More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1695 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1695  twitching motility protein  100 
 
 
360 aa  740    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3053  twitching motility protein  73.54 
 
 
360 aa  553  1e-156  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1917  twitching motility protein  67.22 
 
 
360 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.979204 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1131  twitching motility protein  65 
 
 
360 aa  501  1e-141  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.809253  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1038  twitching motility protein  58.4 
 
 
372 aa  432  1e-120  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1802  twitching motility protein  58.17 
 
 
369 aa  427  1e-118  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.579397 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0067  twitching motility protein  57.3 
 
 
356 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.78052e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0084  twitching motility protein  56.58 
 
 
357 aa  412  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0436  twitching motility protein PilT  55.93 
 
 
356 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3400  pilus retraction protein PilT  54.8 
 
 
356 aa  402  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4274  twitching motility protein  56.06 
 
 
356 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0536  twitching motility protein  54.29 
 
 
358 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3221  twitching motility protein  53.39 
 
 
356 aa  396  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0505  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  56.03 
 
 
347 aa  393  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2107  twitching motility protein  54.95 
 
 
347 aa  381  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  53.45 
 
 
347 aa  375  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0166  twitching motility protein  52.39 
 
 
364 aa  376  1e-103  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.197236 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  53.75 
 
 
347 aa  373  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1128  twitching motility protein  53.17 
 
 
345 aa  368  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0169735  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  52.87 
 
 
345 aa  368  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1841  twitching motility protein  52.19 
 
 
349 aa  369  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.616267  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0460  twitching motility protein  53.18 
 
 
356 aa  365  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.16697  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3760  Pili biogenesis ATPase  53.45 
 
 
347 aa  367  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112866  normal  0.149271 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  55.02 
 
 
347 aa  367  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  52.85 
 
 
347 aa  365  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  51.74 
 
 
397 aa  365  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1688  twitching motility protein  53.45 
 
 
347 aa  366  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0396  twitching motility protein  53.75 
 
 
347 aa  367  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2681  twitching motility protein  52.27 
 
 
349 aa  366  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1194  pilus retraction ATPase PilT  52.87 
 
 
345 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0809497  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1265  pilus retraction ATPase PilT  52.87 
 
 
345 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395146  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1195  pilus retraction ATPase PilT  52.87 
 
 
345 aa  365  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3351  twitching motility protein PilT  52.57 
 
 
345 aa  363  2e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0278  twitching motility protein  53.75 
 
 
347 aa  363  2e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1233  twitching motility protein PilT  52.25 
 
 
344 aa  362  4e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000670856  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2476  twitching motility protein  52.57 
 
 
345 aa  362  6e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3039  twitching motility protein  51.66 
 
 
345 aa  361  1e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00110048  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3182  twitching motility protein  51.66 
 
 
345 aa  361  1e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000300358  normal  0.0171368 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1138  twitching motility protein  51.96 
 
 
345 aa  361  1e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1339  twitching motility protein  51.66 
 
 
345 aa  361  1e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0176269  hitchhiker  0.0000000675214 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1333  twitching motility protein  51.96 
 
 
345 aa  360  1e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1631  twitching motility protein  52.25 
 
 
347 aa  360  2e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0179805 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4813  twitching motility protein  53.15 
 
 
347 aa  360  2e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2686  twitching motility protein  52.27 
 
 
345 aa  360  3e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0420  twitching motility protein  52.25 
 
 
347 aa  359  5e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0412  twitching motility protein  52.25 
 
 
347 aa  359  5e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3024  twitching motility protein  51.36 
 
 
345 aa  358  6e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00035663  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1068  twitching motility protein  52.55 
 
 
347 aa  358  8e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.365161 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3027  twitching motility protein  51.65 
 
 
382 aa  358  9.999999999999999e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0264  twitching motility protein PilT  51.35 
 
 
349 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01993  twitching motility protein  52.25 
 
