47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1482 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1482  bile acid:sodium symporter  100 
 
 		 280 aa  537  9.999999999999999e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.944587 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0110  sodium symporter  36.74 
 
 		 292 aa  161  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00528068 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1377  bile acid/sodium symporter  41.42 
 
 		 277 aa  154  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.711982 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3238  bile acid:sodium symporter  32.73 
 
 		 293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.463161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1354  transmembrane transport protein  32.96 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12080  predicted Na+-dependent transporter  31.29 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4216  Bile acid:sodium symporter  31.84 
 
 		 282 aa  92.8  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1219  bile acid:sodium symporter  29.85 
 
 		 303 aa  53.5  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2284  Bile acid:sodium symporter  26.77 
 
 		 325 aa  53.1  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0220  bile acid:sodium symporter  22.5 
 
 		 303 aa  53.1  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1506  Bile acid:sodium symporter  28.15 
 
 		 319 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.221367  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3800  bile acid:sodium symporter  26.37 
 
 		 309 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4238  bile acid:sodium symporter  22.16 
 
 		 300 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00038302 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0222  Bile acid:sodium symporter  21.56 
 
 		 303 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0522725 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3507  bile acid:sodium symporter  22 
 
 		 308 aa  50.4  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2660  Bile acid:sodium symporter  27.56 
 
 		 319 aa  50.4  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0247  bile acid:sodium symporter  27.27 
 
 		 324 aa  50.4  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0890  Bile acid:sodium symporter  21.74 
 
 		 303 aa  50.4  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4117  bile acid:sodium symporter  21.56 
 
 		 303 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4519  sodium-dependent transporter  25 
 
 		 308 aa  49.7  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0010  Bile acid:sodium symporter  24.17 
 
 		 291 aa  48.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3925  bile acid:sodium symporter  25.37 
 
 		 309 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2891  bile acid:sodium symporter  27.07 
 
 		 316 aa  47.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0407  bile acid:sodium symporter  23.14 
 
 		 289 aa  46.6  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.208758  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1227  bile acid:sodium symporter  28.47 
 
 		 318 aa  46.6  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2646  bile acid:sodium symporter  26.69 
 
 		 297 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.571018  normal  0.498047 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1411  sodium/bile acid symporter family protein  29.63 
 
 		 331 aa  45.8  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.618786  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1632  sodium/bile acid transporter family protein  27.74 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3652  bile acid:sodium symporter  23.71 
 
 		 309 aa  45.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06350  predicted Na+-dependent transporter  25.49 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2664  bile acid:sodium symporter  27.12 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1688  sodium/bile acid transporter family protein  27.74 
 
 		 318 aa  45.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.37024  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0093  Bile acid:sodium symporter  21.21 
 
 		 334 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2588  Bile acid:sodium symporter  27.23 
 
 		 322 aa  44.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2515  bile acid:sodium symporter  26.27 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.930351  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3247  bile acid/Na+ symporter family protein  26.89 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1257  bile acid:sodium symporter  24.19 
 
 		 293 aa  43.9  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.798297 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1913  sodium/bile acid symporter family protein  22.76 
 
 		 321 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000299328  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3431  sodium/bile acid symporter family protein  25.74 
 
 		 321 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000505133  hitchhiker  0.0000000126508 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4097  bile acid:sodium symporter  24.53 
 
 		 315 aa  43.5  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1633  bile acid:sodium symporter  26.92 
 
 		 340 aa  43.5  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1771  bile acid:sodium symporter  24.54 
 
 		 321 aa  42.7  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2861  P3 protein  22.59 
 
 		 297 aa  42.7  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.934917 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1727  arsenical-resistance protein  22.75 
 
 		 321 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000732374  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2013  sodium/bile acid symporter family protein  23.13 
 
 		 321 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1293  Bile acid:sodium symporter  27.08 
 
 		 327 aa  42.4  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0625  sodium/bile acid cotransporter family protein  25.51 
 
 		 311 aa  42.4  0.009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.667593  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>