More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1671 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  100 
 
 
431 aa  884    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3345  FolC bifunctional protein  41.82 
 
 
429 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  43.6 
 
 
434 aa  323  4e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0533  FolC bifunctional protein  42.59 
 
 
440 aa  310  2e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.861672 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  38.23 
 
 
428 aa  301  2e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  39.53 
 
 
429 aa  297  3e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2552  FolC bifunctional protein  39.44 
 
 
431 aa  296  5e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0970266  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  41.29 
 
 
424 aa  296  6e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0880  FolC bifunctional protein  39.02 
 
 
431 aa  295  1e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4360  FolC bifunctional protein  37.79 
 
 
459 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1447  FolC bifunctional protein  37.91 
 
 
424 aa  285  8e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0295  FolC bifunctional protein  42.76 
 
 
426 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  42.65 
 
 
424 aa  279  6e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2572  FolC bifunctional protein  36.32 
 
 
431 aa  278  9e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  34.66 
 
 
441 aa  276  5e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  34.19 
 
 
441 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  38.69 
 
 
425 aa  273  5.000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  37.38 
 
 
443 aa  273  6e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  37.53 
 
 
432 aa  270  4e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4302  FolC bifunctional protein  35.66 
 
 
433 aa  268  2e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  38.28 
 
 
457 aa  268  2e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0659  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  35.19 
 
 
433 aa  265  1e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3173  FolC bifunctional protein  35.2 
 
 
433 aa  264  2e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4548  folylpolyglutamate synthase  34.97 
 
 
433 aa  264  3e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0782  FolC bifunctional protein  37.79 
 
 
435 aa  263  4e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1472  FolC bifunctional protein  41.86 
 
 
425 aa  263  4e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0335611  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0759  FolC bifunctional protein  37.79 
 
 
437 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2554  dihydropteroate synthase  38.76 
 
 
840 aa  262  6.999999999999999e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.324611  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1996  FolC bifunctional protein  37.24 
 
 
428 aa  261  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.0222652 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1830  FolC bifunctional protein  40.61 
 
 
432 aa  260  3e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0684286  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2764  FolC bifunctional protein  37.76 
 
 
424 aa  260  4e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4354  folylpolyglutamate synthase  34.72 
 
 
433 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4190  folylpolyglutamate synthase  34.72 
 
 
433 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4689  folylpolyglutamate synthase  34.72 
 
 
433 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4544  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  34.72 
 
 
433 aa  259  8e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  36.05 
 
 
466 aa  258  1e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4201  folylpolyglutamate synthase  34.26 
 
 
433 aa  257  3e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0603  FolC bifunctional protein  35.16 
 
 
435 aa  257  3e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4590  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  34.26 
 
 
433 aa  256  5e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  38.22 
 
 
424 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4575  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  34.03 
 
 
433 aa  254  3e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.095656  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0738  folylpolyglutamate synthetase; dihydrofolate synthetase  38.15 
 
 
422 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00754435  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0602  dihydropteroate synthase  36.7 
 
 
813 aa  252  1e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0119  FolC bifunctional protein  38.03 
 
 
447 aa  251  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1542  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase (folylpolyglutamate synthetase)  35.42 
 
 
429 aa  251  2e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0207441  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3147  FolC bifunctional protein  35.71 
 
 
817 aa  251  2e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0120997  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_15  folylpolyglutamate synthetase  38.3 
 
 
437 aa  248  1e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07720  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  37.92 
 
 
427 aa  248  1e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.278263 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3099  FolC bifunctional protein  37.05 
 
 
438 aa  248  1e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0016  folylpolyglutamate synthetase  36.64 
 
 
439 aa  247  2e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3284  dihydropteroate synthase  37.93 
 
 
847 aa  248  2e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0510  FolC bifunctional protein  35.4 
 
 
437 aa  247  3e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1166  FolC bifunctional protein  35.2 
 
 
428 aa  246  6e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3070  FolC bifunctional protein  34.5 
 
 
428 aa  245  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0015  FolC bifunctional protein  36.19 
 
 
438 aa  245  9.999999999999999e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.124008  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4713  dihydropteroate synthase  35.96 
 
