More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1597 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_4057  beta-lactamase domain protein  57.17 
 
 
558 aa  660    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0366  hypothetical protein  58.41 
 
 
558 aa  684    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0664287  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4393  beta-lactamase domain-containing protein  58.91 
 
 
558 aa  662    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0728616  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3415  beta-lactamase domain protein  55.35 
 
 
593 aa  646    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1597  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
561 aa  1131    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3971  beta-lactamase domain protein  56.63 
 
 
558 aa  657    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313503  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0383  beta-lactamase domain-containing protein  54.94 
 
 
569 aa  634  1e-180  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3113  metallo-beta-lactamase family protein  55.2 
 
 
533 aa  617  1e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2028  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  50.64 
 
 
555 aa  599  1e-170  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1069  hypothetical protein  51.45 
 
 
555 aa  597  1e-169  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000100194  normal  0.0563275 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0947  beta-lactamase domain-containing protein  52 
 
 
554 aa  597  1e-169  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1745  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase family protein  50.46 
 
 
555 aa  596  1e-169  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1268  metallo-beta-lactamase family protein  49.91 
 
 
553 aa  595  1e-169  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000954754  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1494  beta-lactamase domain-containing protein  50.27 
 
 
560 aa  592  1e-168  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000870726  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3163  beta-lactamase domain protein  52.26 
 
 
554 aa  591  1e-167  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1938  beta-lactamase domain-containing protein  51.73 
 
 
554 aa  589  1e-167  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2585  beta-lactamase domain-containing protein  51.91 
 
 
549 aa  591  1e-167  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0424665  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3657  beta-lactamase domain protein  49.46 
 
 
554 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000145039  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1816  beta-lactamase domain-containing protein  50.72 
 
 
559 aa  578  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000137497  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0645  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  51.27 
 
 
564 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000101529  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1772  beta-lactamase domain protein  50.09 
 
 
555 aa  570  1e-161  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0198506  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08700  beta-lactamase domain protein  49.38 
 
 
558 aa  568  1e-160  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000465654  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1302  hypothetical protein  50.09 
 
 
555 aa  562  1.0000000000000001e-159  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1678  beta-lactamase domain protein  49.18 
 
 
553 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1939  beta-lactamase domain protein  49.45 
 
 
555 aa  558  1e-157  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0941  beta-lactamase domain protein  47.82 
 
 
560 aa  555  1e-157  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2294  beta-lactamase domain-containing protein  47.13 
 
 
618 aa  549  1e-155  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0627  beta-lactamase domain protein  49.64 
 
 
555 aa  548  1e-154  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.223093  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1150  beta-lactamase domain protein  47.54 
 
 
548 aa  543  1e-153  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2926  beta-lactamase domain protein  48.21 
 
 
553 aa  536  1e-151  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.440144 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3567  beta-lactamase domain-containing protein  46.07 
 
 
556 aa  537  1e-151  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00558369  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3809  metallo-beta-lactamase family protein  46.07 
 
 
556 aa  534  1e-150  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2993599999999999e-37 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3833  metallo-beta-lactamase family protein  46.07 
 
 
556 aa  534  1e-150  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000419922  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3648  metallo-beta-lactamase family protein  46.07 
 
 
556 aa  534  1e-150  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3538  metallo-beta-lactamase family protein  46.07 
 
 
556 aa  535  1e-150  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0178756  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3845  metallo-beta-lactamase family protein  46.07 
 
 
556 aa  534  1e-150  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000592634  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3556  metallo-beta-lactamase family protein  46.07 
 
 
556 aa  534  1e-150  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1403  metallo-beta-lactamase family protein  45.89 
 
 
556 aa  533  1e-150  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0055609  hitchhiker  0.000000000000158477 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3933  metallo-beta-lactamase family protein  46.07 
 
 
556 aa  534  1e-150  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00612119  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2449  beta-lactamase domain-containing protein  46.36 
 
 
583 aa  534  1e-150  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0351233  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1460  beta-lactamase domain protein  46.01 
 
 
566 aa  533  1e-150  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3896  metallo-beta-lactamase family protein  45.54 
 
 
556 aa  530  1e-149  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0341705  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1420  hypothetical protein  46.27 
 
 
547 aa  524  1e-147  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128957  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1460  beta-lactamase domain protein  47.27 
 
 
551 aa  523  1e-147  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000017363  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3804  beta-lactamase domain-containing protein  45.52 
 
 
555 aa  522  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.199247  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_380  metallo-beta-lactamase  46.65 
 
 
551 aa  522  1e-147  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0438  metallo-beta-lactamase family protein  46.47 
 
 
551 aa  521  1e-146  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.386369  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4026  hypothetical protein  45.34 
 
