More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1558 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1558  50S ribosomal protein L2  100 
 
 		 273 aa  555  1e-157  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.49018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01200  50S ribosomal protein L2  68.86 
 
 		 277 aa  400  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2906  50S ribosomal protein L2  68.36 
 
 		 275 aa  382  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0172805  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0711  50S ribosomal protein L2  68.5 
 
 		 275 aa  378  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.876488  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2175  ribosomal protein L2  66.55 
 
 		 276 aa  377  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09970  LSU ribosomal protein L2P  65.82 
 
 		 276 aa  374  1e-103  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.7223  hitchhiker  0.00000165173 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0289  50S ribosomal protein L2  66.91 
 
 		 275 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0283371  normal  0.0481443 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0218  50S ribosomal protein L2  65.07 
 
 		 275 aa  371  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127498  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1349  50S ribosomal protein L2  68.38 
 
 		 274 aa  371  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23440  LSU ribosomal protein L2P  64.36 
 
 		 276 aa  372  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000561637  decreased coverage  0.0000000103379 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1070  50S ribosomal protein L2  69.49 
 
 		 274 aa  372  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000147453  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0683  50S ribosomal protein L2  70.22 
 
 		 274 aa  372  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660032  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2854  50S ribosomal protein L2  66.91 
 
 		 274 aa  368  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.16125  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0629  50S ribosomal protein L2  68.38 
 
 		 274 aa  370  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000833663  hitchhiker  0.00000000000856838 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3325  50S ribosomal protein L2  67.28 
 
 		 274 aa  368  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000129312 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0936  50S ribosomal protein L2  67.28 
 
 		 274 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000014248  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2457  50S ribosomal protein L2  66.06 
 
 		 276 aa  367  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0871736 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2708  ribosomal protein L2  64.96 
 
 		 276 aa  363  2e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000275562  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0787  50S ribosomal protein L2  63.74 
 
 		 274 aa  362  3e-99  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.469967  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0704  50S ribosomal protein L2  66.67 
 
 		 273 aa  362  3e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000350454  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2711  50S ribosomal protein L2  64.6 
 
 		 277 aa  361  8e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2396  50S ribosomal protein L2  64.6 
 
 		 277 aa  361  8e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.445207  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0228  50S ribosomal protein L2  64.1 
 
 		 275 aa  360  1e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1343  ribosomal protein L2  65.93 
 
 		 279 aa  360  1e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4918  50S ribosomal protein L2  63 
 
 		 275 aa  360  1e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.113284  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1521  ribosomal protein L2  62.27 
 
 		 275 aa  359  2e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0718  ribosomal protein L2  63.74 
 
 		 273 aa  359  3e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2293  50S ribosomal protein L2  64.26 
 
 		 279 aa  359  3e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0106582  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2254  50S ribosomal protein L2  64.84 
 
 		 276 aa  355  3.9999999999999996e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000201463  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0082  50S ribosomal protein L2  66.67 
 
 		 276 aa  355  5.999999999999999e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.173583 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2771  50S ribosomal protein L2  68.86 
 
 		 276 aa  355  5.999999999999999e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00347741  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1181  ribosomal protein L2  60.29 
 
 		 274 aa  354  6.999999999999999e-97  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000178958  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0113  50S ribosomal protein L2  62.91 
 
 		 276 aa  353  2e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000200839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0113  50S ribosomal protein L2  62.91 
 
 		 276 aa  353  2e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000138046  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0109  50S ribosomal protein L2  62.91 
 
 		 276 aa  353  2e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.27306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0107  50S ribosomal protein L2  62.91 
 
 		 276 aa  353  2e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000901221  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0113  50S ribosomal protein L2  62.91 
 
 		 276 aa  353  2e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0125  50S ribosomal protein L2  62.91 
 
 		 276 aa  353  2e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.14187e-61 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1762  50S ribosomal protein L2  66.3 
 
 		 276 aa  353  2e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00807764  normal  0.409688 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4023  50S ribosomal protein L2  63 
 
 		 275 aa  353  2e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.796821  hitchhiker  0.00000688583 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0144  50S ribosomal protein L2  62.91 
 
 		 276 aa  353  2e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000100516  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0425  50S ribosomal protein L2  61.9 
 
 		 276 aa  352  2.9999999999999997e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000111287  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1158  ribosomal protein L2  60.51 
 
 		 278 aa  352  4e-96  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000162145  hitchhiker  0.000000663071 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0870  50S ribosomal protein L2  62.18 
 
 		 275 aa  351  5.9999999999999994e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000015035  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5192  50S ribosomal protein L2  62.18 
 
 		 276 aa  349  2e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000180933  unclonable  2.65522e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0107  50S ribosomal protein L2  62.18 
 
 		 276 aa  350  2e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000204251  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0134  50S ribosomal protein L2  62.18 
 
 		 276 aa  349  2e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0850  50S ribosomal protein L2  65.7 
 
 		 277 aa  350  2e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00104266  decreased coverage  0.0000130499 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1182  50S ribosomal protein L2  62.27 
 
 		 275 aa  349  3e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0197  50S ribosomal protein L2  60.58 
 
