46.74 
 
 
300 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.54951  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1274  radical SAM domain-containing protein  46.05 
 
 
319 aa  281  1e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.330948  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1772  radical SAM family protein  45.36 
 
 
300 aa  275  7e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.138508  normal  0.113699 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2526  radical SAM domain-containing protein  46.82 
 
 
318 aa  275  9e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.252975  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2082  radical SAM  42.27 
 
 
308 aa  259  6e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1899  Radical SAM domain protein  45.45 
 
 
309 aa  256  4e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.735258  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1368  radical SAM domain-containing protein  44.79 
 
 
334 aa  253  3e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0299345  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1149  radical SAM domain protein  44.64 
 
 
334 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000033704  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0616  radical SAM domain-containing protein  50 
 
 
296 aa  249  5e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1179  radical SAM domain-containing protein  44.29 
 
 
334 aa  249  6e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0438654  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2309  Radical SAM domain protein  44.73 
 
 
302 aa  249  7e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0003  radical SAM domain-containing protein  43.88 
 
 
286 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0003  radical SAM domain-containing protein  43.88 
 
 
286 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07611  pyruvate formate lyase activating enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15630)  42.09 
 
 
373 aa  238  9e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00159546  normal  0.16163 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2121  radical SAM domain-containing protein  44.74 
 
 
326 aa  238  2e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152404  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1289  radical SAM domain-containing protein  42.44 
 
 
298 aa  236  3e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0368  radical SAM family protein  43.54 
 
 
315 aa  235  1.0000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000743683  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3427  radical SAM domain-containing protein  40.22 
 
 
313 aa  229  4e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0110  Radical SAM domain protein  40.5 
 
 
296 aa  229  5e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.389889  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1947  Radical SAM domain protein  38.18 
 
 
283 aa  225  9e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0661  Radical SAM domain protein  38.05 
 
 
320 aa  225  1e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1251  radical SAM domain-containing protein  37.36 
 
 
303 aa  222  7e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.269935  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1063  radical SAM domain-containing protein  36.33 
 
 
303 aa  222  7e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1143  radical SAM domain-containing protein  37.59 
 
 
287 aa  211  2e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0815  radical SAM domain-containing protein  39.11 
 
 
320 aa  207  2e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0883393  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0838  radical SAM domain-containing protein  39.11 
 
 
320 aa  207  2e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1152  Radical SAM domain protein  38.54 
 
 
321 aa  202  9e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.429756  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1949  radical SAM domain-containing protein  32.54 
 
 
319 aa  198  1.0000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2506  radical SAM domain-containing protein  40.23 
 
 
331 aa  194  1e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000358558  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0526  Radical SAM domain protein  39.22 
 
 
344 aa  195  1e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0095894  unclonable  0.0000000400012 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1701  radical SAM domain-containing protein  36.9 
 
 
295 aa  194  2e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16130  pyruvate formate lyase activating protein-like uncharacterized Fe-S protein  38.11 
 
 
293 aa  186  4e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000206983 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09130  pyruvate formate lyase activating protein-like uncharacterized Fe-S protein  35.69 
 
 
326 aa  169  7e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0210847  normal  0.81477 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0925  radical SAM domain-containing protein  38.81 
 
 
355 aa  168  1e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0826  radical SAM domain-containing protein  36.88 
 
 
373 aa  166  5e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1370  radical SAM domain-containing protein  37.03 
 
 
373 aa  160  2e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1947  radical SAM domain-containing protein  38.52 
 
 
372 aa  159  8e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0987  radical SAM domain-containing protein  36.11 
 
 
371 aa  153  4e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.499392 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0881  radical SAM domain-containing protein  35.25 
 
 
374 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.607875  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3602  formate acetyltransferase activating enzyme  32.37 
 
 
345 aa  133  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.795374  normal  0.163348 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1167  radical SAM family protein  28.5 
 
 
294 aa  61.6  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000619352  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1995  radical SAM domain-containing protein  24.62 
 
