More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1562 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1562  50S ribosomal protein L16  100 
 
 		 138 aa  280  4.0000000000000003e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0633  50S ribosomal protein L16  71.32 
 
 		 140 aa  213  5.9999999999999996e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000966771  hitchhiker  0.00000000446584 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0715  50S ribosomal protein L16  73.33 
 
 		 137 aa  213  9.999999999999999e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.77301  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2850  50S ribosomal protein L16  71.32 
 
 		 140 aa  211  3.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.867321  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1074  50S ribosomal protein L16  71.53 
 
 		 140 aa  210  3.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000319005  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0708  50S ribosomal protein L16  70.8 
 
 		 141 aa  208  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000940858  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3321  50S ribosomal protein L16  68.61 
 
 		 140 aa  207  5e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000147904 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0940  50S ribosomal protein L16  68.61 
 
 		 140 aa  207  5e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00197835  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0687  50S ribosomal protein L16  70.59 
 
 		 140 aa  206  8e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.129729  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0874  50S ribosomal protein L16  68.61 
 
 		 144 aa  202  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000946353  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1233  50S ribosomal protein L16  68.89 
 
 		 139 aa  201  4e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000804114 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3710  50S ribosomal protein L16  69.85 
 
 		 139 aa  200  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0242  50S ribosomal protein L16  66.91 
 
 		 139 aa  199  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1738  50S ribosomal protein L16  68.38 
 
 		 147 aa  199  9.999999999999999e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000521329  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0245  50S ribosomal protein L16  66.91 
 
 		 139 aa  199  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1353  50S ribosomal protein L16  69.4 
 
 		 140 aa  198  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2910  50S ribosomal protein L16  69.57 
 
 		 145 aa  197  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23091  50S ribosomal protein L16  68.12 
 
 		 158 aa  197  5e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0698  50S ribosomal protein L16  67.39 
 
 		 142 aa  197  5e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000251243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1299  50S ribosomal protein L16  65.93 
 
 		 140 aa  197  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.210849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0609  ribosomal protein L16  68.12 
 
 		 140 aa  196  6e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.817649 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01240  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 144 aa  196  7.999999999999999e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2566  50S ribosomal protein L16  68.66 
 
 		 141 aa  196  1.0000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2225  50S ribosomal protein L16  67.15 
 
 		 142 aa  196  1.0000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.877159  normal  0.84916 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0201  50S ribosomal protein L16  65.69 
 
 		 144 aa  194  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.126239  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2707  50S ribosomal protein L16  66.91 
 
 		 144 aa  194  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2392  50S ribosomal protein L16  66.91 
 
 		 144 aa  194  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1940  50S ribosomal protein L16  67.39 
 
 		 138 aa  194  3e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1517  ribosomal protein L16  67.41 
 
 		 151 aa  194  3e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.592014  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0849  ribosomal protein L16  67.39 
 
 		 144 aa  194  3e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2025  50S ribosomal protein L16  67.39 
 
 		 138 aa  194  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.755365  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1939  50S ribosomal protein L16  66.67 
 
 		 138 aa  194  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2704  ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 145 aa  194  4.0000000000000005e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.589348  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16711  50S ribosomal protein L16  66.67 
 
 		 179 aa  194  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0296  50S ribosomal protein L16  67.65 
 
 		 139 aa  193  8.000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1918  50S ribosomal protein L16  65.22 
 
 		 138 aa  191  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.573905 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1844  50S ribosomal protein L16  68.38 
 
 		 139 aa  192  2e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.242343  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0429  50S ribosomal protein L16  64.96 
 
 		 145 aa  191  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0009964  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19961  50S ribosomal protein L16  62.86 
 
 		 161 aa  191  3e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.64825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0667  50S ribosomal protein L16  67.88 
 
 		 137 aa  191  4e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00972373  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2326  50S ribosomal protein L16  63.5 
 
 		 144 aa  190  5e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000195214  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1962  50S ribosomal protein L16  66.19 
 
 		 158 aa  190  6e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0504  50S ribosomal protein L16  68.89 
 
 		 138 aa  190  6e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.110652  hitchhiker  0.000000000243822 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0334  50S ribosomal protein L16  68.89 
 
 		 138 aa  190  6e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0190  50S ribosomal protein L16  65.94 
 
 		 140 aa  189  8e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.307321 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1122  50S ribosomal protein L16  62.14 
 
 		 161 aa  189  1e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2289  50S ribosomal protein L16  65.69 
 
 		 139 aa  189  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386576  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0765  50S ribosomal protein L16  66.67 
 
 		 145 aa  189  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000894235  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0188  50S ribosomal protein L16  65.44 
 
 		 139 aa  188  2e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000404592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0369  50S ribosomal protein L16  67.41 
 
 		 158 aa  188  2e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0086  50S ribosomal protein L16  67.15 
 