 		 283 aa  349  3e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00345154  normal  0.0626583 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0984  50S ribosomal protein L2  61.9 
 
 		 280 aa  348  7e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0108  50S ribosomal protein L2  61.82 
 
 		 276 aa  348  7e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000187869  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2330  50S ribosomal protein L2  60.58 
 
 		 275 aa  348  8e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000156043  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2062  50S ribosomal protein L2  65.2 
 
 		 275 aa  346  3e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000331539  normal  0.228916 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0110  50S ribosomal protein L2  61.09 
 
 		 276 aa  345  4e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1295  50S ribosomal protein L2  63.14 
 
 		 276 aa  344  8.999999999999999e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122183  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1391  50S ribosomal protein L2  63.14 
 
 		 276 aa  344  8.999999999999999e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000232502  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0761  50S ribosomal protein L2  62.65 
 
 		 277 aa  344  1e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000295488  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0114  50S ribosomal protein L2  60.73 
 
 		 276 aa  343  1e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000290971  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2061  50S ribosomal protein L2  63.9 
 
 		 279 aa  343  1e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000364134  normal  0.142265 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0288  50S ribosomal protein L2  61.17 
 
 		 274 aa  343  2e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1742  50S ribosomal protein L2  62.32 
 
 		 276 aa  343  2e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000110614  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2321  50S ribosomal protein L2  61.4 
 
 		 274 aa  343  2e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000099496  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0663  50S ribosomal protein L2  64.52 
 
 		 282 aa  341  9e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000112808  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1828  50S ribosomal protein L2  61.82 
 
 		 277 aa  338  4e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.256739  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0565  50S ribosomal protein L2  66.3 
 
 		 277 aa  338  4e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0956  50S ribosomal protein L2  63 
 
 		 274 aa  338  4e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00125176  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1229  50S ribosomal protein L2  61.4 
 
 		 275 aa  338  8e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.624705  unclonable  0.0000121783 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0840  50S ribosomal protein L2  59.71 
 
 		 273 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08880  50S ribosomal protein L2  59.71 
 
 		 273 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0116261 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2643  50S ribosomal protein L2  64.47 
 
 		 277 aa  335  3.9999999999999995e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.331406  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2274  50S ribosomal protein L2  60.73 
 
 		 277 aa  335  5e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000299614  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2315  50S ribosomal protein L2  60.73 
 
 		 277 aa  335  5e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000290927  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2152  50S ribosomal protein L2  62.04 
 
 		 279 aa  335  5.999999999999999e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0924201  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3021  50S ribosomal protein L2  62.69 
 
 		 274 aa  334  7.999999999999999e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0478203  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2166  ribosomal protein L2  60.44 
 
 		 273 aa  334  1e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000491264  normal  0.227842 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1571  ribosomal protein L2  60.95 
 
 		 277 aa  333  2e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000641133  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0429  50S ribosomal protein L2  61.54 
 
 		 276 aa  332  3e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000081496  decreased coverage  0.00000678891 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1135  50S ribosomal protein L2  62.04 
 
 		 275 aa  332  5e-90  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000903374  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1848  50S ribosomal protein L2  61.96 
 
 		 279 aa  331  8e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.492965  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0408  50S ribosomal protein L2  58.46 
 
 		 275 aa  330  1e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000019918  normal  0.14889 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0401  ribosomal protein L2  63.2 
 
 		 278 aa  330  2e-89  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2904  ribosomal protein L2  60 
 
 		 275 aa  330  2e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5127  ribosomal protein L2  64.58 
 
 		 279 aa  329  3e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.840283 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2321  50S ribosomal protein L2  63.74 
 
 		 274 aa  329  4e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000391561  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0309  50S ribosomal protein L2  63.5 
 
 		 278 aa  328  4e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237082 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4002  ribosomal protein L2  65.44 
 
 		 275 aa  328  5.0000000000000004e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.712064 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0845  ribosomal protein L2  60.07 
 
 		 276 aa  328  7e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0492  50S ribosomal protein L2  59.19 
 
 		 275 aa  327  1.0000000000000001e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000323805  hitchhiker  0.00406555 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0487  50S ribosomal protein L2  59.19 
 
 		 275 aa  327  2.0000000000000001e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000349566  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3335  50S ribosomal protein L2  58.46 
 
 		 275 aa  326  3e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000000645842  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3755  ribosomal protein L2  63.87 
 
 		 278 aa  325  4.0000000000000003e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.168054  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1936  50S ribosomal protein L2  59.12 
 
 		 282 aa  325  5e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2021  50S ribosomal protein L2  59.12 
 
 		 282 aa  325  5e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29710  LSU ribosomal protein L2P  62.41 
 
 		 279 aa  325  6e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06280  50S ribosomal protein L2  62.64 
 
 		 273 aa  325  6e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.396932  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3432  ribosomal protein L2  63.14 
 
 		 278 aa  325  7e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0630  ribosomal protein L2  62.04 
 
 		 278 aa  324  8.000000000000001e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1943  50S ribosomal protein L2  58.76 
 
 		 282 aa  324  9e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0691  50S ribosomal protein L2  61.31 
 
 		 278 aa  324  1e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.477246 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>