23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1354 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1354  hypothetical protein  100 
 
 		 541 aa  1101    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.721853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1416  type III restriction protein, res subunit  28.98 
 
 		 920 aa  92  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0789  type III restriction protein res subunit  28.01 
 
 		 795 aa  75.9  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.891259  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2493  DEAD/DEAH box helicase-like  27.55 
 
 		 799 aa  75.1  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1457  type III restriction protein res subunit  27.53 
 
 		 971 aa  69.3  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1316  type III restriction enzyme, res subunit  26.43 
 
 		 796 aa  69.3  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5640  virulence-associated E family protein  29.41 
 
 		 761 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.00000000885028  normal  1 
 
 
 
NC_011353  ECH74115_1306  type III restriction enzyme, res subunit family  24.41 
 
 		 786 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.986066 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0717  type III restriction protein res subunit  26.96 
 
 		 794 aa  66.2  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142618 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0307  type III restriction protein res subunit  25.59 
 
 		 784 aa  65.9  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0006  type III restriction enzyme, res subunit  26.53 
 
 		 768 aa  63.9  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2039  type III restriction protein res subunit  25 
 
 		 809 aa  63.2  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2408  DEAD/DEAH box helicase, putative  25 
 
 		 809 aa  63.2  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04056  DNA helicase of superfamily II  26.36 
 
 		 796 aa  62.4  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2244  type III restriction protein res subunit  24.42 
 
 		 788 aa  60.8  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450731  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3695  type III restriction protein res subunit  25.48 
 
 		 813 aa  60.8  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4007  type III restriction protein res subunit  25.48 
 
 		 813 aa  60.8  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.527137  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01111  hypothetical protein  24.04 
 
 		 778 aa  60.1  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2488  hypothetical protein  26.22 
 
 		 925 aa  60.1  0.00000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3271  type III restriction enzyme, res subunit  26.88 
 
 		 785 aa  59.7  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.581193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1001  hypothetical protein  22.93 
 
 		 1870 aa  55.1  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723533  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5449  type III restriction protein res subunit  25.34 
 
 		 815 aa  55.1  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.788934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03900  hypothetical protein  24.64 
 
 		 998 aa  50.8  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.114045  normal  0.665551 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>