More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1679 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1679  inner-membrane translocator  100 
 
 		 317 aa  624  1e-178  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1863  inner-membrane translocator  50.95 
 
 		 321 aa  315  8e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2128  inner-membrane translocator  52.74 
 
 		 337 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1673  inner-membrane translocator  51.55 
 
 		 319 aa  298  1e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1732  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  51.46 
 
 		 326 aa  296  3e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1821  inner-membrane translocator  53.77 
 
 		 328 aa  288  7e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4071  inner-membrane translocator  48.73 
 
 		 327 aa  269  4e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1482  inner-membrane translocator  49.47 
 
 		 360 aa  269  5e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1407  inner-membrane translocator  47.87 
 
 		 332 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.14353  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0835  inner-membrane translocator  44.69 
 
 		 335 aa  259  4e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0400978  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2187  inner-membrane translocator  49.83 
 
 		 320 aa  257  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2040  inner-membrane translocator  49.83 
 
 		 320 aa  258  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000437253 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0384  ABC transporter related  49.82 
 
 		 614 aa  248  1e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0366  inner-membrane translocator  47.27 
 
 		 310 aa  241  1e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000392686  unclonable  0.0000000558621 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0997  inner-membrane translocator  46.39 
 
 		 321 aa  241  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.915307  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1517  inner-membrane translocator  46.95 
 
 		 309 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3103  inner-membrane translocator  45.86 
 
 		 354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3820  inner-membrane translocator  42.35 
 
 		 328 aa  233  3e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0270491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0670  inner-membrane translocator  42.77 
 
 		 335 aa  217  2e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2754  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  41.52 
 
 		 325 aa  209  7e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129032  normal  0.265528 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2363  inner-membrane translocator  42.19 
 
 		 325 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0322104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4795  inner-membrane translocator  38.87 
 
 		 319 aa  202  6e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341671  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1480  inner-membrane translocator  40.44 
 
 		 407 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0092  ABC transporter related  40.21 
 
 		 594 aa  199  7e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.500773 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2395  inner-membrane translocator  38.91 
 
 		 407 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2318  ABC transporter related protein  37.94 
 
 		 589 aa  198  1.0000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2609  inner-membrane translocator  39.64 
 
 		 415 aa  197  3e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3273  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  39.5 
 
 		 594 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.841496  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0082  ABC transporter related  39.5 
 
 		 594 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.999385  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1944  inner-membrane translocator  40.86 
 
 		 297 aa  195  8.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2964  ABC transporter related  39.5 
 
 		 594 aa  195  9e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0091  ABC transporter related  39.5 
 
 		 594 aa  195  9e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0026  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  37.99 
 
 		 594 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0108  ABC transporter related  39.5 
 
 		 594 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1047  inner-membrane translocator  38.19 
 
 		 314 aa  194  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1722  inner-membrane translocator  40.26 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3041  ABC transporter related  39.5 
 
 		 594 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0777  ABC transporter related  39.15 
 
 		 590 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4551  inner-membrane translocator  41.26 
 
 		 314 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  38.14 
 
 		 594 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0112  inner-membrane translocator  40.91 
 
 		 327 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0192  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  38.14 
 
 		 594 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0833757  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4632  ABC transporter ATPase component  38.43 
 
 		 590 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4058  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  38.14 
 
 		 594 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0091  ABC transporter related  38.79 
 
 		 594 aa  192  6e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3907  ABC transporter related  37.99 
 
 		 594 aa  192  7e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4098  inner-membrane translocator:ABC transporter related  38.33 
 
 		 950 aa  192  9e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0678  inner-membrane translocator  39.65 
 
 		 314 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.297461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2111  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.49 
 
 		 298 aa  191  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2942  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  37.8 
 
 		 594 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1326  ABC transporter-like protein  39.93 
 
 		 590 aa  189  4e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.051365 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3001  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  37.8 
 
