More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1504 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1504  ABC transporter related  100 
 
 
296 aa  604  9.999999999999999e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2862  ABC transporter related protein  55.88 
 
 
270 aa  287  1e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19970  ABC transporter related  54.14 
 
 
265 aa  285  5e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0719287  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2163  ABC transporter related  52.63 
 
 
264 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.573773 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1437  ABC transporter, ATPase subunit  52.09 
 
 
264 aa  258  1e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.432186 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2854  ABC transporter related protein  48.86 
 
 
264 aa  257  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1714  ABC transporter related  52.09 
 
 
264 aa  257  2e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0481461  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1601  ABC transporter related  51.71 
 
 
264 aa  255  5e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.81737 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3143  ABC transporter-related protein  51.32 
 
 
264 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.288919  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1463  ABC transporter related  50 
 
 
264 aa  252  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.466344  hitchhiker  0.000000593097 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2869  ABC transporter related  50.76 
 
 
265 aa  251  8.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  52.76 
 
 
263 aa  251  9.000000000000001e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1504  ABC transporter related  49.62 
 
 
264 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0738  ABC transporter related  47.73 
 
 
265 aa  251  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124437 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0442  ABC transporter, ATP-binding protein  51.32 
 
 
264 aa  250  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0762699  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0659  ABC transporter related  50.19 
 
 
264 aa  249  4e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.548438  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2586  ABC transporter related protein  47.35 
 
 
262 aa  249  4e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000199395  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0111  ABC transporter, ATP-binding protein  50.94 
 
 
264 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1477  ABC transporter, ATP-binding protein  50.94 
 
 
264 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3142  ABC transporter, ATP-binding protein  50.94 
 
 
264 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0690  ABC transport system ATP-binding protein  50.94 
 
 
264 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.553471  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0524  ABC transporter, ATP-binding protein  50.94 
 
 
264 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2905  ABC transporter, ATP-binding protein  50.94 
 
 
264 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0725  ABC transporter related protein  47.73 
 
 
265 aa  247  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.129055  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1748  ABC transporter related  50.19 
 
 
264 aa  246  3e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1947  ABC transporter related  50.19 
 
 
264 aa  246  3e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.349831 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0507  ABC transporter, ATP-binding protein  50.57 
 
 
264 aa  246  4e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1475  ABC transporter related protein  49.24 
 
 
265 aa  246  4e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0630  ABC transporter related  50.76 
 
 
263 aa  244  9e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.764744  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1951  ABC transporter related  48.67 
 
 
264 aa  244  9e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168978  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2830  ABC transporter related  48.86 
 
 
267 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1738  ABC transporter ATP-binding protein  49.24 
 
 
264 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.924585  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6159  ABC transporter, ATPase subunit  49.43 
 
 
264 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1209  ABC transporter-related protein  49.81 
 
 
264 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4313  ABC transporter related  49.62 
 
 
264 aa  243  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.887716  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0474  ABC transporter related  49.81 
 
 
264 aa  243  3e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.753612  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1313  ABC transporter related  49.81 
 
 
264 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0823  ABC transporter ATP-binding protein  48.12 
 
 
267 aa  242  5e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0106274 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0212  ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 
265 aa  241  7.999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.272765  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002972  ABC transporter ATP-binding protein  48.29 
 
 
264 aa  241  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2840  ABC transporter related  49.43 
 
 
264 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2216  ABC transporter related  49.43 
 
 
264 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315955  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0323  hypothetical protein  49.81 
 
 
264 aa  241  1e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0704987  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2829  ABC transporter related  49.43 
 
 
264 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0235677  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1275  ABC transporter ATP-binding protein  48.67 
 
 
264 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14370  putative ABC-transporter ATP-binding component  47.91 
 
 
264 aa  234  9e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2040  ABC transporter-related protein  48.67 
 
 
264 aa  234  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1118  ABC transporter, ATPase subunit  47.27 
 
 
270 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.505252  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1153  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 
252 aa  232  6e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0266393  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1571  ABC transporter related  50.75 
 
 
265 aa  232  7.000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1111  ABC transporter, ATPase subunit  48 
 
 
260 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1945  ABC transporter related  46.82 
 
 
264 aa  231  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.446826  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0251  ABC transporter ATP-binding protein  44.7 
 
 
267 aa  231  1e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000273  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2362  ABC transporter related protein  46.03 
 
 
261 aa  230  2e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000588091  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2076  ABC transporter, ATP-binding protein  45.52 
 
 
267 aa  230  3e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000172805  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1976  ABC transporter, ATP-binding protein  47.15 
 
 
264 aa  230  3e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2056  ABC transporter, ATP-binding protein  47.15 
 
 
264 aa  229  4e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4551  ABC transporter related  45.86 
 
 
264 aa  229  4e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000329769  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1087  ABC transporter related  45.45 
 
 
264 aa  229  6e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0865  ABC transporter related  46.39 
 
 
264 aa  228  7e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3065  ABC transporter related  46.04 
 
 
264 aa  228  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3721  ABC transporter related  46.39 
 
 
264 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4044  ABC transporter related  45.63 
 
 
264 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02938  hypothetical protein  48.29 
 
 
264 aa  225  7e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2225  ABC transporter related  42.63 
 
 
257 aa  223  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0489859  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0621  ABC transporter, ATP-binding protein  48.16 
 
 
245 aa  221  9e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183641  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0049  ABC transporter, ATP-binding protein  46.06 
 
 
264 aa  221  9.999999999999999e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2104  ABC transporter component  46.59 
 
 
264 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1187  ABC transporter, ATP-binding protein  44.4 
 
 
253 aa  210  3e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.708158  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0075  ABC transporter related  44.49 
 
 
282 aa  209  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0207  ABC transporter related protein  41.77 
 
 
262 aa  208  9e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0269  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  43.95 
 
 
256 aa  206  3e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1819  ABC transporter related  42.34 
 
 
254 aa  206  4e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000182766  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0260  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  43.2 
 
 
254 aa  206  4e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0077  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  44.26 
 
 
251 aa  192  5e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0044  ABC transporter related  37.6 
 
 
251 aa  181  1e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1100  ABC transporter related  33.19 
 
 
242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1133  ABC transporter related  33.2 
 
 
243 aa  122  7e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.010872 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0446  ABC transporter related  35.19 
 
 
242 aa  122  7e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  35.47 
 
 
240 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.47 
 
 
240 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1903  sulphate transport system permease protein 1  37.28 
 
 
343 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000843013  hitchhiker  0.000000000000895278 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.47 
 
 
240 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  35.47 
 
 
240 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0503  sulphate transport system permease protein 1  35.48 
 
 
360 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  34.65 
 
 
244 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.47 
 
 
240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1760  ABC transporter related  34.04 
 
 
250 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  35.47 
 
 
223 aa  120  3e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.47 
 
 
240 aa  120  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  35.15 
 
 
240 aa  120  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.04 
 
 
240 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  34.73 
 
 
240 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3075  ABC transporter related  36.25 
 
 
357 aa  119  6e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.106558 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4052  ABC transporter related  31.39 
 
 
282 aa  119  7e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.146234  normal  0.303462 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1031  ABC transport system, ATP-binding protein  31.54 
 
 
339 aa  119  7.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1349  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  36.84 
 
 
343 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3865  ABC transporter related  36.76 
 
 
240 aa  118  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.802251  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2521  ABC transporter related  34.09 
 
 
235 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6490  ABC transporter related  37.99 
 
 
301 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0596674  normal  0.349394 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>