289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1420 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1420  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  322  2e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.290854 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20240  conserved hypothetical protein TIGR00246  40.62 
 
 		 159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0360  rRNA large subunit methyltransferase  40 
 
 		 159 aa  114  5e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.615006  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  41.88 
 
 		 159 aa  114  6.9999999999999995e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000881248  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0291  rRNA large subunit methyltransferase  41.88 
 
 		 159 aa  113  7.999999999999999e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191259  normal  0.200135 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2090  rRNA large subunit methyltransferase  41.51 
 
 		 157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3402  protein of unknown function DUF163  41.88 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000153536  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2788  rRNA large subunit methyltransferase  39.74 
 
 		 155 aa  112  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1622  rRNA large subunit methyltransferase  41.88 
 
 		 159 aa  111  5e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0556  rRNA large subunit methyltransferase  40.62 
 
 		 159 aa  110  6e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0655  protein of unknown function DUF163  39.1 
 
 		 157 aa  110  7.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5312  rRNA large subunit methyltransferase  41.25 
 
 		 159 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5156  rRNA large subunit methyltransferase  41.25 
 
 		 159 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136607  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5582  rRNA large subunit methyltransferase  41.25 
 
 		 159 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5708  rRNA large subunit methyltransferase  41.25 
 
 		 159 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5353  rRNA large subunit methyltransferase  41.25 
 
 		 159 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000123546  hitchhiker  7.68925e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5608  rRNA large subunit methyltransferase  41.25 
 
 		 159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.91271  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3775  protein of unknown function DUF163  40.13 
 
 		 154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455884  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3859  protein of unknown function DUF163  40.13 
 
 		 154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161132 
 
 
-
 
NC_008532  STER_2001  rRNA large subunit methyltransferase  38.12 
 
 		 159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.554964  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5140  rRNA large subunit methyltransferase  40.62 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0439038  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3495  rRNA large subunit methyltransferase  38.46 
 
 		 157 aa  108  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0587384  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4914  rRNA large subunit methyltransferase  40 
 
 		 160 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000673176  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5565  rRNA large subunit methyltransferase  40.62 
 
 		 167 aa  107  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5705e-39 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5643  rRNA large subunit methyltransferase  40.62 
 
 		 167 aa  107  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00520396  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3999  rRNA large subunit methyltransferase  39.38 
 
 		 159 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1945  rRNA large subunit methyltransferase  37.5 
 
 		 159 aa  107  7.000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0305883  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5252  rRNA large subunit methyltransferase  39.38 
 
 		 159 aa  107  9.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2576  hypothetical protein  39.74 
 
 		 156 aa  104  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709351  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3531  rRNA large subunit methyltransferase  41.25 
 
 		 177 aa  104  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3208  hypothetical protein  39.74 
 
 		 153 aa  104  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0200038  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0910  rRNA large subunit methyltransferase  40.99 
 
 		 159 aa  103  9e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3202  hypothetical protein  37.18 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.69553e-19  unclonable  6.7014e-24 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0073  protein of unknown function DUF163  38.75 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00804321  normal  0.0154947 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4128  hypothetical protein  37.82 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167091  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2927  rRNA large subunit methyltransferase  37.74 
 
 		 159 aa  102  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2610  rRNA large subunit methyltransferase  37.74 
 
 		 159 aa  102  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08411  hypothetical protein  38.12 
 
 		 157 aa  101  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2894  protein of unknown function DUF163  39.62 
 
 		 159 aa  101  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.577579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2438  rRNA large subunit methyltransferase  38.12 
 
 		 159 aa  100  6e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000743067  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2595  hypothetical protein  36.81 
 
 		 159 aa  100  7e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3630  protein of unknown function DUF163  35.9 
 
 		 153 aa  99.8  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000133759  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2467  hypothetical protein  36.25 
 
 		 159 aa  100  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.574307  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3387  rRNA large subunit methyltransferase  36.88 
 
 		 159 aa  99  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2416  hypothetical protein  40.99 
 
 		 160 aa  97.8  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0648918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1773  rRNA large subunit methyltransferase  37.5 
 
 		 169 aa  97.8  5e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0254  hypothetical protein  38.22 
 
 		 153 aa  97.1  9e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1654  hypothetical protein  36.54 
 
 		 153 aa  96.3  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1588  rRNA large subunit methyltransferase  36.25 
 
 		 159 aa  96.3  1e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0027  rRNA large subunit methyltransferase  37.5 
 
 		 159 aa  96.7  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000611129  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2340  hypothetical protein  38.75 
 