 
405 aa  58.9  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0338  radical SAM domain-containing protein  30.32 
 
 
348 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0041  radical SAM domain-containing protein  27.67 
 
 
362 aa  58.5  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.821324  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1063  radical SAM domain-containing protein  25.91 
 
 
336 aa  56.2  0.0000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.665632  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2217  Radical SAM domain protein  29.61 
 
 
374 aa  55.8  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6305  Radical SAM domain-containing protein  32.41 
 
 
388 aa  55.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0270  radical SAM domain-containing protein  31.4 
 
 
286 aa  53.5  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1563  radical SAM domain-containing protein  23.96 
 
 
336 aa  53.5  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.356418 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0983  radical SAM domain-containing protein  29.28 
 
 
344 aa  53.5  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1761  Radical SAM domain protein  25.6 
 
 
337 aa  53.5  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0383887 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0348  radical SAM domain-containing protein  23.71 
 
 
336 aa  53.1  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.224287  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1325  radical SAM domain-containing protein  34.15 
 
 
365 aa  53.1  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.322233  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0219  Radical SAM domain protein  25.89 
 
 
337 aa  53.1  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0211251  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13159  pyruvate formate lyase activating protein pflA  25.97 
 
 
362 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0898  radical SAM domain-containing protein  29.02 
 
 
369 aa  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2684  Radical SAM domain protein  23.73 
 
 
367 aa  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307935  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1066  radical SAM domain-containing protein  25.73 
 
 
333 aa  51.6  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.925022  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0728  Radical SAM domain protein  35.85 
 
 
361 aa  51.6  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000489129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0574  radical SAM domain protein  35.85 
 
 
361 aa  51.6  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2402  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 
297 aa  50.8  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1585  hypothetical protein  28.24 
 
 
364 aa  51.2  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0540  radical SAM domain-containing protein  26.19 
 
 
326 aa  50.8  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1455  Radical SAM domain protein  23.32 
 
 
333 aa  50.8  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1963  Radical SAM domain protein  25.38 
 
 
334 aa  50.8  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0105086  decreased coverage  0.00565461 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0044  Radical SAM domain protein  23.6 
 
 
343 aa  50.4  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.671161  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1497  radical SAM domain-containing protein  31.03 
 
 
365 aa  50.1  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.398952  normal  0.0425103 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1240  radical SAM domain-containing protein  27.74 
 
 
331 aa  50.4  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2213  radical SAM domain-containing protein  25.83 
 
 
367 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0100129 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0396  radical SAM family protein  28.85 
 
 
358 aa  50.1  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1648  radical SAM domain-containing protein  27.57 
 
 
363 aa  49.7  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1215  radical SAM domain-containing protein  27.74 
 
 
331 aa  49.7  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0103  Radical SAM domain protein  29.14 
 
 
356 aa  49.3  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0073  pyruvate formate lyase-activating enzyme, putative  31.4 
 
 
365 aa  48.9  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1815  radical SAM domain-containing protein  28.16 
 
 
364 aa  48.5  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1005  radical SAM domain-containing protein  30.2 
 
 
370 aa  48.5  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0086  radical SAM family protein  29.14 
 
 
356 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.508004  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1694  Radical SAM domain protein  28.77 
 
 
280 aa  48.1  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.953973 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2404  radical SAM family Fe-S protein  27.75 
 
 
353 aa  48.5  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2539  Radical SAM domain protein  27.94 
 
 
360 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0893  radical SAM domain-containing protein  28.47 
 
 
361 aa  48.1  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.910266 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1058  radical SAM domain-containing protein  27.46 
 
 
382 aa  48.1  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0093  Radical SAM domain protein  29.14 
 
 
356 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2456  Radical SAM domain protein  24.91 
 
 
337 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2555  Radical SAM domain protein  27.91 
 
 
366 aa  47.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466932  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1670  radical SAM domain-containing protein  24.75 
 
 
339 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0387663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>