 		 137 aa  188  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0391105 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3005  50S ribosomal protein L16  64.71 
 
 		 137 aa  188  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.840277  hitchhiker  0.00634453 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1758  50S ribosomal protein L16  67.15 
 
 		 137 aa  188  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.160083  normal  0.394515 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2250  50S ribosomal protein L16  64.23 
 
 		 137 aa  188  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000631878  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0112  50S ribosomal protein L16  62.5 
 
 		 144 aa  187  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000501448  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3436  50S ribosomal protein L16  68.15 
 
 		 138 aa  187  4e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.109776  normal  0.197856 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2222  50S ribosomal protein L16  63.97 
 
 		 139 aa  187  5.999999999999999e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000157972  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1643  50S ribosomal protein L16  60 
 
 		 160 aa  186  5.999999999999999e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1347  ribosomal protein L16  67.65 
 
 		 137 aa  187  5.999999999999999e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2416  50S ribosomal protein L16  65.44 
 
 		 139 aa  187  5.999999999999999e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1154  ribosomal protein L16  66.18 
 
 		 141 aa  186  7e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000356332  hitchhiker  0.0000299058 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1567  50S ribosomal protein L16  60.58 
 
 		 142 aa  186  7e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00199901  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0222  50S ribosomal protein L16  64.49 
 
 		 144 aa  186  7e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000752115  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1843  ribosomal protein L16  63.5 
 
 		 137 aa  186  1e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000707867  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2317  50S ribosomal protein L16  68.66 
 
 		 137 aa  186  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000221172  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2453  50S ribosomal protein L16  65.67 
 
 		 144 aa  186  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.219362 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0232  50S ribosomal protein L16  64.96 
 
 		 143 aa  186  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17331  50S ribosomal protein L16  60 
 
 		 160 aa  186  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.613797  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0118  50S ribosomal protein L16  61.31 
 
 		 144 aa  186  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312557  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1154  50S ribosomal protein L16  62.5 
 
 		 139 aa  184  2e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.0000000032781  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0114  50S ribosomal protein L16  62.04 
 
 		 141 aa  185  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5131  ribosomal protein L16  62.22 
 
 		 137 aa  184  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.77654 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17581  50S ribosomal protein L16  60.74 
 
 		 160 aa  184  3e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0066  50S ribosomal protein L16  66.18 
 
 		 141 aa  184  3e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0038879  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1868  50S ribosomal protein L16  66.18 
 
 		 141 aa  184  3e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3660  50S ribosomal protein L16  64.96 
 
 		 145 aa  184  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000506256  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2074  50S ribosomal protein L16  66.18 
 
 		 141 aa  184  3e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0136024  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0428  50S ribosomal protein L16  69.4 
 
 		 137 aa  184  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0983834  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1697  50S ribosomal protein L16  66.18 
 
 		 141 aa  184  3e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000686182  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17421  50S ribosomal protein L16  60.74 
 
 		 160 aa  184  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2171  ribosomal protein L16  64.44 
 
 		 140 aa  184  4e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.501834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0111  50S ribosomal protein L16  61.76 
 
 		 144 aa  184  4e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000578104  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3898  50S ribosomal protein L16  63.7 
 
 		 139 aa  184  4e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0960  50S ribosomal protein L16  63.5 
 
 		 142 aa  183  5e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000390826  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0138  50S ribosomal protein L16  61.03 
 
 		 144 aa  183  7e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0117  50S ribosomal protein L16  61.03 
 
 		 144 aa  183  7e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000580753  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0113  50S ribosomal protein L16  61.03 
 
 		 144 aa  183  7e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.719700000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0111  50S ribosomal protein L16  61.03 
 
 		 144 aa  183  7e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000723278  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0117  50S ribosomal protein L16  61.03 
 
 		 144 aa  183  7e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167847  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5188  50S ribosomal protein L16  61.03 
 
 		 144 aa  183  7e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000330931  unclonable  1.07151e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0129  50S ribosomal protein L16  61.03 
 
 		 144 aa  183  7e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.87351e-62 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0854  50S ribosomal protein L16  64.44 
 
 		 137 aa  183  7e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000606887  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0117  50S ribosomal protein L16  61.03 
 
 		 144 aa  183  8e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000995896  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3660  50S ribosomal protein L16  67.91 
 
 		 137 aa  183  8e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0148  50S ribosomal protein L16  61.03 
 
 		 144 aa  183  8e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139217  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1026  50S ribosomal protein L16  64.71 
 
 		 141 aa  182  9e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00185253  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1961  ribosomal protein L16  64.71 
 
 		 141 aa  183  9e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.564853  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0398  50S ribosomal protein L16  65.93 
 
 		 138 aa  182  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0569  50S ribosomal protein L16  63.7 
 
 		 139 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23400  LSU ribosomal protein L16P  62.5 
 
 		 143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000203395  hitchhiker  0.00000101059 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>