More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1559 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1559  ribosomal protein S19  100 
 
 
95 aa  191  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.917547  normal  0.993871 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2253  SSU ribosomal protein S19P  78.26 
 
 
93 aa  159  9e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000103026  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2061  ribosomal protein S19  77.78 
 
 
90 aa  154  5.0000000000000005e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000159778  normal  0.210432 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0664  30S ribosomal protein S19  74.73 
 
 
94 aa  151  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000545855  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2770  ribosomal protein S19  77.78 
 
 
90 aa  150  5.9999999999999996e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000879656  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0712  ribosomal protein S19  76.09 
 
 
92 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.672923  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1350  30S ribosomal protein S19  73.91 
 
 
92 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.760122  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0937  30S ribosomal protein S19  76.74 
 
 
93 aa  143  6e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000587656  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3324  30S ribosomal protein S19  76.74 
 
 
93 aa  143  6e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000239735 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0083  30S ribosomal protein S19  79.52 
 
 
93 aa  143  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0974328 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00734  ribosomal protein S19  67.78 
 
 
92 aa  142  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4272  30S ribosomal protein S19  70 
 
 
91 aa  141  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253887  unclonable  0.00000000000338266 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4001  ribosomal protein S19  72.73 
 
 
89 aa  141  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.142935  normal  0.648316 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0324  30S ribosomal protein S19  67.78 
 
 
92 aa  141  3e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0470216  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1761  30S ribosomal protein S19  77.11 
 
 
93 aa  140  4e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0120416  normal  0.38061 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001738  SSU ribosomal protein S19p (S15e)  67.78 
 
 
92 aa  140  4e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000320584  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0217  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
92 aa  140  5e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000102796  unclonable  0.00000723515 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0630  30S ribosomal protein S19  76.74 
 
 
93 aa  140  6e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000177682  hitchhiker  0.00000000120384 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4686  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
92 aa  140  7e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000144856  unclonable  0.0000000151604 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0235  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
92 aa  140  7e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4166  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
92 aa  140  7e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556834  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3755  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
92 aa  140  7e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000285402  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0162  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
92 aa  140  7e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000728304  decreased coverage  0.0000475067 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4052  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
92 aa  140  7e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000500624  unclonable  0.00000000000533461 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4313  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
92 aa  140  7e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000152177  unclonable  0.0000000000439739 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0188  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
92 aa  140  7e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000819027  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0174  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
92 aa  140  7e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000186112  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0203  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
92 aa  140  7e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000219443  unclonable  0.0000000000154128 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0198  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
92 aa  140  7e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00349045  hitchhiker  0.00163948 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0152  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
92 aa  140  7e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012398  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0200  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
92 aa  140  7e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000160903  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0203  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
92 aa  140  7e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000108032  hitchhiker  0.00000000125391 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0204  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
92 aa  140  7e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000147318  unclonable  0.00000836266 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3911  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
92 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000343627  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0588  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
92 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000935387  normal  0.434912 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0287  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
92 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000109471  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3818  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
92 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000535385  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3293  30S ribosomal protein S19  67.78 
 
 
91 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000043477  hitchhiker  0.00000613779 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2946  30S ribosomal protein S19  67.78 
 
 
91 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0382693  decreased coverage  0.000000116532 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0327  ribosomal protein S19  66.67 
 
 
91 aa  138  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000195023  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0063  30S ribosomal protein S19  65.56 
 
 
91 aa  139  1.9999999999999998e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000291736  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3997  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
92 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00000877043  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3334  30S ribosomal protein S19  67.78 
 
 
91 aa  138  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000000761945  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0869  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
91 aa  138  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0723  30S ribosomal protein S19  67.78 
 
 
91 aa  138  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000724937  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0299  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
90 aa  138  3e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00139488  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0283  SSU ribosomal protein S19P  70 
 
 
91 aa  138  3e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000019413  hitchhiker  0.00000161799 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1791  SSU ribosomal protein S19P  67.78 
 
