80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1441 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1441  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  100 
 
 		 371 aa  766    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000771176 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1542  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  52.19 
 
 		 373 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000135778  unclonable  0.000000000156625 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0006  plasmid maintenance system antidote protein  44.72 
 
 		 380 aa  325  6e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1016  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  44.5 
 
 		 385 aa  296  6e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03612  Plasmid maintenance system antidote protein  41.78 
 
 		 371 aa  289  6e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0275  DNA-binding protein  40.59 
 
 		 386 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2492  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.7 
 
 		 368 aa  249  4e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1194  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.88 
 
 		 369 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1951  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.36 
 
 		 368 aa  243  3e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1548  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.61 
 
 		 363 aa  236  4e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0212  hypothetical protein  35.41 
 
 		 368 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5647  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.39 
 
 		 362 aa  211  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4709  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.42 
 
 		 360 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.29865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0317  hypothetical protein  33.61 
 
 		 360 aa  203  4e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000502867 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0483  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.16 
 
 		 350 aa  197  3e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1808  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.8 
 
 		 358 aa  172  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1543  hypothetical protein  30.79 
 
 		 367 aa  169  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20190  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.24 
 
 		 228 aa  145  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3332  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.37 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3170  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.13 
 
 		 376 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.19493  unclonable  0.0000000000000213391 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1079  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.26 
 
 		 361 aa  115  8.999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0033  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.44 
 
 		 334 aa  92.8  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119331  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0814  helix-turn-helix domain-containing protein  29.65 
 
 		 425 aa  79  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00469966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0236  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  44.58 
 
 		 124 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2453  helix-turn-helix domain-containing protein  24.72 
 
 		 409 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.253954  normal  0.726571 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1982  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  46.05 
 
 		 116 aa  77  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.610111  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3421  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  22.87 
 
 		 383 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4195  putative transcription regulator with HTH domain protein  29.79 
 
 		 401 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0386  helix-turn-helix domain-containing protein  25 
 
 		 422 aa  66.2  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.375659  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42030  antitoxin protein  40.24 
 
 		 95 aa  57  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2894  addiction module antidote protein, HigA family  49.15 
 
 		 119 aa  55.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4510  hypothetical protein  26.21 
 
 		 289 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0920  hypothetical protein  27.81 
 
 		 345 aa  53.9  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.409849  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2261  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.24 
 
 		 76 aa  53.1  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000446898  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0768  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.89 
 
 		 100 aa  52.8  0.000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0947  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.05 
 
 		 106 aa  52.4  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03903  addiction module antidote protein, HigA family  44.78 
 
 		 96 aa  51.6  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.433469  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0019  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.27 
 
 		 98 aa  51.6  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191318  normal  0.0141037 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1291  XRE family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 98 aa  50.4  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3765  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.84 
 
 		 97 aa  50.1  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0750  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.84 
 
 		 117 aa  49.7  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.236771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2031  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.89 
 
 		 106 aa  49.3  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.65469  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1677  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.65 
 
 		 93 aa  48.5  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3225  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.53 
 
 		 106 aa  48.5  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.114466 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1256  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.14 
 
 		 103 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0149882 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1093  hypothetical protein  41.79 
 
 		 107 aa  47.4  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0571  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 107 aa  47.4  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1062  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  25.68 
 
 		 102 aa  47.4  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000765045 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3243  plasmid maintenance system antidote protein  32.18 
 
 		 102 aa  46.6  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0211861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3070  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.63 
 
 		 151 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1065  plasmid maintenance system antidote protein  34.94 
 
 		 101 aa  46.2  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1672  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.3 
 
 		 108 aa  46.2  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2430  plasmid maintenance system antidote protein  32.43 
 
 		 108 aa  45.4  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.216096  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4141  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.82 
 
 		 101 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.267642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3643  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.47 
 
 		 95 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0160538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5380  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.86 
 
 		 94 aa  45.4  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.031339  hitchhiker  0.000847786 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1633  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  31.08 
 
 		 105 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0899701  normal  0.785699 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0412  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  28.72 
 
 		 100 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4148  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.82 
 
 		 101 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.287171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1754  virulence-associated protein, putative  31.46 
 
 		 104 aa  44.7  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0614542  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0417  XRE family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 104 aa  44.3  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1105  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.34 
 
 		 105 aa  44.3  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.912318  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0921  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  44.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3198  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.59 
 
 		 104 aa  44.3  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.562378  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1543  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.48 
 
 		 118 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.167279 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0431  hypothetical protein  33.73 
 
 		 108 aa  44.3  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4828  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.82 
 
 		 101 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3001  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.47 
 
 		 100 aa  43.9  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.770477 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2649  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.53 
 
 		 102 aa  43.5  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.634453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0276  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.53 
 
 		 102 aa  43.5  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.545625  normal  0.0676813 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2491  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  27.55 
 
 		 96 aa  43.5  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.289319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0372  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.38 
 
 		 96 aa  43.1  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1480  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.55 
 
 		 102 aa  43.1  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0221448  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2447  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.5 
 
 		 128 aa  43.1  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.56382  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1455  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.76 
 
 		 100 aa  43.1  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.077029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3858  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.77 
 
 		 105 aa  43.1  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2972  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.93 
 
 		 101 aa  42.7  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4370  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.3 
 
 		 106 aa  42.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0372671  normal  0.0360192 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1105  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  35.06 
 
 		 90 aa  43.1  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0903859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27690  plasmid maintenance system antidote protein  33.78 
 
 		 99 aa  42.7  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>