 
555 aa  521  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0999117  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3887  hypothetical protein  45.34 
 
 
555 aa  520  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0624715  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3719  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  45.34 
 
 
555 aa  520  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.998295  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3735  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  45.34 
 
 
555 aa  520  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4080  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  44.99 
 
 
555 aa  519  1e-146  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0747948  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3992  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  45.34 
 
 
555 aa  520  1e-146  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0415  beta-lactamase domain-containing protein  46.47 
 
 
551 aa  521  1e-146  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.223724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4190  hypothetical protein  45.34 
 
 
555 aa  520  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2679  beta-lactamase domain-containing protein  44.81 
 
 
555 aa  519  1e-146  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000157483  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4097  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  45.34 
 
 
555 aa  520  1e-146  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000534796  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1160  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  44.81 
 
 
555 aa  519  1e-146  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121903  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0947  beta-lactamase domain protein  46.07 
 
 
555 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164083  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2198  metallo-beta-lactamase superfamily protein  43.99 
 
 
555 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2092  beta-lactamase-like  48.01 
 
 
556 aa  517  1.0000000000000001e-145  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.471204  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2375  beta-lactamase domain protein  44.75 
 
 
550 aa  513  1e-144  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.796055  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2106  beta-lactamase domain-containing protein  46.03 
 
 
554 aa  510  1e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1781  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  45.19 
 
 
557 aa  509  1e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0160352  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1137  metallo-beta-lactamase family protein  47.7 
 
 
554 aa  511  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0025628  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1827  beta-lactamase domain protein  45.34 
 
 
555 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0796  beta-lactamase domain protein  45.65 
 
 
553 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1730  metallo-beta-lactamase family protein  44.46 
 
 
557 aa  502  1e-141  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.744262  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1522  metallo-beta-lactamase family protein  44.65 
 
 
557 aa  504  1e-141  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0439193  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1494  Zn-dependent hydrolase  44.65 
 
 
557 aa  504  1e-141  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000794402  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1484  Zn-dependent hydrolase  44.46 
 
 
557 aa  503  1e-141  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000568728  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1707  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  44.65 
 
 
557 aa  504  1e-141  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1676  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  44.28 
 
 
557 aa  500  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0518689  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3668  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  44.46 
 
 
557 aa  501  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000237244  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2447  beta-lactamase domain protein  44.85 
 
 
557 aa  499  1e-140  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1616  beta-lactamase domain-containing protein  47.58 
 
 
559 aa  500  1e-140  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0224319  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0676  metallo-beta-lactamase family protein  42.81 
 
 
560 aa  495  1e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3518  beta-lactamase domain protein  45.64 
 
 
552 aa  498  1e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000333928  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0864  beta-lactamase domain protein  46.46 
 
 
552 aa  497  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.412848  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0875  beta-lactamase domain-containing protein  45.5 
 
 
561 aa  494  9.999999999999999e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0942136  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1171  beta-lactamase domain-containing protein  42.63 
 
 
565 aa  493  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1149  beta-lactamase domain-containing protein  42.63 
 
 
565 aa  493  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4078  beta-lactamase domain-containing protein  45.68 
 
 
561 aa  493  9.999999999999999e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35741  normal  0.385079 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1171  beta-lactamase domain protein  43.68 
 
 
555 aa  489  1e-137  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000121599  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1333  beta-lactamase domain-containing protein  43.58 
 
 
557 aa  485  1e-135  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4272  beta-lactamase domain-containing protein  44.65 
 
 
568 aa  482  1e-135  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2063  beta-lactamase domain protein  44.08 
 
 
556 aa  483  1e-135  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0478  beta-lactamase domain protein  43.9 
 
 
572 aa  478  1e-134  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0095  Beta-lactamase-like protein  45.7 
 
 
550 aa  481  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.560108  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0179  beta-lactamase domain protein  42.31 
 
 
591 aa  481  1e-134  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0102  beta-lactamase domain protein  45.95 
 
 
546 aa  479  1e-134  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0113  beta-lactamase domain protein  46.13 
 
 
546 aa  481  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0324  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  43.19 
 
 
561 aa  481  1e-134  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1242  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  45.07 
 
 
573 aa  481  1e-134  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.752598  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1623  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  42.4 
 
 
560 aa  480  1e-134  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3238  beta-lactamase domain protein  43.76 
 
 
556 aa  476  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.015572  normal  0.303561 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0647  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  44.46 
 
 
561 aa  476  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1747  metallo-beta-lactamase family protein  41.73 
 
 
677 aa  474  1e-132  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4416  beta-lactamase domain-containing protein  42.2 
 
 
569 aa  473  1e-132  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1749  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  43.01 
 
 
560 aa  475  1e-132  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.568373  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>