 
92 aa  137  3.9999999999999997e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.219827  normal  0.0847276 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3520  ribosomal protein S19  65.22 
 
 
92 aa  137  4.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000623119  hitchhiker  0.00000086131 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2853  30S ribosomal protein S19  74.42 
 
 
93 aa  137  6e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0833186  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2836  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
91 aa  137  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000453521  normal  0.181034 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0332  ribosomal protein S19  65.56 
 
 
92 aa  137  7e-32  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.203927  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0280  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
91 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442981  normal  0.0699946 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2368  ribosomal protein S19  67.78 
 
 
90 aa  136  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.540425  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3640  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
91 aa  136  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000927803  hitchhiker  0.0000000000150693 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2628  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
91 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00158971  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3772  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
91 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000265315  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3451  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
91 aa  136  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000490482  decreased coverage  0.00387887 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06290  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
91 aa  135  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.336646  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3742  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
91 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000490611  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0771  30S ribosomal protein S19  65.17 
 
 
93 aa  136  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18349  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3165  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
91 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403295  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3064  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
91 aa  136  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000207611  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0331  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
91 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000218247  normal  0.0337389 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3800  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
91 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238183  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0318  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
91 aa  136  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000548079  decreased coverage  0.00231518 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2755  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
91 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000407777  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0462  SSU ribosomal protein S19P  64.44 
 
 
90 aa  136  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0271  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
91 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00149939  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3482  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
91 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000804319  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0352  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
91 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000694495  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0253  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
91 aa  136  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000113028  normal  0.0178687 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1928  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
91 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000295141  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0341  30S ribosomal protein S19  62.11 
 
 
95 aa  135  2e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  6.9817e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0323  30S ribosomal protein S19  68.89 
 
 
91 aa  135  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000170652  unclonable  0.0000000367695 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0115  30S ribosomal protein S19  72.73 
 
 
92 aa  135  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000709655  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1850  30S ribosomal protein S19  62.11 
 
 
95 aa  135  2e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000178079  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1863  30S ribosomal protein S19  65.26 
 
 
95 aa  135  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00494642  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0430  30S ribosomal protein S19  67.78 
 
 
91 aa  135  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000377773  decreased coverage  0.00000532224 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0684  30S ribosomal protein S19  66.3 
 
 
92 aa  135  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.809282  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0409  30S ribosomal protein S19  64.44 
 
 
91 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000987549  normal  0.134092 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2320  ribosomal protein S19  63.33 
 
 
90 aa  134  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000162124  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0705  ribosomal protein S19  72.22 
 
 
91 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000939134  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0473  ribosomal protein S19  64.44 
 
 
91 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000607565  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1189  30S ribosomal protein S19  69.32 
 
 
93 aa  134  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0653663 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0493  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
91 aa  134  4e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000216881  hitchhiker  0.00346795 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2684  30S ribosomal protein S19  65.22 
 
 
92 aa  134  4e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0488  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
91 aa  134  4e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000040228  normal  0.0259366 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0841  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
91 aa  134  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08890  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
91 aa  134  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0219063 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0425  SSU ribosomal protein S19P  66.67 
 
 
91 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0443512  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0111  30S ribosomal protein S19  71.59 
 
 
92 aa  133  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0846  ribosomal protein S19  70 
 
 
94 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0630  ribosomal protein S19  65.56 
 
 
91 aa  133  8e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000445779  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1071  30S ribosomal protein S19  72.09 
 
 
93 aa  133  8e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000120025  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3015  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
91 aa  133  9e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000505191  decreased coverage  0.00185866 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3995  30S ribosomal protein S19  67.78 
 
 
91 aa  133  9e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000322685 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3313  30S ribosomal protein S19  67.78 
 
 
91 aa  133  9e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000716821  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4544  30S ribosomal protein S19  65.56 
 
 
91 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3175  30S ribosomal protein S19  67.78 
 
 
91 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00320627  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>