More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1580 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1580  30S ribosomal protein S11  100 
 
 		 130 aa  263  5e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0220248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0704  30S ribosomal protein S11  75.4 
 
 		 131 aa  210  3.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000283991  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0870  30S ribosomal protein S11  76.38 
 
 		 131 aa  207  4e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000918972  hitchhiker  0.00608711 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2759  ribosomal protein S11  74.62 
 
 		 129 aa  203  6e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2293  30S ribosomal protein S11  73.08 
 
 		 129 aa  203  8e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2252  30S ribosomal protein S11  73.08 
 
 		 129 aa  203  8e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0467149  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1772  30S ribosomal protein S11  76.86 
 
 		 129 aa  203  8e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586668  normal  0.347372 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1806  30S ribosomal protein S11  73.08 
 
 		 129 aa  202  9e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.533264  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0731  ribosomal protein S11  76.86 
 
 		 128 aa  202  1e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000706792  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1637  30S ribosomal protein S11  73.85 
 
 		 129 aa  201  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0662534  normal  0.0192025 
 
 
-
 
NC_004310  BR1210  30S ribosomal protein S11  73.85 
 
 		 129 aa  199  9.999999999999999e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1979  30S ribosomal protein S11  73.85 
 
 		 129 aa  199  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38607  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1173  30S ribosomal protein S11  73.85 
 
 		 129 aa  199  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.067515  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2037  30S ribosomal protein S11  71.54 
 
 		 129 aa  198  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.594548  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1866  30S ribosomal protein S11  73.08 
 
 		 129 aa  198  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2989  30S ribosomal protein S11  70 
 
 		 130 aa  198  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.108591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2990  30S ribosomal protein S11  71.54 
 
 		 129 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.319049 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1009  30S ribosomal protein S11  72.31 
 
 		 129 aa  197  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636565  normal  0.191083 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1371  30S ribosomal protein S11  77.39 
 
 		 130 aa  197  6e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.202358  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1931  30S ribosomal protein S11  70.77 
 
 		 129 aa  196  7e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0330  30S ribosomal protein S11  70.77 
 
 		 129 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0651  30S ribosomal protein S11  77.39 
 
 		 131 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.5695  hitchhiker  0.00000456607 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0308  30S ribosomal protein S11  72.31 
 
 		 129 aa  196  1.0000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.331019 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2665  30S ribosomal protein S11  73.55 
 
 		 129 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1923  30S ribosomal protein S11  69.23 
 
 		 130 aa  195  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.194942  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0783  30S ribosomal protein S11  72.31 
 
 		 129 aa  195  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.483609  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2833  30S ribosomal protein S11  76.52 
 
 		 131 aa  194  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279532  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1568  30S ribosomal protein S11  69.23 
 
 		 130 aa  194  3e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0898739  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3643  30S ribosomal protein S11  73.23 
 
 		 129 aa  194  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360656  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1327  30S ribosomal protein S11  73.08 
 
 		 129 aa  194  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.784215 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2318  30S ribosomal protein S11  71.54 
 
 		 129 aa  193  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163155  normal  0.411932 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1387  30S ribosomal protein S11  69.23 
 
 		 130 aa  193  6e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.368178 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0278  30S ribosomal protein S11  70.77 
 
 		 129 aa  193  7e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.778856  normal  0.618273 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1655  30S ribosomal protein S11  77.59 
 
 		 129 aa  193  8.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5047  30S ribosomal protein S11  70 
 
 		 129 aa  192  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0249835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2141  30S ribosomal protein S11  70 
 
 		 129 aa  192  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0566  30S ribosomal protein S11  72.31 
 
 		 129 aa  192  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.628191 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2193  30S ribosomal protein S11  70 
 
 		 129 aa  192  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0789543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3425  30S ribosomal protein S11  71.65 
 
 		 129 aa  191  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185884 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1090  30S ribosomal protein S11  74.78 
 
 		 131 aa  191  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.258039  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1453  30S ribosomal protein S11  76.72 
 
 		 129 aa  191  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.067537  normal  0.300566 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1355  30S ribosomal protein S11  76.72 
 
 		 129 aa  191  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00844113  normal  0.387403 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2930  30S ribosomal protein S11  79.23 
 
 		 134 aa  190  5e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000145745  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0726  30S ribosomal protein S11  76.98 
 
 		 131 aa  190  6e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.873114  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0131  30S ribosomal protein S11  74.62 
 
 		 129 aa  189  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000108519  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0137  30S ribosomal protein S11  77.69 
 
 		 129 aa  188  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000197157  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0133  30S ribosomal protein S11  77.69 
 
 		 129 aa  188  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3161  30S ribosomal protein S11  75.86 
 