 
810 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.464706  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4541  FolC bifunctional protein  36.11 
 
 
453 aa  244  3e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.195738  normal  0.774158 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1110  FolC bifunctional protein  33.78 
 
 
465 aa  244  3e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.94602 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1648  hypothetical protein  35.35 
 
 
416 aa  244  3e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1510  FolC bifunctional protein  34.15 
 
 
413 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2368  folC bifunctional protein  42.29 
 
 
381 aa  242  9e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.183429  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1883  FolC bifunctional protein  34.99 
 
 
407 aa  242  9e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1456  FolC bifunctional protein  37.35 
 
 
461 aa  242  1e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.363059  normal  0.651546 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0333  FolC bifunctional protein  38.81 
 
 
414 aa  241  2e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0256813  normal  0.0230172 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1041  FolC bifunctional protein  34.61 
 
 
451 aa  241  2e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0897  FolC bifunctional protein  36.78 
 
 
424 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.54283e-31 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1149  FolC bifunctional protein  39.05 
 
 
468 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.498576  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0423  FolC bifunctional protein  37 
 
 
436 aa  241  2.9999999999999997e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.395258  normal  0.0242986 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1549  FolC bifunctional protein  33.41 
 
 
422 aa  240  5e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2780  FolC bifunctional protein  36.49 
 
 
437 aa  238  1e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38262  normal  0.709673 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0325  FolC bifunctional protein  36.13 
 
 
438 aa  238  1e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0087  FolC bifunctional protein  34.73 
 
 
454 aa  239  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0279686 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2308  FolC bifunctional protein  38.13 
 
 
442 aa  237  3e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000091683  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0461  FolC bifunctional protein  35.61 
 
 
408 aa  237  3e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1278  folylpolyglutamate synthase  34.52 
 
 
427 aa  236  5.0000000000000005e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1166  FolC bifunctional protein  38.53 
 
 
452 aa  235  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.343564  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0463  folylpolyglutamate synthase  36.51 
 
 
429 aa  234  2.0000000000000002e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1757  folylpolyglutamate synthetase  37.33 
 
 
443 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000520472  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4359  FolC bifunctional protein  36.14 
 
 
427 aa  233  6e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.601802  normal  0.624925 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0344  FolC bifunctional protein  32.95 
 
 
435 aa  232  9e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1568  FolC bifunctional protein  34.59 
 
 
432 aa  232  9e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0351  FolC bifunctional protein  39.81 
 
 
414 aa  231  1e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.651098 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1236  FolC bifunctional protein  37.71 
 
 
428 aa  231  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1979  FolC bifunctional protein  35.76 
 
 
404 aa  231  2e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2510  FolC bifunctional protein  39.01 
 
 
403 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000623947 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1048  FolC bifunctional protein  36.57 
 
 
433 aa  230  3e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0544  FolC bifunctional protein  36.69 
 
 
425 aa  230  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0426  FolC bifunctional protein  35.9 
 
 
422 aa  229  5e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.776712  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1582  FolC bifunctional protein  37.95 
 
 
447 aa  229  8e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0591  FolC bifunctional protein  36.1 
 
 
474 aa  228  1e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2329  FolC bifunctional protein  36.63 
 
 
426 aa  228  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0971  FolC bifunctional protein  37.67 
 
 
463 aa  227  3e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.764071  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1603  FolC bifunctional protein  36.24 
 
 
420 aa  226  4e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119279  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1480  FolC bifunctional protein  34.6 
 
 
432 aa  226  4e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.293616  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1492  FolC bifunctional protein  35.07 
 
 
432 aa  226  6e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.744207  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3683  folylpolyglutamate synthetase  37.53 
 
 
416 aa  225  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0325  dihydropteroate synthase  35.31 
 
 
878 aa  225  1e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.899871  normal  0.0161218 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1427  FolC bifunctional protein  34.99 
 
 
432 aa  225  1e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.361934  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3525  FolC bifunctional protein  37.13 
 
 
440 aa  224  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0390  FolC bifunctional protein  35.6 
 
 
422 aa  223  6e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000576883  normal  0.0116756 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>