33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1607 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1607  hypothetical protein  100 
 
 
79 aa  159  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0628  hypothetical protein  48.1 
 
 
79 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000380142  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2797  ATP synthase protein I  46.58 
 
 
87 aa  64.7  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0200156  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0013  hypothetical protein  39.74 
 
 
82 aa  60.1  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000501969  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1509  hypothetical protein  38.46 
 
 
79 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4013  hypothetical protein  41.1 
 
 
80 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.49788e-30 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3357  hypothetical protein  43.84 
 
 
89 aa  57.4  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000003044  hitchhiker  0.0072657 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2667  hypothetical protein  40.26 
 
 
78 aa  57.4  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000715899  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3929  hypothetical protein  39.73 
 
 
80 aa  57  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000115703  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2064  ATP synthase protein I  35.8 
 
 
92 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.109834 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0336  hypothetical protein  43.24 
 
 
81 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00273364  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3140  hypothetical protein  37.97 
 
 
80 aa  55.1  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000379803  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2089  ATP synthase protein I  43.33 
 
 
101 aa  54.7  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0218096  normal  0.87278 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1386  ATP synthase protein I  35.9 
 
 
91 aa  52.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1583  ATP synthase protein I  42.37 
 
 
71 aa  52.4  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0022057  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2698  ATP synthase protein I  37.18 
 
 
91 aa  50.4  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0744  hypothetical protein  35 
 
 
123 aa  48.9  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.32586  normal  0.360588 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4246  hypothetical protein  35.44 
 
 
93 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000585685  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4474  hypothetical protein  39.29 
 
 
83 aa  47.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2252  hypothetical protein  37.1 
 
 
118 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00019318  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3423  hypothetical protein  31.08 
 
 
73 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1033  hypothetical protein  34.62 
 
 
93 aa  45.4  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.24218  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3104  H(+)-transporting ATP synthase, gene 1  36.36 
 
 
112 aa  44.3  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.496564  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3051  F0F1-ATPase subunit, putative  30 
 
 
125 aa  43.9  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3247  hypothetical protein  39.58 
 
 
123 aa  43.5  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3823  hypothetical protein  46 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0442976 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0499  ATP sythase I  29.23 
 
 
132 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.417293  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1055  F0F1-ATPase subunit  27.54 
 
 
105 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_496  hypothetical protein  44.23 
 
 
77 aa  42  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000000569038  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4173  hypothetical protein  30.16 
 
 
75 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00132709  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1980  FoF1 ATP synthase, subunit I  31.67 
 
 
127 aa  40.8  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.596839  normal  0.0599038 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2389  hypothetical protein  28.17 
 
 
87 aa  40.8  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3311  uncharacterized small membrane protein  42.22 
 
 
73 aa  40.4  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000828544  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>