More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1257 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1257  excinuclease ABC, C subunit  100 
 
 		 677 aa  1373    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3248  excinuclease ABC subunit C  45.56 
 
 		 617 aa  499  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0365  excinuclease ABC subunit C  44.41 
 
 		 636 aa  489  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.312712  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0553  excinuclease ABC subunit C  43.41 
 
 		 612 aa  488  1e-136  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014331  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2375  excinuclease ABC subunit C  43.44 
 
 		 626 aa  482  1e-135  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  41.23 
 
 		 624 aa  475  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  43.44 
 
 		 614 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0579  excinuclease ABC subunit C  44.65 
 
 		 604 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3279  excinuclease ABC subunit C  43.77 
 
 		 613 aa  456  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  41.08 
 
 		 607 aa  458  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4046  excinuclease ABC subunit C  41.69 
 
 		 649 aa  456  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  39.48 
 
 		 607 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3961  excinuclease ABC subunit C  41.65 
 
 		 623 aa  455  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00581214  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  39.48 
 
 		 607 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  39.5 
 
 		 588 aa  449  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  39.45 
 
 		 607 aa  441  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  41.05 
 
 		 614 aa  431  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  40.74 
 
 		 613 aa  431  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  36.9 
 
 		 625 aa  426  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5066  excinuclease ABC, C subunit  40.63 
 
 		 689 aa  427  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.616948 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  41.63 
 
 		 622 aa  424  1e-117  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  36.57 
 
 		 641 aa  421  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1391  excinuclease ABC, C subunit  42.16 
 
 		 605 aa  419  1e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1485  excinuclease ABC subunit C  38.55 
 
 		 598 aa  420  1e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2975  excinuclease ABC, C subunit  39.94 
 
 		 708 aa  418  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.720202  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  39.02 
 
 		 613 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1879  excinuclease ABC subunit C  38.87 
 
 		 617 aa  417  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2488  excinuclease ABC subunit C  39.26 
 
 		 716 aa  412  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.820608  normal  0.0424579 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1279  excinuclease ABC subunit C  40.12 
 
 		 707 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0496012  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  37.46 
 
 		 653 aa  412  1e-113  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1777  excinuclease ABC, C subunit  40.23 
 
 		 636 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0413401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2678  excinuclease ABC subunit C  39.78 
 
 		 707 aa  409  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  36.38 
 
 		 685 aa  405  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2582  excinuclease ABC subunit C  39.32 
 
 		 707 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0298778  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  35.82 
 
 		 615 aa  398  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  36.54 
 
 		 593 aa  399  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  39.64 
 
 		 611 aa  393  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3342  excinuclease ABC subunit C  37.24 
 
 		 622 aa  389  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.991937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  35.62 
 
 		 601 aa  392  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2359  excinuclease ABC, C subunit  37.01 
 
 		 671 aa  391  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.660798  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  37.46 
 
 		 594 aa  388  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  37.46 
 
 		 594 aa  389  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  38.41 
 
 		 596 aa  388  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  37.46 
 
 		 594 aa  388  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  37.46 
 
 		 594 aa  389  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  37.46 
 
 		 594 aa  389  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  37.62 
 
 		 594 aa  387  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  37.46 
 
 		 594 aa  388  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  37.46 
 
 		 594 aa  388  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  34.57 
 
 		 620 aa  387  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  34.73 
 
 		 620 aa  388  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2978  excinuclease ABC, C subunit  36.69 
 
 		 665 aa  389  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000426335 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5206  excinuclease ABC, C subunit  38 
 
 		 649 aa  387  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3014  excinuclease ABC, C subunit  36.74 
 
 		 675 aa  384  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  38.14 
 
 		 619 aa  383  1e-105  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  38.15 
 
 		 591 aa  385  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  37.13 
 
 		 594 aa  384  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1362  excinuclease ABC subunit C  38.97 
 
 		 611 aa  385  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.884945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3154  excinuclease ABC, C subunit  35.72 
 
 		 669 aa  385  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  37.06 
 
 		 613 aa  382  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1120  excinuclease ABC subunit C  36.01 
 
 		 617 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4295  excinuclease ABC subunit C  37.04 
 
 		 627 aa  380  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  33.22 
 
 		 613 aa  379  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0607  excinuclease ABC subunit C  36.97 
 
 		 594 aa  379  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1849  excinuclease ABC subunit C  38.8 
 
 		 610 aa  380  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0109871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  38.42 
 
 		 607 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  38.17 
 
 		 599 aa  381  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1091  excinuclease ABC subunit C  36.01 
 
 		 617 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  35.49 
 
 		 604 aa  382  1e-104  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4536  excinuclease ABC, C subunit  37.97 
 
 		 647 aa  380  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00719023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11300  excinuclease ABC subunit C  35.19 
 
 		 643 aa  381  1e-104  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222126  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2526  excinuclease ABC subunit C  37.6 
 
 		 666 aa  380  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.775537  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2796  excinuclease ABC, C subunit  36.59 
 
 		 679 aa  378  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172579  decreased coverage  0.00000392618 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2021  excinuclease ABC subunit C  36.31 
 
 		 656 aa  379  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387091  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  35.94 
 
 		 613 aa  377  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11449  excinuclease ABC subunit C  38.24 
 
 		 646 aa  377  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.185294 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1733  excinuclease ABC, C subunit  38.97 
 
 		 610 aa  375  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110405  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  37.95 
 
 		 590 aa  375  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2011  excinuclease ABC subunit C  38.97 
 
 		 610 aa  374  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000678771  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1681  excinuclease ABC, C subunit  37.29 
 
 		 626 aa  375  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2436  excinuclease ABC subunit C  36.85 
 
 		 676 aa  375  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2859  excinuclease ABC subunit C  37.83 
 
 		 623 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.41177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1074  excinuclease ABC subunit C  37.85 
 
 		 623 aa  375  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.969621  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2685  excinuclease ABC subunit C  38.97 
 
 		 610 aa  374  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000130785  normal  0.0663039 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2735  excinuclease ABC subunit C  37.85 
 
 		 623 aa  375  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.296974  normal  0.0935486 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3919  excinuclease ABC subunit C  38.25 
 
 		 631 aa  372  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2053  excinuclease ABC subunit C  35.76 
 
 		 612 aa  373  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.747011 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1553  excinuclease ABC subunit C  33.85 
 
 		 638 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081195 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  35.65 
 
 		 610 aa  374  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2395  excinuclease ABC subunit C  36.85 
 
 		 676 aa  375  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0659  excinuclease ABC subunit C  37.75 
 
 		 609 aa  373  1e-102  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.25379  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0644  excinuclease ABC subunit C  37.98 
 
 		 631 aa  373  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1726  excinuclease ABC subunit C  38.97 
 
 		 610 aa  374  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000100265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15780  Excinuclease ABC subunit C  37.4 
 
 		 658 aa  374  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.160684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2146  excinuclease ABC subunit C  38.97 
 
 		 610 aa  374  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000023615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2442  excinuclease ABC subunit C  36.85 
 
 		 676 aa  375  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2697  excinuclease ABC subunit C  36.67 
 
 		 678 aa  373  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1192  excinuclease ABC, C subunit  38.37 
 
 		 619 aa  375  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0751579  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2133  excinuclease ABC subunit C  36.67 
 
 		 604 aa  370  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00985622  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2161  excinuclease ABC subunit C  38.97 
 
 		 610 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138205  hitchhiker  0.0000000035589 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>