More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1555 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1555  ribosomal protein L3  100 
 
 		 210 aa  425  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00791107  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  54.55 
 
 		 210 aa  244  6e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2857  50S ribosomal protein L3  51.46 
 
 		 210 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2257  50S ribosomal protein L3  54.95 
 
 		 209 aa  231  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000117498  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0225  ribosomal protein L3  54.85 
 
 		 213 aa  231  6e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  51.9 
 
 		 209 aa  230  1e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 209 aa  229  3e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000231855  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  51.2 
 
 		 211 aa  228  4e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  49.28 
 
 		 209 aa  227  9e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000824684  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1067  50S ribosomal protein L3  49.52 
 
 		 211 aa  227  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000374639  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1765  50S ribosomal protein L3  53.47 
 
 		 209 aa  226  1e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837732  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2065  50S ribosomal protein L3  50.5 
 
 		 209 aa  226  2e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000562685  normal  0.223373 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0079  50S ribosomal protein L3  53.47 
 
 		 209 aa  225  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145283 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 210 aa  223  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0215  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 209 aa  223  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000370606  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1292  50S ribosomal protein L3  52.15 
 
 		 207 aa  221  4.9999999999999996e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263563  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1394  50S ribosomal protein L3  52.15 
 
 		 207 aa  221  4.9999999999999996e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000462367  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  49.76 
 
 		 209 aa  220  9.999999999999999e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000270125  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  50.49 
 
 		 206 aa  219  1.9999999999999999e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000266904  hitchhiker  0.000000567921 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0933  50S ribosomal protein L3  48.57 
 
 		 211 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00137042  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0708  50S ribosomal protein L3  48.31 
 
 		 208 aa  218  3.9999999999999997e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00455924  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1185  50S ribosomal protein L3  49.03 
 
 		 210 aa  218  6e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  47.14 
 
 		 212 aa  217  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2774  ribosomal protein L3  47.52 
 
 		 210 aa  216  2e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.039291  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3328  50S ribosomal protein L3  48.1 
 
 		 211 aa  216  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000332976 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  48.57 
 
 		 210 aa  214  7e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000729631  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4026  50S ribosomal protein L3  49.03 
 
 		 210 aa  214  8e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000729954 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0626  50S ribosomal protein L3  45.24 
 
 		 210 aa  214  9e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000331463  hitchhiker  0.000000000000331617 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17401  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 		 217 aa  214  9e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1346  50S ribosomal protein L3  48.8 
 
 		 211 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.700686  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0376  50S ribosomal protein L3  51.44 
 
 		 218 aa  211  7e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0680  50S ribosomal protein L3  51.01 
 
 		 209 aa  211  9e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.620206  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1650  50S ribosomal protein L3  49.28 
 
 		 217 aa  210  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3024  50S ribosomal protein L3  47.34 
 
 		 210 aa  209  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  49.52 
 
 		 209 aa  209  2e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10020  LSU ribosomal protein L3P  49.02 
 
 		 206 aa  210  2e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000402835  hitchhiker  0.00000000318342 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  46.19 
 
 		 222 aa  209  2e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20031  50S ribosomal protein L3  50.48 
 
 		 218 aa  209  3e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0790  50S ribosomal protein L3  48.33 
 
 		 213 aa  209  4e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2559  50S ribosomal protein L3  49.52 
 
 		 211 aa  209  4e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.101168  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1129  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 218 aa  208  4e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  49.26 
 
 		 216 aa  208  5e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17491  50S ribosomal protein L3  48.31 
 
 		 217 aa  208  5e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0953  50S ribosomal protein L3  49.28 
 
 		 205 aa  208  5e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000660439  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2333  50S ribosomal protein L3  47.6 
 
 		 212 aa  207  6e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000241734  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  49.51 
 
 		 211 aa  207  7e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0691  50S ribosomal protein L3  49.26 
 
 		 211 aa  207  7e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2460  50S ribosomal protein L3  48.54 
 
 		 209 aa  207  7e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17651  50S ribosomal protein L3  48.31 
 
 		 217 aa  207  9e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.884364  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1955  50S ribosomal protein L3  49.52 
 
 		 218 aa  206  2e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  49.04 
 
 		 213 aa  206  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23021  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 218 aa  206  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16781  50S ribosomal protein L3  48.08 
 
