91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1325 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0022  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  51.51 
 
 		 691 aa  647    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112667  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0028  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  53.18 
 
 		 701 aa  662    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.880979  normal  0.680993 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1325  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  100 
 
 		 812 aa  1650    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000380778  hitchhiker  0.00814208 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0140  hypothetical protein  51.54 
 
 		 711 aa  631  1e-179  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0386904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1994  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  46.81 
 
 		 671 aa  566  1e-160  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.204714  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1352  von Willebrand factor, type A  33.33 
 
 		 819 aa  325  2e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0364534  normal  0.0483698 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4136  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  34.36 
 
 		 1362 aa  308  3e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332177 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2738  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  32.14 
 
 		 794 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2410  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  30.83 
 
 		 751 aa  270  1e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2295  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  30.88 
 
 		 755 aa  270  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2998  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  30.81 
 
 		 791 aa  266  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337723  normal  0.523415 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1739  cell wall anchor domain-containing protein  29.28 
 
 		 757 aa  265  2e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.491148  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  30.76 
 
 		 755 aa  265  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1843  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.69 
 
 		 771 aa  263  8e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.327396  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2200  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  31.03 
 
 		 759 aa  263  8.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2448  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  28.78 
 
 		 772 aa  263  1e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0017334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1829  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.41 
 
 		 772 aa  261  3e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0709098  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1877  cell wall anchor domain-containing protein  28.26 
 
 		 771 aa  261  3e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.581761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2742  hypothetical protein  32.12 
 
 		 774 aa  254  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.603837  normal  0.495762 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3684  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  29.56 
 
 		 712 aa  252  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5132  cell wall anchor domain-containing protein  31.86 
 
 		 761 aa  249  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.137427 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2492  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  29.23 
 
 		 770 aa  249  2e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0368823  normal  0.695275 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2150  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  29.15 
 
 		 740 aa  248  4e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.270447 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2195  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  29.73 
 
 		 760 aa  247  6e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0664  hypothetical protein  30.64 
 
 		 755 aa  247  6.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.101783 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1318  vault protein inter-alpha-trypsin domain-containing protein  32.63 
 
 		 796 aa  246  9.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.287979 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1395  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  30.98 
 
 		 723 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.670427  normal  0.959342 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1400  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  31.46 
 
 		 732 aa  241  5e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0242423 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2516  cell wall anchor domain-containing protein  28.33 
 
 		 789 aa  239  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.27375  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1675  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  32.03 
 
 		 738 aa  239  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.461102 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2124  cell wall anchor domain-containing protein  29.35 
 
 		 739 aa  238  4e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0949935  normal  0.0697413 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4846  cell wall anchor domain-containing protein  28.97 
 
 		 750 aa  236  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.818339  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1625  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.53 
 
 		 722 aa  231  3e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.466384  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4515  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  31.33 
 
 		 795 aa  227  6e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1793  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.22 
 
 		 776 aa  226  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.216106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3922  vault protein inter-alpha-trypsin  26.94 
 
 		 701 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2383  Vault protein inter-alpha-trypsin domain-containing protein  29.82 
 
 		 831 aa  215  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151834  hitchhiker  0.00156967 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2003  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  28.1 
 
 		 753 aa  213  1e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0804312  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5519  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  30.32 
 
 		 725 aa  200  7.999999999999999e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5161  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  32.89 
 
 		 729 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.997936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2070  hypothetical protein  28.45 
 
 		 776 aa  198  4.0000000000000005e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.849669  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3379  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.59 
 
 		 786 aa  189  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4460  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  27.95 
 
 		 1033 aa  175  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.743014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3690  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  24.56 
 
 		 680 aa  154  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3108  von Willebrand factor type A (vWA) domain-containing protein  24.35 
 
 		 713 aa  150  6e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0355813 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0122  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  27.59 
 
 		 763 aa  150  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2129  von Willebrand factor type A  24.49 
 
 		 833 aa  127  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2332  von Willebrand factor type A  25.04 
 
 		 775 aa  123  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161725 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05364  von Willebrand domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G01160)  25 
 
 		 1109 aa  119  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.520514 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1710  von Willebrand factor type A  26.02 
 
 		 840 aa  111  6e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1806  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.41 
 
 		 338 aa  94.7  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.825295  normal  0.327255 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  29.41 
 
 		 416 aa  75.5  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  24.88 
 
 		 415 aa  67.4  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  25.1 
 
 		 426 aa  63.2  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  26.29 
 
 		 427 aa  61.6  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0384  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 		 423 aa  57  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  28.79 
 
 		 412 aa  57  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0183  von Willebrand factor, type A  28.88 
 
 		 563 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174598  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  28.65 
 
 		 419 aa  55.1  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2065  von Willebrand factor type A  25.93 
 
 		 380 aa  54.7  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5407  von Willebrand factor type A  27.05 
 
 		 935 aa  53.5  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  32.21 
 
 		 423 aa  52.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  28.18 
 
 		 418 aa  53.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2700  von Willebrand factor, type A  27.51 
 
 		 566 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.557808  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  25.12 
 
 		 421 aa  52  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  26.92 
 
 		 420 aa  52  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  25.96 
 
 		 419 aa  50.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3551  von Willebrand factor type A  26.67 
 
 		 505 aa  49.7  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104304  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3969  von Willebrand factor type A  26.19 
 
 		 480 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  24.46 
 
 		 418 aa  49.3  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  26.74 
 
 		 421 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4506  von Willebrand factor type A  28.42 
 
 		 698 aa  49.3  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01616  von Willebrand factor type A domain protein  29.35 
 
 		 350 aa  48.9  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  28.65 
 
 		 412 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2571  Ig domain protein group 2 domain protein  28.36 
 
 		 942 aa  48.9  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  28.14 
 
 		 412 aa  48.5  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1383  von Willebrand factor, type A  25.26 
 
 		 363 aa  48.1  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.130674  hitchhiker  0.0000484488 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  30.1 
 
 		 903 aa  47.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  26.74 
 
 		 543 aa  47.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  25.5 
 
 		 459 aa  47  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1492  von Willebrand factor, type A  24.07 
 
 		 383 aa  46.6  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3334  von Willebrand factor, type A  26.17 
 
 		 441 aa  46.6  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0867289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3055  von Willebrand factor, type A  26.23 
 
 		 625 aa  45.1  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.548122 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_54892  predicted protein  28.65 
 
 		 523 aa  45.1  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4213  von Willebrand factor type A  26.81 
 
 		 455 aa  45.1  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1287  von Willebrand factor type A  26.83 
 
 		 744 aa  45.1  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.215804 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  26.67 
 
 		 418 aa  45.1  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6336  von Willebrand factor type A  27.42 
 
 		 808 aa  44.7  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  26.86 
 
 		 425 aa  44.7  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2973  von Willebrand factor, type A  26.23 
 
 		 624 aa  44.3  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00160061  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4403  von Willebrand factor type A  29.86 
 
 		 450 aa  44.3  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239793  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>