More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1502 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1502  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  100 
 
 
952 aa  1945    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.78 
 
 
801 aa  302  2e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3026  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.63 
 
 
819 aa  292  2e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956622  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4259  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.05 
 
 
804 aa  292  2e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1396  sensor histidine kinase/response regulator  32.09 
 
 
1092 aa  284  5.000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_887  sensor histidine kinase/response regulator  31.41 
 
 
1258 aa  271  4e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2148  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.58 
 
 
819 aa  271  5.9999999999999995e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233006  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0903  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.72 
 
 
1262 aa  266  1e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1405  sensor histidine kinase/response regulator  30.35 
 
 
1379 aa  265  4e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1016  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  30.65 
 
 
1258 aa  259  1e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2497  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.84 
 
 
1168 aa  247  8e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.436801 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 
852 aa  245  3e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1412  sensor histidine kinase/response regulator  30.22 
 
 
737 aa  244  3.9999999999999997e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.281366  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_134  sensor histidine kinase  31.79 
 
 
1062 aa  242  2e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0231  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.51 
 
 
844 aa  241  6.999999999999999e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.794534  normal  0.63544 
 
 
-
 
NC_002936  DET0625  sensory box sensor histidine kinase  29.61 
 
 
853 aa  239  1e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0137493  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1776  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.87 
 
 
1255 aa  230  9e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0127  sensory box sensor histidine kinase  32.09 
 
 
1061 aa  228  3e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_566  sensor histidine kinase  31.08 
 
 
852 aa  228  6e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  37.31 
 
 
912 aa  226  1e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0886  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.09 
 
 
842 aa  226  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435524 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.31 
 
 
652 aa  217  7e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2700  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.83 
 
 
1102 aa  212  3e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1007  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.52 
 
 
557 aa  206  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607179  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  27.23 
 
 
1561 aa  204  4e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2028  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.7 
 
 
1247 aa  205  4e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.138072 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1983  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.93 
 
 
847 aa  204  8e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.138459 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3002  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.71 
 
 
1234 aa  202  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2598  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.64 
 
 
661 aa  202  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1740  multi-sensor hybrid histidine kinase / cell cycle control histidine kinase CckA  30.11 
 
 
866 aa  201  3.9999999999999996e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0223971  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5807  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 
990 aa  201  5e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2532  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.16 
 
 
794 aa  200  9e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.108241  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1076  sensor histidine kinase  34.86 
 
 
395 aa  199  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.29 
 
 
643 aa  198  4.0000000000000005e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.535539  normal  0.0122943 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1961  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.06 
 
 
867 aa  198  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.126106 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1337  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.42 
 
 
822 aa  198  5.000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.121372 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0463  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.18 
 
 
642 aa  198  5.000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.683271 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4635  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.84 
 
 
857 aa  197  8.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.576155  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2124  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.78 
 
 
857 aa  197  9e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104313  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1293  sensory box sensor histidine kinase  36.34 
 
 
394 aa  196  1e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00147637  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0284  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.82 
 
 
1105 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0846765 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2173  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.35 
 
 
867 aa  197  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00129243  normal  0.0294734 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0674  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.15 
 
 
1021 aa  196  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.24 
 
 
695 aa  195  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.554525  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1039  sensory box histidine kinase/response regulator  28.91 
 
 
945 aa  194  7e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1104  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 
394 aa  194  9e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3878  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.73 
 
 
673 aa  194  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1524  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.57 
 
 
853 aa  192  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.334346 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1004  sensory box histidine kinase/response regulator  28.91 
 
 
945 aa  192  2.9999999999999997e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2234  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.3 
 
 
935 aa  192  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1138  Signal transduction histidine kinase  27.44 
 
 
888 aa  191  5e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.408537  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.45 
 
 
1418 aa  191  5.999999999999999e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4753  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.49 
 
 
630 aa  191  8e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3966  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.86 
 
 
677 aa  189  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000186378 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3043  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.7 
 
 
1122 aa  189  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000641159  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0936  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.68 
 
 
803 aa  189  2e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0173561 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1283  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.54 
 
 
1322 aa  189  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000035266 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3112  putative PAS/PAC sensor protein  27.7 
 
 
733 aa  189  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3014  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.76 
 
 
1132 aa  189  3e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829917  hitchhiker  0.00701741 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3519  putative PAS/PAC sensor protein  27.39 
 
 
757 aa  188  4e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.324252  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0801  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.5 
 
 
953 aa  188  5e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.220837  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1736  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.66 
 
 
738 aa  187  6e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2825  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.22 
 
 
903 aa  187  9e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.198382 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3579  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.01 
 
 
1432 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.133683  normal  0.981214 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2189  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.2 
 
 
628 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0671838  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2632  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.48 
 
 
906 aa  187  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.07 
 
 
874 aa  187  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0139218  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0617  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.68 
 
 
557 aa  187  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.543989  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2816  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.43 
 
 
682 aa  187  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0864703 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2602  PAS sensor protein  28.22 
 
 
903 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.378864 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0933  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.8 
 
 
760 aa  185  3e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.964864  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0802  PAS sensor protein  27.15 
 
 
1065 aa  185  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.33 
 
 
962 aa  185  4.0000000000000006e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1398  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.91 
 
 
853 aa  185  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.29 
 
 
859 aa  184  6e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1525  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.76 
 
 
872 aa  184  6e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40409  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.05 
 
 
853 aa  184  6e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0320  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.91 
 
 
838 aa  184  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2576  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.52 
 
 
840 aa  184  8.000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0149194 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.37 
 
 
1079 aa  184  9.000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2229  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.28 
 
 
925 aa  184  9.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.843602  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3298  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.64 
 
 
922 aa  183  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2494  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.01 
 
 
663 aa  184  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0495  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.98 
 
 
1076 aa  183  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.359716  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1648  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.99 
 
 
1176 aa  182  2e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.883005  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.39 
 
 
639 aa  182  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1201  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.27 
 
 
548 aa  182  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.642458  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1290  histidine kinase  31.51 
 
 
573 aa  182  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163396  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3527  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.04 
 
 
839 aa  183  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.064663 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0668  histidine kinase  41.81 
 
 
542 aa  182  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.512830000000001e-32 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1929  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.5 
 
 
853 aa  182  2.9999999999999997e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2943  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.14 
 
 
981 aa  182  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2554  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.26 
 
 
551 aa  181  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344016  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.15 
 
 
645 aa  182  4e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.68 
 
 
774 aa  181  4.999999999999999e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0462938  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2107  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.95 
 
 
770 aa  181  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.1 
 
 
743 aa  181  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0435  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.84 
 
 
703 aa  181  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2463  two component sensor kinase  28.78 
 
 
872 aa  181  7e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.899501  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4108  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.75 
 
 
1095 aa  181  7e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>