More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1316 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1316  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  704    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.150193  hitchhiker  0.000189083 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0227  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  44.93 
 
 		 354 aa  276  5e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0865  hypothetical protein  45.14 
 
 		 375 aa  261  2e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000040151  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3433  protein of unknown function DUF182  42.11 
 
 		 354 aa  256  4e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1005  hypothetical protein  41.79 
 
 		 351 aa  249  7e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1555  protein of unknown function DUF182  41.62 
 
 		 341 aa  238  1e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.324004  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0635  protein of unknown function DUF182  42.66 
 
 		 362 aa  231  1e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1468  protein of unknown function DUF182  38.3 
 
 		 345 aa  231  1e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1815  hypothetical protein  40.46 
 
 		 344 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3546  xanthine dehydrogenase accessory factor  38.4 
 
 		 353 aa  209  7e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.692521  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3138  protein of unknown function DUF182  37.46 
 
 		 398 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.238524  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1581  hypothetical protein  35.37 
 
 		 376 aa  190  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0305  protein of unknown function DUF182  36.05 
 
 		 382 aa  178  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0344957  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  34.67 
 
 		 357 aa  177  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  35.56 
 
 		 381 aa  172  5e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  33.05 
 
 		 367 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2411  protein of unknown function DUF182  35.29 
 
 		 307 aa  165  8e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2647  hypothetical protein  45.55 
 
 		 281 aa  162  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.645074  normal  0.670591 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  31.94 
 
 		 356 aa  161  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  33.83 
 
 		 388 aa  158  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  32.42 
 
 		 368 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  34.78 
 
 		 386 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  34.78 
 
 		 386 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  34.78 
 
 		 386 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0633  hypothetical protein  30.19 
 
 		 397 aa  152  8.999999999999999e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0325  putative dehydrogenase accessory protein  49.02 
 
 		 286 aa  152  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4205  alanine dehydrogenase  31.61 
 
 		 379 aa  149  5e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.289956  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  31.91 
 
 		 366 aa  149  6e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2006  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  39.09 
 
 		 249 aa  148  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.88376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4137  Xanthine dehydrogenase  32.76 
 
 		 372 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00996475 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4564  protein of unknown function DUF182  31.94 
 
 		 376 aa  146  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  32.41 
 
 		 372 aa  145  8.000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  32.29 
 
 		 386 aa  145  8.000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2544  hypothetical protein  31.62 
 
 		 385 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  0.0393549 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  31.04 
 
 		 374 aa  142  8e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1138  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  43.83 
 
 		 384 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  31.91 
 
 		 342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2211  protein of unknown function DUF182  42.77 
 
 		 265 aa  140  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000212868  normal  0.0832425 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  31.3 
 
 		 373 aa  139  8.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1574  hypothetical protein  32.3 
 
 		 363 aa  138  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.187445  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3212  hypothetical protein  31.34 
 
 		 369 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.420632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  31.96 
 
 		 390 aa  138  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  30.48 
 
 		 385 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0385  hypothetical protein  32.35 
 
 		 370 aa  137  4e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5191  protein of unknown function DUF182  31.32 
 
 		 400 aa  136  7.000000000000001e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.337929 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  31.87 
 
 		 373 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2701  Xanthine dehydrogenase  32.28 
 
 		 372 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0315  xanthine dehydrogenase accessory factor  35.1 
 
 		 269 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0451  protein of unknown function DUF182  33.13 
 
 		 368 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375071  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3202  protein of unknown function DUF182  32.07 
 
 		 421 aa  134  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5428  Xanthine dehydrogenase  31.04 
 
 		 389 aa  132  7.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1381  protein of unknown function DUF182  40.8 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  31.19 
 
 		 306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0253  protein of unknown function DUF182  29.45 
 
 		 337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0507983 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0202  hypothetical protein  37 
 
 		 246 aa  130  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1696  protein of unknown function DUF182  41.33 
 
 		 277 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3973  hypothetical protein  30.77 
 
 		 398 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  32.14 
 
 		 340 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1485  hypothetical protein  41.42 
 
 		 374 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.682746  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  30.65 
 
 		 316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2480  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  29.62 
 
 		 402 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0103  Alanine dehydrogenase  30.06 
 
 		 385 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.529042 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3936  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  37.43 
 
 		 526 aa  124  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.138744  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  30.28 
 
 		 306 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  28.17 
 
 		 372 aa  124  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4481  hypothetical protein  31.43 
 
 		 395 aa  123  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10381  hypothetical protein  31.75 
 
 		 380 aa  122  6e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000724106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0089  hypothetical protein  29.97 
 
 		 342 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2200  hypothetical protein  29.36 
 
 		 382 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707411 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2839  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  38.81 
 
 		 240 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0125  hypothetical protein  28.16 
 
 		 386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0709  alanine dehydrogenase  29.14 
 
 		 332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  28.82 
 
 		 340 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5194  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  28.45 
 
 		 364 aa  119  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0419  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  28.94 
 
 		 340 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.039658  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25830  hypothetical protein  27.75 
 
 		 329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501446  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0902  hypothetical protein  27.87 
 
 		 319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.88424  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  28.79 
 
 		 318 aa  117  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  28.61 
 
 		 345 aa  116  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2351  hypothetical protein  27.41 
 
 		 329 aa  115  7.999999999999999e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.92954  normal  0.47129 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  28.45 
 
 		 453 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1893  hypothetical protein  30.97 
 
 		 331 aa  115  8.999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4168  hypothetical protein  28 
 
 		 326 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0530695  normal  0.0915222 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2772  Alanine dehydrogenase  31.89 
 
 		 395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3868  protein of unknown function DUF182  31.3 
 
 		 389 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  43.59 
 
 		 385 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  29.45 
 
 		 323 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0200  hypothetical protein  30.95 
 
 		 369 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0521133  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1348  protein of unknown function DUF182  27.27 
 
 		 343 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.385014  normal  0.0761003 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1412  protein of unknown function DUF182  27.27 
 
 		 343 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.070466  normal  0.227253 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0780  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  30.82 
 
 		 313 aa  112  9e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.659301  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0923  protein of unknown function DUF182  30.82 
 
 		 313 aa  112  9e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0727  Xanthine and CO dehydrogenase maturation factor XdhC/CoxF family-like protein  38.04 
 
 		 329 aa  112  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.666329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6196  hypothetical protein  31.69 
 
 		 389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0286136 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4124  protein of unknown function DUF182  30.51 
 
 		 375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01780  hypothetical protein  42.31 
 
 		 327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0362  protein of unknown function DUF182  36.84 
 
 		 265 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00300908  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1734  hypothetical protein  35.26 
 
 		 282 aa  111  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0628  hypothetical protein  28.96 
 
 		 312 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  28.21 
 
 		 341 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>