More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1579 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1579  30S ribosomal protein S13  100 
 
 		 124 aa  252  1.0000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1089  30S ribosomal protein S13  77.05 
 
 		 122 aa  192  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0717686  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1370  ribosomal protein S13  76.23 
 
 		 122 aa  189  8e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0625987  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0650  30S ribosomal protein S13  74.59 
 
 		 122 aa  189  8e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.221495  hitchhiker  0.00000484055 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0703  30S ribosomal protein S13  75.41 
 
 		 122 aa  188  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885174  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0725  30S ribosomal protein S13  72.13 
 
 		 122 aa  185  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2834  30S ribosomal protein S13  71.31 
 
 		 122 aa  184  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161157  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3304  30S ribosomal protein S13  71.31 
 
 		 122 aa  184  5e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001925 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0957  30S ribosomal protein S13  71.31 
 
 		 122 aa  184  5e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.787526  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2752  30S ribosomal protein S13  69.11 
 
 		 123 aa  182  9e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0240  30S ribosomal protein S13  69.11 
 
 		 123 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.696841  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0683  30S ribosomal protein S13  69.67 
 
 		 122 aa  181  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  70.73 
 
 		 123 aa  181  3e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2042  30S ribosomal protein S13  69.92 
 
 		 123 aa  181  4.0000000000000006e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00070968  hitchhiker  0.000175358 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  67.21 
 
 		 122 aa  180  6e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  69.11 
 
 		 123 aa  179  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3982  30S ribosomal protein S13  71.77 
 
 		 127 aa  178  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0746926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  69.67 
 
 		 122 aa  178  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1742  30S ribosomal protein S13  68.03 
 
 		 122 aa  177  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0498579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  68.85 
 
 		 125 aa  176  9e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1935  30S ribosomal protein S13  67.5 
 
 		 127 aa  176  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610956 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0102  30S ribosomal protein S13  67.21 
 
 		 122 aa  175  2e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158693 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0250  ribosomal protein S13  65.85 
 
 		 123 aa  175  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000527618  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  65.04 
 
 		 124 aa  174  3e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2666  30S ribosomal protein S13  67.21 
 
 		 122 aa  174  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2434  30S ribosomal protein S13  67.48 
 
 		 123 aa  174  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0730  30S ribosomal protein S13  70.69 
 
 		 127 aa  174  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000175069  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2234  30S ribosomal protein S13  67.21 
 
 		 122 aa  173  6e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0232268  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1639  ribosomal protein S13  67.21 
 
 		 126 aa  172  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0220  SSU ribosomal protein S13P  66.12 
 
 		 121 aa  172  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.953183 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2307  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 122 aa  172  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00023627  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2042  30S ribosomal protein S13  65 
 
 		 128 aa  172  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1922  30S ribosomal protein S13  65.25 
 
 		 128 aa  171  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1957  30S ribosomal protein S13  65.25 
 
 		 128 aa  171  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3970  ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 121 aa  171  2.9999999999999996e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0784  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 122 aa  171  3.9999999999999995e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0056634  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0869  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 122 aa  171  3.9999999999999995e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000182214  hitchhiker  0.00600411 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0311  ribosomal protein S13  63.41 
 
 		 123 aa  170  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.860174  normal  0.358609 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2594  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 126 aa  170  5.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0246557  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0132  30S ribosomal protein S13  66.39 
 
 		 121 aa  170  7.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1843  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 126 aa  169  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2131  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 122 aa  168  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523363  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0626  ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 125 aa  168  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2929  30S ribosomal protein S13  63.41 
 
 		 123 aa  167  5e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141788  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2807  ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 122 aa  167  5e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000334253  hitchhiker  0.00000000478637 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4937  30S ribosomal protein S13  61.29 
 
 		 127 aa  167  6e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000115792  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3426  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 122 aa  165  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.968346  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1386  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 122 aa  165  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0277  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 122 aa  165  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.630615 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1008  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 122 aa  165  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.836667  normal  0.0493097 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2882  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 126 aa  164  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.617187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1251  30S ribosomal protein S13  62.9 
 
 		 127 aa  164  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00631403  normal  0.17118 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1110  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 124 aa  164  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1139  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 124 aa  164  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.732173  normal  0.382275 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1127  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 124 aa  164  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01420  ribosomal protein S13  65.04 
 
 		 122 aa  164  4e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000243035  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5170  30S ribosomal protein S13  65.57 
 
 		 121 aa  164  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000106186  unclonable  6.58795e-26 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0866  ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 126 aa  164  5e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.336367  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01420  SSU ribosomal protein S13P  61.48 
 
 		 122 aa  164  5e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.15354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2253  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 121 aa  163  5.9999999999999996e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.025499  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2294  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 121 aa  163  5.9999999999999996e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0720  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 122 aa  163  8e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.401773  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1865  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 122 aa  163  9e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2758  ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 122 aa  162  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221978 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0135  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 121 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000332211  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0129  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 121 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000082296  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2988  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 125 aa  162  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.24286  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0135  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 121 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000270668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0130  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 121 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  5.1035300000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0128  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 121 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000380498  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0148  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 121 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.03785e-60 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1452  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 122 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0642708  normal  0.430095 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0135  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 121 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000525555  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1567  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 122 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0795251  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3642  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 122 aa  162  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195969  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0156  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 121 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000111603  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1136  ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 122 aa  162  1.0000000000000001e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000957458  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2688  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 121 aa  162  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2373  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 121 aa  162  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.768244  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0166  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 121 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000872047  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1354  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 122 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0146999  normal  0.399807 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0136  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 121 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000207382  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0423  ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 125 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4776  ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 122 aa  161  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000216682 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3644  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 122 aa  161  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.17106  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1211  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 122 aa  161  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.304522  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2317  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 122 aa  161  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.572032  normal  0.403503 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4973  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 124 aa  161  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0961  ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 126 aa  161  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0130  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 121 aa  161  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000556039  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1174  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 122 aa  161  3e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.119406  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1720  30S ribosomal protein S13  61.29 
 
 		 124 aa  160  4.0000000000000004e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1433  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 124 aa  161  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.702882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19740  SSU ribosomal protein S13P  60.16 
 
 		 123 aa  160  4.0000000000000004e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00164832  normal  0.957321 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1978  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 122 aa  160  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.234  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0208  30S ribosomal protein S13  65.81 
 
 		 127 aa  161  4.0000000000000004e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.681731  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3162  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 122 aa  160  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.548712  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1737  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 122 aa  160  6e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2512  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 122 aa  160  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0383  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 122 aa  160  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.087289  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>