 		 219 aa  204  5e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1086  LSU ribosomal protein L3P  47.83 
 
 		 217 aa  202  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10406 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1836  50S ribosomal protein L3  46.7 
 
 		 217 aa  203  2e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00718997  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17160  50S ribosomal protein L3  47.06 
 
 		 216 aa  201  7e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3012  50S ribosomal protein L3  46.4 
 
 		 227 aa  200  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00913494 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  44.29 
 
 		 209 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0451  50S ribosomal protein L3  46.89 
 
 		 205 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000154888  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  47.06 
 
 		 218 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1292  50S ribosomal protein L3  47.83 
 
 		 212 aa  199  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000167398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0255  50S ribosomal protein L3  49.01 
 
 		 216 aa  198  3.9999999999999996e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_417  ribosomal protein L3  46.89 
 
 		 205 aa  198  3.9999999999999996e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000036263  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0474  50S ribosomal protein L3  46.89 
 
 		 205 aa  198  5e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00148542  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2646  50S ribosomal protein L3  49.51 
 
 		 216 aa  198  5e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  47.14 
 
 		 211 aa  197  7e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000151121  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2907  50S ribosomal protein L3  48.08 
 
 		 212 aa  197  7e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2232  50S ribosomal protein L3  50.25 
 
 		 213 aa  197  7.999999999999999e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.422626 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4507  50S ribosomal protein L3  48.04 
 
 		 221 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.787031  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1138  50S ribosomal protein L3  44.83 
 
 		 207 aa  196  3e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000858376  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0194  50S ribosomal protein L3  46.19 
 
 		 210 aa  195  3e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000719285  normal  0.0489845 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1707  50S ribosomal protein L3  48.28 
 
 		 213 aa  196  3e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00287886  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3703  50S ribosomal protein L3  48.04 
 
 		 212 aa  195  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  47.78 
 
 		 211 aa  195  4.0000000000000005e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000399657  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3179  50S ribosomal protein L3  46.95 
 
 		 216 aa  194  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000128128  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0458  50S ribosomal protein L3P  48.79 
 
 		 218 aa  194  9e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.310193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0962  ribosomal protein L3  50.49 
 
 		 206 aa  193  1e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000608869  hitchhiker  0.0000000000269964 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2903  50S ribosomal protein L3  45.5 
 
 		 212 aa  194  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000477342  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10715  50S ribosomal protein L3  45.15 
 
 		 217 aa  192  3e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.249834 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23810  LSU ribosomal protein L3P  45.59 
 
 		 226 aa  192  3e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0107  50S ribosomal protein L3  48.51 
 
 		 213 aa  192  4e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2619  50S ribosomal protein L3  47.6 
 
 		 214 aa  192  4e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0132285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2324  ribosomal protein L3  48.83 
 
 		 214 aa  190  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000658885  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0252  50S ribosomal protein L3  47.96 
 
 		 212 aa  190  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1013  50S ribosomal protein L3  45.63 
 
 		 217 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1040  50S ribosomal protein L3  45.63 
 
 		 217 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0249  50S ribosomal protein L3  47.96 
 
 		 212 aa  190  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.587373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  45.59 
 
 		 216 aa  190  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1030  50S ribosomal protein L3  45.63 
 
 		 217 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3317  50S ribosomal protein L3  46.01 
 
 		 214 aa  189  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000449005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  46.31 
 
 		 219 aa  190  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5124  50S ribosomal protein L3  44.61 
 
 		 216 aa  189  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  44.66 
 
 		 218 aa  189  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3297  50S ribosomal protein L3  45.07 
 
 		 217 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000000538385  hitchhiker  0.0000807722 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2950  50S ribosomal protein L3  45.07 
 
 		 217 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.000000276942  decreased coverage  0.000000134206 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1340  50S ribosomal protein L3  46.77 
 
 		 205 aa  189  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2975  50S ribosomal protein L3  44.61 
 
 		 216 aa  189  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  45.1 
 
 		 218 aa  189  4e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0291  50S ribosomal protein L3  47.37 
 
 		 209 aa  188  4e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000100637  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4343  50S ribosomal protein L3  45.41 
 
 		 206 aa  188  5e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0239943  normal  0.123527 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>