 		 594 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1601  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  37.8 
 
 		 594 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2500  inner-membrane translocator  41.63 
 
 		 407 aa  189  4e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.62609  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3369  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  37.8 
 
 		 594 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0989  ABC transporter-related protein  39.13 
 
 		 593 aa  189  5.999999999999999e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3322  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  37.11 
 
 		 594 aa  189  7e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.54 
 
 		 307 aa  188  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1994  ABC transporter related  37.55 
 
 		 590 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7086  ABC tranpsorter, permease protein / ATP-binding protein  36.7 
 
 		 589 aa  186  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.610004 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0891  inner-membrane translocator  42.5 
 
 		 320 aa  185  7e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2365  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.25 
 
 		 339 aa  184  1.0000000000000001e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.554509  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1395  inner-membrane translocator  41.94 
 
 		 293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1259  inner-membrane translocator  42.09 
 
 		 357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1135  inner-membrane translocator  42.55 
 
 		 298 aa  183  3e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.433507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0260  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40 
 
 		 322 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0908  inner-membrane translocator:ABC transporter related  38.76 
 
 		 951 aa  181  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0412388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1891  ABC transporter related  37.55 
 
 		 589 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.553447  normal  0.571968 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2941  ABC transporter related  41.3 
 
 		 604 aa  179  4e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.147552  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0934  inner-membrane translocator  35.48 
 
 		 327 aa  179  7e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000511533  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1580  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.94 
 
 		 317 aa  178  9e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.571371  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3027  inner-membrane translocator  38.54 
 
 		 393 aa  178  9e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.56847  normal  0.739943 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1129  inner-membrane translocator  38.71 
 
 		 299 aa  178  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0406  inner-membrane translocator  38.99 
 
 		 327 aa  178  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0311713  normal  0.305027 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  37.23 
 
 		 562 aa  177  2e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0261  inner-membrane translocator  35.79 
 
 		 324 aa  176  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0267  ABC transporter related  35.87 
 
 		 598 aa  176  6e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.59454  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4480  inner-membrane translocator  38.81 
 
 		 291 aa  175  8e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0567  inner-membrane translocator  35.91 
 
 		 443 aa  175  9e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.856247  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2271  inner-membrane translocator  38.65 
 
 		 297 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.900398 
 
 
-
 
NC_003296  RS01987  amino-acid transmembrane ABC transporter protein  40.74 
 
 		 299 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3659  inner-membrane translocator  36.46 
 
 		 341 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4062  ABC transporter related  38.41 
 
 		 606 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1820  ABC transporter related  36.72 
 
 		 599 aa  172  7.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2501  inner-membrane translocator  35.99 
 
 		 345 aa  172  9e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6000  branched-chain amino acid transport system permease protein  38.04 
 
 		 321 aa  172  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108703  normal  0.0256137 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0694  inner-membrane translocator, ABC transporter related  38.43 
 
 		 583 aa  172  9e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0836  inner-membrane translocator  38.77 
 
 		 318 aa  172  9e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2238  inner-membrane translocator  40.91 
 
 		 326 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3511  ABC transporter-related protein  38.65 
 
 		 617 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0950055 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0357  ABC transporter related  38.2 
 
 		 643 aa  171  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0474  inner-membrane translocator  40.56 
 
 		 336 aa  170  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2016  inner-membrane translocator  41.1 
 
 		 318 aa  170  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292526 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5828  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.52 
 
 		 389 aa  169  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0535  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 401 aa  170  4e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000217655 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3572  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  35.74 
 
 		 589 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3368  ABC transporter related  37.22 
 
 		 593 aa  169  5e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2425  ABC transporter-related protein  39.5 
 
 		 608 aa  169  5e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.630273  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3206  inner-membrane translocator  38.41 
 
 		 318 aa  169  6e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3055  inner-membrane translocator  36.31 
 
 		 324 aa  169  7e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>