More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1669 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1669  50S ribosomal protein L13  100 
 
 		 142 aa  291  2e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000843127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 		 142 aa  184  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 		 142 aa  184  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0726  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 144 aa  179  9.000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.618323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1032  50S ribosomal protein L13  61.7 
 
 		 163 aa  179  1e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.108398  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0401  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 149 aa  177  5.999999999999999e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 144 aa  177  5.999999999999999e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000157006  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  176  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  175  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  176  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1014  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00728449  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3191  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000050014  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16521  50S ribosomal protein L13  60.28 
 
 		 170 aa  175  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0797487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2681  50S ribosomal protein L13  58.39 
 
 		 142 aa  174  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1747  50S ribosomal protein L13  62.04 
 
 		 142 aa  174  3e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000679553  normal  0.257999 
 
 
 
NC_011761  AFE_3075  50S ribosomal protein L13  58.39 
 
 		 142 aa  174  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0946  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 		 145 aa  174  4e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000305629  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1234  ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  174  4e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00635155  normal  0.252185 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 142 aa  174  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 142 aa  174  5e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 142 aa  174  5e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1155  50S ribosomal protein L13  57.66 
 
 		 146 aa  173  6e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291819  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2355  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 149 aa  173  9e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.310176  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2015  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 150 aa  172  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 145 aa  172  9.999999999999999e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3996  50S ribosomal protein L13  57.66 
 
 		 146 aa  172  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4694  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 142 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00889549  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0901  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 142 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3164  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 142 aa  172  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0732563  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2762  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 144 aa  172  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 142 aa  171  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4741  ribosomal protein L13  60.43 
 
 		 147 aa  172  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000831745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3497  ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 150 aa  171  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000146493  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0969  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 144 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476944 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  59.42 
 
 		 147 aa  171  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4426  ribosomal protein L13  58.39 
 
 		 142 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2635  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 144 aa  171  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23291  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 150 aa  171  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  63.7 
 
 		 143 aa  171  2.9999999999999996e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356517  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  171  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  60.28 
 
 		 149 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100491  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  60.28 
 
 		 149 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  171  3.9999999999999995e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0453  50S ribosomal protein L13  60.58 
 
 		 148 aa  170  5.999999999999999e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0286772  normal  0.569665 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0606  50S ribosomal protein L13  59.44 
 
 		 143 aa  170  5.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.43755e-16  hitchhiker  0.00414003 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0541  ribosomal protein L13  58.39 
 
 		 142 aa  170  6.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3360  50S ribosomal protein L13  57.66 
 
 		 142 aa  170  6.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000892865  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1812  50S ribosomal protein L13  57.86 
 
 		 149 aa  170  6.999999999999999e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.181539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2607  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 144 aa  170  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0161967  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  59.12 
 
 		 142 aa  169  7.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1565  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  169  9e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000267326  normal  0.325038 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0798  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 142 aa  169  9e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  55.47 
 
 		 142 aa  169  9e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  59.12 
 
 		 147 aa  169  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  59.85 
 
 		 142 aa  169  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0422  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 149 aa  169  1e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00538272  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  59.26 
 
 		 145 aa  169  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0138  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 145 aa  169  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000668177  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3071  50S ribosomal protein L13  58.39 
 
 		 142 aa  169  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000152627  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0137  50S ribosomal protein L13  58.52 
 
 		 145 aa  169  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000751399  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2619  50S ribosomal protein L13  58.7 
 
 		 153 aa  168  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2876  50S ribosomal protein L13  59.44 
 
 		 143 aa  168  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000282289  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2842  50S ribosomal protein L13  58.7 
 
 		 153 aa  168  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.890414 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19781  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 150 aa  169  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  60 
 
 		 148 aa  168  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3940  50S ribosomal protein L13  57.66 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1103  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 150 aa  169  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.698543  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0561  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 144 aa  169  2e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000199102  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0506  50S ribosomal protein L13  57.66 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000158843  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3269  50S ribosomal protein L13  57.66 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000128707  hitchhiker  0.00000918521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0678  50S ribosomal protein L13  57.66 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000445483  hitchhiker  0.000251831 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0692  50S ribosomal protein L13  57.66 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000556575  decreased coverage  0.00000194665 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0702  50S ribosomal protein L13  56.93 
 
 		 142 aa  167  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111952  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3864  50S ribosomal protein L13  60.87 
 
 		 147 aa  168  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4254  50S ribosomal protein L13  60.87 
 
 		 147 aa  168  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17141  50S ribosomal protein L13  56.83 
 
 		 143 aa  168  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0575985  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4943  50S ribosomal protein L13  53.52 
 
 		 144 aa  167  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2969  50S ribosomal protein L13  57.97 
 
 		 154 aa  167  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0186742  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0049  ribosomal protein L13  56.93 
 
 		 142 aa  167  4e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1062  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 144 aa  167  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000039802  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0744  50S ribosomal protein L13  57.66 
 
 		 142 aa  167  4e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000518641  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0148  50S ribosomal protein L13  57.97 
 
 		 153 aa  167  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0005  ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 147 aa  167  5e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.903919  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3652  50S ribosomal protein L13  56.93 
 
 		 142 aa  167  5e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000055141  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0732  50S ribosomal protein L13  56.93 
 
 		 142 aa  167  5e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000680495  hitchhiker  0.00347567 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0723  50S ribosomal protein L13  56.93 
 
 		 142 aa  167  5e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000205135  hitchhiker  0.00003559 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0225  50S ribosomal protein L13  58.82 
 
 		 151 aa  167  6e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2994  50S ribosomal protein L13  56.93 
 
 		 143 aa  167  6e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.348957  hitchhiker  0.00829551 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  57.66 
 
 		 147 aa  167  6e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0222  50S ribosomal protein L13  58.82 
 
 		 151 aa  167  6e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0145687  normal  0.0118859 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 145 aa  166  7e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000514694  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17241  50S ribosomal protein L13  57.35 
 
 		 143 aa  166  7e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 147 aa  167  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0165  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 145 aa  166  9e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000103793  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0143  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 145 aa  166  9e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0138  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 145 aa  166  9e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.36726e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0143  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 145 aa  166  9e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000175046  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0156  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 145 aa  166  9e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54845e-34 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0175  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 145 aa  166  9e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000580183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>