 		 129 aa  187  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.560785  normal  0.304254 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0076  30S ribosomal protein S11  62.96 
 
 		 135 aa  186  8e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0893  30S ribosomal protein S11  72.31 
 
 		 130 aa  186  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494342  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19730  SSU ribosomal protein S11P  67.94 
 
 		 131 aa  186  1e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  normal  0.755388 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0251  ribosomal protein S11  73.85 
 
 		 128 aa  186  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118892  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0790  30S ribosomal protein S11  68.5 
 
 		 129 aa  185  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0644212  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2528  30S ribosomal protein S11  74.62 
 
 		 129 aa  184  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.481275  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0616  30S ribosomal protein S11  67.69 
 
 		 129 aa  182  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2306  30S ribosomal protein S11  74.62 
 
 		 130 aa  182  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00552164  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1549  ribosomal protein S11  67.94 
 
 		 131 aa  182  1.0000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4938  30S ribosomal protein S11  70.69 
 
 		 137 aa  182  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000118735  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3156  30S ribosomal protein S11  66.4 
 
 		 132 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.980301  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0428  30S ribosomal protein S11  66.92 
 
 		 130 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.316417  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00961  30S ribosomal protein S11  63.85 
 
 		 130 aa  182  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000322377  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0835  30S ribosomal protein S11  65.89 
 
 		 131 aa  181  2.0000000000000003e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.633352  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1012  30S ribosomal protein S11  63.08 
 
 		 130 aa  181  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00012191  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0181  30S ribosomal protein S11  63.85 
 
 		 130 aa  181  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000807145  hitchhiker  0.00156032 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3293  30S ribosomal protein S11  66.94 
 
 		 133 aa  181  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0312  30S ribosomal protein S11  73.85 
 
 		 129 aa  181  3e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.830269  normal  0.250998 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0236  30S ribosomal protein S11  64.62 
 
 		 130 aa  181  3e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000127993  unclonable  0.00000919144 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0273  30S ribosomal protein S11  64.62 
 
 		 133 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0134293 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3780  30S ribosomal protein S11  64.62 
 
 		 133 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2608  30S ribosomal protein S11  64.62 
 
 		 133 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3502  30S ribosomal protein S11  64.62 
 
 		 133 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3752  30S ribosomal protein S11  64.62 
 
 		 133 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.347959  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3471  30S ribosomal protein S11  64.62 
 
 		 133 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.905571  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3044  30S ribosomal protein S11  64.62 
 
 		 133 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.21907  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0351  30S ribosomal protein S11  64.62 
 
 		 133 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161221 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2735  30S ribosomal protein S11  64.62 
 
 		 133 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3722  30S ribosomal protein S11  64.62 
 
 		 133 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.113628  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0130  30S ribosomal protein S11  75.38 
 
 		 129 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000100663  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0300  30S ribosomal protein S11  64.62 
 
 		 133 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0251281  normal  0.0760469 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0481  30S ribosomal protein S11  62.31 
 
 		 130 aa  181  4.0000000000000006e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0171  30S ribosomal protein S11  64.62 
 
 		 130 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000137898  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0291  30S ribosomal protein S11  64.62 
 
 		 133 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3145  30S ribosomal protein S11  64.62 
 
 		 133 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171287  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0372  30S ribosomal protein S11  64.62 
 
 		 133 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557439  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1948  30S ribosomal protein S11  64.62 
 
 		 133 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.666677  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4667  30S ribosomal protein S11  63.08 
 
 		 130 aa  180  5.0000000000000004e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000031185  unclonable  0.00000000812252 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0207  30S ribosomal protein S11  63.08 
 
 		 130 aa  180  6e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000194302  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3981  30S ribosomal protein S11  73.08 
 
 		 129 aa  180  6e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0764939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0338  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 		 134 aa  180  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578  normal  0.0241058 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2815  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 		 134 aa  180  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769737  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3620  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 		 134 aa  180  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000402768  hitchhiker  0.00000000105746 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2995  30S ribosomal protein S11  66.12 
 
 		 133 aa  180  7e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0512  30S ribosomal protein S11  67.48 
 
 		 129 aa  180  7e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.11652  hitchhiker  0.00952872 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0193  30S ribosomal protein S11  63.85 
 
 		 130 aa  180  7e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310597  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0507  30S ribosomal protein S11  67.48 
 
 		 129 aa  180  7e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00376989  normal  0.069652 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0157  30S ribosomal protein S11  75.38 
 
 		 129 aa  179  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000139705  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5169  30S ribosomal protein S11  75.38 
 
 		 129 aa  179  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000115107  unclonable  6.58795e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0136  30S ribosomal protein S11  74.62 
 
 		 129 aa  179  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000120861  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4219  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 		 134 aa  179  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.815037  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0624  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 		 134 aa  179  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>