 		 159 aa  96.7  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.663621 
 
 
-
 
NC_004310  BR1840  rRNA large subunit methyltransferase  36.42 
 
 		 174 aa  95.5  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2139  hypothetical protein  39.87 
 
 		 154 aa  95.5  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.895316  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1059  rRNA large subunit methyltransferase  38.51 
 
 		 160 aa  95.9  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3770  protein of unknown function DUF163  33.97 
 
 		 157 aa  94.7  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0717595 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0070  rRNA large subunit methyltransferase  38.51 
 
 		 159 aa  95.1  4e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000017339  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0377  rRNA large subunit methyltransferase  36.94 
 
 		 155 aa  94.4  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1306  protein of unknown function DUF163  36.94 
 
 		 152 aa  94.4  6e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.820189  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2173  rRNA large subunit methyltransferase  33.12 
 
 		 159 aa  93.2  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.015076  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2273  SPOUT methyltransferase superfamily protein  33.76 
 
 		 156 aa  92.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.246773  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1182  rRNA large subunit methyltransferase  36.08 
 
 		 156 aa  92  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159956  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0024  rRNA large subunit methyltransferase  37.89 
 
 		 159 aa  92  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000337367  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0024  rRNA large subunit methyltransferase  37.89 
 
 		 159 aa  92  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000287275  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3149  rRNA large subunit methyltransferase  36.08 
 
 		 156 aa  92  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.788661  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0108  hypothetical protein  31.87 
 
 		 160 aa  91.7  3e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0185  hypothetical protein  32.69 
 
 		 152 aa  91.7  4e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2529  rRNA large subunit methyltransferase  36.25 
 
 		 159 aa  91.3  5e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000224859  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19420  hypothetical protein  33.12 
 
 		 156 aa  91.3  5e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1202  hypothetical protein  36.08 
 
 		 156 aa  90.9  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0757  rRNA large subunit methyltransferase  36.71 
 
 		 155 aa  90.9  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00922876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0743  rRNA large subunit methyltransferase  36.71 
 
 		 155 aa  90.9  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000786877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0697  rRNA large subunit methyltransferase  36.71 
 
 		 155 aa  90.9  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00566103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0801  rRNA large subunit methyltransferase  36.71 
 
 		 155 aa  90.9  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000227115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0683  rRNA large subunit methyltransferase  36.71 
 
 		 155 aa  90.9  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000302367  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4277  rRNA large subunit methyltransferase  34.59 
 
 		 160 aa  90.1  9e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0677  hypothetical protein  39.38 
 
 		 158 aa  89.7  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3293  hypothetical protein  39.38 
 
 		 160 aa  89.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3020  rRNA large subunit methyltransferase  36.08 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000384125  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0780  rRNA large subunit methyltransferase  32.7 
 
 		 159 aa  90.1  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.329962  normal  0.230436 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2948  rRNA large subunit methyltransferase  36.08 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0113814  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1847  rRNA large subunit methyltransferase  36.08 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1093  rRNA large subunit methyltransferase  36.08 
 
 		 156 aa  90.1  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2963  rRNA large subunit methyltransferase  35.44 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0291  protein of unknown function DUF163  37.42 
 
 		 160 aa  89.7  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0186032  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34446  predicted protein  35.21 
 
 		 194 aa  89.4  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.693948  normal  0.0400957 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0322  rRNA large subunit methyltransferase  31.87 
 
 		 160 aa  89.4  2e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1512  rRNA large subunit methyltransferase  33.12 
 
 		 155 aa  89.4  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000386318  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00605  hypothetical protein  36.71 
 
 		 155 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000332715  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2990  protein of unknown function DUF163  36.71 
 
 		 155 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000047133  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0725  rRNA large subunit methyltransferase  36.71 
 
 		 155 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000708993  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1171  rRNA large subunit methyltransferase  36.71 
 
 		 155 aa  88.6  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.195021  normal  0.132715 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0688  rRNA large subunit methyltransferase  36.71 
 
 		 155 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000154252  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00594  hypothetical protein  36.71 
 
 		 155 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000243444  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3009  rRNA large subunit methyltransferase  36.71 
 
 		 155 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000239477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0656  rRNA large subunit methyltransferase  36.71 
 
 		 155 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000108281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0615  rRNA large subunit methyltransferase  36.71 
 
 		 155 aa  88.6  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000121913  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0662  rRNA large subunit methyltransferase  36.71 
 
 		 155 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000637947  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0474  rRNA large subunit methyltransferase  34.39 
 
 		 156 aa  87.4  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0372612  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1662  hypothetical protein  39.57 
 
 		 158 aa  87.4  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.399666  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1412  hypothetical protein  34.39 
 
 		 145 aa  87.4  6e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.493866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>