 
345 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.913118  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0441  twitching motility protein  51.35 
 
 
349 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000176811 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  51.34 
 
 
347 aa  356  2.9999999999999997e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0637  twitching motility protein  51.95 
 
 
347 aa  356  2.9999999999999997e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0342  twitching motility protein  53.15 
 
 
345 aa  356  3.9999999999999996e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1321  twitching motility protein  53.73 
 
 
362 aa  355  5.999999999999999e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0136212 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3053  twitching motility protein  54.41 
 
 
346 aa  355  6.999999999999999e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.39006  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3039  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilT)  51.95 
 
 
344 aa  355  8.999999999999999e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.37999  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2918  twitching motility protein  55.23 
 
 
347 aa  354  1e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2506  twitching motility protein  55.23 
 
 
347 aa  354  1e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0931  twitching motility protein  51.65 
 
 
345 aa  354  2e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413956  normal  0.826545 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4149  twitching motility protein  52.85 
 
 
344 aa  352  7e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0495  twitching motility protein PilT  53.15 
 
 
344 aa  351  8.999999999999999e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05180  twitching motility protein PilT  53.15 
 
 
344 aa  351  8.999999999999999e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  51.65 
 
 
344 aa  351  1e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0478  pilus retraction protein PilT  54.55 
 
 
344 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5045  twitching motility protein  54.55 
 
 
344 aa  348  8e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1609  twitching motility protein  51.2 
 
 
345 aa  348  9e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.409997 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2682  twitching motility protein  54.25 
 
 
347 aa  347  1e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  51.35 
 
 
344 aa  348  1e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0537  twitching motility protein  53.92 
 
 
344 aa  347  2e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2936  twitching motility protein  50.45 
 
 
347 aa  347  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.745836  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1346  twitching motility protein  52.21 
 
 
566 aa  346  3e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2800  pilus retraction protein PilT  50.75 
 
 
347 aa  346  4e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5318  pilus retraction protein PilT  55.23 
 
 
344 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1750  twitching motility protein  50.9 
 
 
345 aa  345  1e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2918  twitching motility protein PilT  51.96 
 
 
344 aa  344  1e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.683879  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3717  twitching motility protein  49.55 
 
 
347 aa  344  1e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1537  twitching motility protein PilT  51.35 
 
 
344 aa  344  2e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1823  twitching motility protein  53.33 
 
 
378 aa  344  2e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  normal  0.842745 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3640  twitching motility protein PilT  54.9 
 
 
344 aa  343  2.9999999999999997e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03297  twitching motility protein PilT  48.83 
 
 
349 aa  343  2.9999999999999997e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987753  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3004  pilus retraction protein PilT  51.5 
 
 
345 aa  342  4e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1126  twitching motility protein  52.2 
 
 
430 aa  342  9e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  47.94 
 
 
349 aa  339  4e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0668  twitching motility protein  46.59 
 
 
365 aa  337  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  52.35 
 
 
339 aa  337  1.9999999999999998e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0316  twitching motility protein  49.55 
 
 
345 aa  337  2.9999999999999997e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.436596  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3527  twitching motility protein  50.76 
 
 
344 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.318184  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1221  twitching motility protein  47.79 
 
 
344 aa  336  3.9999999999999995e-91  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.475571  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2414  twitching motility protein  50.45 
 
 
344 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  46.84 
 
 
366 aa  336  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1253  twitching motility protein  47.79 
 
 
344 aa  336  3.9999999999999995e-91  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0459  twitching motility protein  49.01 
 
 
364 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0174567  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2148  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  46.57 
 
 
374 aa  335  5e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  46.84 
 
 
366 aa  335  5e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  47.8 
 
 
365 aa  335  7.999999999999999e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1165  pilus retraction ATPase PilT  49.85 
 
 
367 aa  335  7.999999999999999e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.591926  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  46.55 
 
 
366 aa  335  7.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  45.25 
 
 
365 aa  333  2e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>