More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1595 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1595  single-strand binding protein  100 
 
 		 184 aa  377  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  47.67 
 
 		 165 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  48.77 
 
 		 157 aa  145  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  46.78 
 
 		 166 aa  142  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  46.71 
 
 		 157 aa  141  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  46.43 
 
 		 159 aa  142  4e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  46.43 
 
 		 159 aa  140  8e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  49.41 
 
 		 158 aa  140  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  47.9 
 
 		 164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  46.34 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  49.41 
 
 		 158 aa  139  3e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  44.17 
 
 		 148 aa  138  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  46.58 
 
 		 156 aa  138  6e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  43.56 
 
 		 146 aa  137  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  46.58 
 
 		 156 aa  138  6e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0056  single-stranded DNA-binding protein  47.19 
 
 		 175 aa  137  7e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.564154 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  44.79 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2303  single-strand binding protein  44.77 
 
 		 171 aa  135  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0375599  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  42.08 
 
 		 172 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0312  single-strand binding protein  49.4 
 
 		 168 aa  135  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000035276 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  56.07 
 
 		 146 aa  134  5e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  47.66 
 
 		 139 aa  134  9e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  43.37 
 
 		 161 aa  134  9e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  44.83 
 
 		 188 aa  134  9e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  47.66 
 
 		 139 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0108  single-strand DNA-binding protein  47.06 
 
 		 175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.127981 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2576  single-strand binding protein  57.52 
 
 		 158 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0200  single-strand binding protein  46.88 
 
 		 139 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  46.01 
 
 		 143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  43.18 
 
 		 190 aa  131  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  42.94 
 
 		 152 aa  131  6e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0107  single-strand binding protein  44.12 
 
 		 165 aa  131  6e-30  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0655467  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4105  single-strand binding protein  47.98 
 
 		 181 aa  131  6e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  44.25 
 
 		 174 aa  131  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  56.88 
 
 		 186 aa  130  9e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0066  single-stranded DNA-binding protein  47.65 
 
 		 150 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0051  single-stranded DNA-binding protein  44.89 
 
 		 175 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.772758  normal  0.0108774 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  45.56 
 
 		 156 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0620  single-stranded DNA-binding protein  45.71 
 
 		 182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.210142  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  44.05 
 
 		 151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  54.03 
 
 		 236 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  44.2 
 
 		 177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  54.03 
 
 		 234 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  54.03 
 
 		 234 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  54.03 
 
 		 234 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  54.03 
 
 		 236 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  46.7 
 
 		 171 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0261  single-strand binding protein  53.57 
 
 		 163 aa  128  4.0000000000000003e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0918801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  54.87 
 
 		 231 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  40.99 
 
 		 161 aa  127  6e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  51.15 
 
 		 196 aa  128  6e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  51.38 
 
 		 200 aa  127  6e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  58.25 
 
 		 234 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  54.87 
 
 		 238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  54.87 
 
 		 222 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  43.56 
 
 		 157 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0002  single-stranded DNA-binding protein  44.89 
 
 		 175 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  42.94 
 
 		 146 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3720  single-strand binding protein  39.88 
 
 		 143 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0533  single-strand binding protein  56.86 
 
 		 236 aa  125  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0176705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3772  single-strand binding protein  41.21 
 
 		 167 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  44.91 
 
 		 151 aa  125  4.0000000000000003e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  55.66 
 
 		 167 aa  125  5e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1033  single-stranded DNA-binding protein  55.05 
 
 		 191 aa  125  5e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.391899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3419  single-strand binding protein  56.86 
 
 		 236 aa  124  5e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0354621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3590  single-strand binding protein  56.86 
 
 		 235 aa  125  5e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0152827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0044  single-strand binding protein  57.14 
 
 		 137 aa  124  6e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.139232  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  41.72 
 
 		 147 aa  124  7e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  44.97 
 
 		 178 aa  124  8.000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  44.97 
 
 		 178 aa  124  8.000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  44.97 
 
 		 178 aa  124  8.000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1545  single-strand binding protein  51.43 
 
 		 166 aa  124  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00898888  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  44.97 
 
 		 178 aa  124  8.000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  44.97 
 
 		 178 aa  124  8.000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  44.97 
 
 		 178 aa  124  8.000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  44.97 
 
 		 178 aa  124  8.000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  44.97 
 
 		 178 aa  124  8.000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3512  single-stranded DNA-binding protein  56.64 
 
 		 176 aa  123  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.534706  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3307  single-strand binding protein  45.4 
 
 		 167 aa  123  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358097  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3662  single-stranded DNA-binding protein  58.65 
 
 		 180 aa  122  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  41.53 
 
 		 184 aa  122  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  59.09 
 
 		 154 aa  123  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3710  single-strand binding protein  54.55 
 
 		 242 aa  122  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000568362  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4439  single-strand binding protein  56.64 
 
 		 181 aa  122  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.580245  normal  0.977465 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0868  single-stranded DNA-binding protein  55.65 
 
 		 165 aa  121  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4598  single-stranded DNA-binding protein  48.3 
 
 		 176 aa  121  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4650  single-stranded DNA-binding protein  48.3 
 
 		 176 aa  121  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0535  single-strand binding protein  54.55 
 
 		 220 aa  122  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4512  single-stranded DNA-binding protein  48.3 
 
 		 176 aa  121  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4599  single-stranded DNA-binding protein  48.3 
 
 		 176 aa  121  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09200  single-stranded DNA-binding protein  55.65 
 
 		 165 aa  121  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0140345  normal  0.797582 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4504  single-stranded DNA-binding protein  48.3 
 
 		 176 aa  121  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1694  single-stranded DNA-binding protein  42.77 
 
 		 148 aa  121  5e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0633  single-stranded DNA-binding protein  42.22 
 
 		 172 aa  121  5e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000194148  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0640  single-strand binding protein  56.36 
 
 		 225 aa  121  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000164603  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  39.67 
 
 		 173 aa  121  7e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0748  single-strand binding protein  52 
 
 		 174 aa  121  7e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.810085  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0315  single-stranded DNA-binding protein  54.21 
 
 		 181 aa  120  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5215  single-stranded DNA-binding protein  55.56 
 
 		 177 aa  120  9e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.693787 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0996  single-stranded DNA-binding protein  54.55 
 
 		 175 aa  120  9e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000269191  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>