277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1322 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1322  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
429 aa  877    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  hitchhiker  0.000198005 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  59.51 
 
 
406 aa  485  1e-136  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  53.63 
 
 
405 aa  390  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  52.64 
 
 
412 aa  382  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  33.96 
 
 
362 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  31.66 
 
 
465 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  30.29 
 
 
373 aa  144  4e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  30 
 
 
361 aa  141  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  31.51 
 
 
468 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  31.88 
 
 
370 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  31.15 
 
 
652 aa  133  6e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  30.32 
 
 
421 aa  131  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  28.35 
 
 
357 aa  130  4.0000000000000003e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  30.55 
 
 
671 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  31.49 
 
 
328 aa  130  6e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  30.75 
 
 
308 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1568  DNA-cytosine methyltransferase  32.39 
 
 
662 aa  124  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0406485  hitchhiker  0.00122877 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  31.7 
 
 
323 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  30.57 
 
 
423 aa  122  9e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  30.29 
 
 
423 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  29.45 
 
 
395 aa  121  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  31.55 
 
 
362 aa  121  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  28.83 
 
 
385 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  30.73 
 
 
313 aa  120  7e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  28.92 
 
 
438 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.52 
 
 
415 aa  117  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3504  BsaWI methylase  30.27 
 
 
440 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.671295  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  29.03 
 
 
390 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  28.57 
 
 
415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  30.47 
 
 
313 aa  114  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  30.75 
 
 
335 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  28.79 
 
 
418 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1205  DNA-cytosine methyltransferase  30.17 
 
 
632 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.649135 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  30.11 
 
 
334 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  28.79 
 
 
418 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  26.94 
 
 
434 aa  114  5e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  33.81 
 
 
310 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  30.19 
 
 
335 aa  113  8.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  27.76 
 
 
360 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  32.75 
 
 
337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0416  DNA-cytosine methyltransferase  29.46 
 
 
320 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  28.68 
 
 
431 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0302  DNA-cytosine methyltransferase  28.53 
 
 
375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0080  DNA-cytosine methyltransferase  28.53 
 
 
371 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  29.09 
 
 
443 aa  110  5e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  25.51 
 
 
388 aa  109  8.000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  27.42 
 
 
325 aa  108  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4962  DNA-cytosine methyltransferase  32.35 
 
 
342 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  29.89 
 
 
342 aa  108  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  28.57 
 
 
389 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2535  DNA-cytosine methyltransferase  27.73 
 
 
400 aa  107  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  30.5 
 
 
345 aa  106  6e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0840  modification methylase DdeI; cytosine-specific methyltransferase  26.71 
 
 
450 aa  106  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.27192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  27.96 
 
 
398 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  28.41 
 
 
313 aa  105  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  26.5 
 
 
319 aa  104  3e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0680  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.96 
 
 
350 aa  104  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000225645 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  31.42 
 
 
379 aa  104  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04441  DNA-cytosine methyltransferase  25.12 
 
 
689 aa  103  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0121  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  28.36 
 
 
395 aa  102  9e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3989  DNA-cytosine methyltransferase  29.07 
 
 
348 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.519304  normal  0.0147961 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  27.09 
 
 
416 aa  101  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1127  DNA-cytosine methyltransferase  31.66 
 
 
359 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000503374  unclonable  0.0000088158 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1183  hypothetical protein  29.7 
 
 
352 aa  101  2e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.401368  normal  0.0474441 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  31.2 
 
 
374 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4863  DNA-cytosine methyltransferase  30.37 
 
 
418 aa  101  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  29.1 
 
 
328 aa  100  6e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1414  DNA-cytosine methyltransferase  28.57 
 
 
419 aa  100  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106105  normal  0.0448096 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.77 
 
 
431 aa  99.4  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3325  DNA-cytosine methyltransferase  27.17 
 
 
438 aa  99.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  27.03 
 
 
340 aa  98.2  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2442  DNA-cytosine methyltransferase  26.67 
 
 
464 aa  98.6  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.767774  unclonable  0.00000000055978 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  27.2 
 
 
446 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  27.35 
 
 
329 aa  96.3  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0598  DNA-cytosine methyltransferase  25.33 
 
 
440 aa  96.3  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0631504  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4984  DNA-cytosine methyltransferase  29.17 
 
 
361 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  29.15 
 
 
356 aa  96.3  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0394  DNA-cytosine methyltransferase  25.33 
 
 
440 aa  96.3  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0349953  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04331  DNA-cytosine methyltransferase  32.31 
 
 
698 aa  95.9  1e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2869  DNA-cytosine methyltransferase  28.68 
 
 
409 aa  95.1  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000758151  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2284  DNA-cytosine methyltransferase  29.74 
 
 
399 aa  95.5  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  28.53 
 
 
368 aa  95.5  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  28.32 
 
 
365 aa  95.5  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  26.59 
 
 
320 aa  94.7  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0378  DNA-cytosine methyltransferase  31.88 
 
 
686 aa  94.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.853393  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0676  DNA-cytosine methyltransferase  28.64 
 
 
434 aa  94.7  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  26.97 
 
 
338 aa  94.4  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06638  C5 cytosine methyltransferase DmtAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q876R1]  29.31 
 
 
615 aa  93.6  6e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0121285  normal  0.227283 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1333  DNA-cytosine methyltransferase  26.2 
 
 
415 aa  93.2  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  27.79 
 
 
361 aa  93.2  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7069  DNA-cytosine methyltransferase  26.44 
 
 
393 aa  92.8  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000135592  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3438  DNA modification cytosine-specific methyltransferase protein  29.11 
 
 
364 aa  92.4  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  27.78 
 
 
381 aa  92.8  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4252  DNA-cytosine methyltransferase  28.88 
 
 
318 aa  91.7  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0263417 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  28.43 
 
 
657 aa  91.3  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7048  DNA-cytosine methyltransferase  29.06 
 
 
358 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  25.22 
 
 
488 aa  90.9  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1628  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.3 
 
 
359 aa  90.1  7e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  26.81 
 
 
424 aa  89.7  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0931  DNA-cytosine methyltransferase  24.11 
 
 
474 aa  89.7  9e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>