291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1240 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1240  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 
114 aa  226  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.659198  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  52.83 
 
 
106 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  54.74 
 
 
143 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2010  preprotein translocase, YajC subunit  50 
 
 
107 aa  102  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798178  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  49.51 
 
 
106 aa  100  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  62.67 
 
 
106 aa  100  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  62.67 
 
 
105 aa  100  9e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  51.46 
 
 
106 aa  98.6  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1817  protein translocase subunit yajC  53.76 
 
 
119 aa  94.7  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0910437  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  45.22 
 
 
143 aa  93.6  8e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  44.21 
 
 
109 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  45.98 
 
 
114 aa  90.5  7e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00524  preprotein translocase subunit YajC  44.94 
 
 
117 aa  89.7  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  45.74 
 
 
107 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  45.74 
 
 
107 aa  89.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  45.74 
 
 
107 aa  89.4  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  45.74 
 
 
107 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  45.74 
 
 
107 aa  89.4  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  45.74 
 
 
107 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  44.68 
 
 
107 aa  88.2  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0727  preprotein translocase subunit YajC  45.88 
 
 
93 aa  88.2  3e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0798345  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1799  preprotein translocase, YajC subunit  53.75 
 
 
107 aa  88.2  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.675653  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  47.19 
 
 
109 aa  87.8  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1507  preprotein translocase, YajC subunit  47.13 
 
 
108 aa  88.2  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  47.19 
 
 
110 aa  87.8  5e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2441  preprotein translocase, YajC subunit  61.84 
 
 
97 aa  87.4  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000100189  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  48.84 
 
 
110 aa  87.4  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  46.59 
 
 
123 aa  87.4  6e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  47.67 
 
 
108 aa  87.4  6e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3035  preprotein translocase, YajC subunit  46.39 
 
 
104 aa  87  8e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  36.79 
 
 
120 aa  86.7  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2395  preprotein translocase, YajC subunit  55.26 
 
 
96 aa  86.7  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115356  normal  0.982438 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  48.42 
 
 
111 aa  86.7  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0542  preprotein translocase, YajC subunit  49.38 
 
 
133 aa  86.7  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0292946 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  50 
 
 
94 aa  85.5  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  43.02 
 
 
108 aa  85.1  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  43.02 
 
 
108 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0168  preprotein translocase subunit YajC  42.16 
 
 
120 aa  84.7  4e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  43.02 
 
 
108 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  43.02 
 
 
108 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  43.02 
 
 
108 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  43.02 
 
 
108 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  43.02 
 
 
108 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  43.02 
 
 
108 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  44.57 
 
 
108 aa  84.3  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 
109 aa  84.3  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1340  preprotein translocase, YajC subunit  47.73 
 
 
121 aa  84  6e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.497494  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1697  preprotein translocase, YajC subunit  50 
 
 
114 aa  84  7e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  48.31 
 
 
108 aa  83.6  8e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  48.31 
 
 
108 aa  83.6  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  42.53 
 
 
127 aa  83.6  8e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  39.78 
 
 
102 aa  83.6  9e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0394  preprotein translocase, YajC subunit  41.82 
 
 
126 aa  83.2  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.918235  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  54.12 
 
 
93 aa  83.2  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1930  preprotein translocase, YajC subunit  46.3 
 
 
111 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2834  protein translocase subunit yajC  45.05 
 
 
109 aa  82.8  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0192  preprotein translocase subunit YajC  42.86 
 
 
120 aa  83.2  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4646  protein translocase subunit yajC  46.51 
 
 
94 aa  82  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.479824  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  44.19 
 
 
91 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4599  preprotein translocase, YajC subunit  40.95 
 
 
110 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0858963  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4229  preprotein translocase, YajC subunit  40.95 
 
 
110 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2187  preprotein translocase, YajC subunit  39.62 
 
 
111 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548502  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4748  preprotein translocase, YajC subunit  42.17 
 
 
110 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0608539 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  48.28 
 
 
109 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3867  preprotein translocase, YajC subunit  43.02 
 
 
91 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  40.38 
 
 
168 aa  80.9  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  45.95 
 
 
103 aa  80.1  0.000000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  38.1 
 
 
108 aa  79.7  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  48.31 
 
 
105 aa  80.1  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1115  preprotein translocase, YajC subunit  41.24 
 
 
120 aa  79.7  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242644  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2809  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 
108 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1008  preprotein translocase, YajC subunit  38.3 
 
 
125 aa  79  0.00000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.868301  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1798  preprotein translocase, YajC subunit  43.14 
 
 
133 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225845  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5120  preprotein translocase, YajC subunit  44.19 
 
 
92 aa  79  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2854  preprotein translocase, YajC subunit  46.91 
 
 
114 aa  79.3  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134392 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  48.75 
 
 
113 aa  79.3  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1414  preprotein translocase, YajC subunit  45.12 
 
 
111 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.110073  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1229  preprotein translocase subunit YajC  45.12 
 
 
111 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0394922  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2183  preprotein translocase, YajC subunit  40.48 
 
 
113 aa  78.6  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2074  protein translocase subunit yajC  40.19 
 
 
109 aa  78.2  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721534  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1715  preprotein translocase, YajC subunit  44.19 
 
 
178 aa  78.2  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4308  preprotein translocase, YajC subunit  44.44 
 
 
115 aa  78.6  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2067  preprotein translocase, YajC subunit  50 
 
 
109 aa  78.6  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  40.45 
 
 
108 aa  78.6  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4407  protein translocase subunit yajC  43.14 
 
 
118 aa  78.2  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.201974 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2714  preprotein translocase subunit YajC  40.48 
 
 
109 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2275  preprotein translocase, YajC subunit  43.02 
 
 
110 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300335  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1458  preprotein translocase, YajC subunit  44.05 
 
 
99 aa  77.4  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000156531  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0706  preprotein translocase subunit YajC  44.44 
 
 
92 aa  77  0.00000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1291  preprotein translocase subunit YajC  42.68 
 
 
112 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14610  preprotein translocase subunit YajC  42.68 
 
 
112 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0680  preprotein translocase, YajC subunit  49.07 
 
 
118 aa  77  0.00000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0730138  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0839  preprotein translocase, YajC subunit  42.17 
 
 
111 aa  76.3  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2078  protein translocase subunit yajC  45.88 
 
 
106 aa  76.6  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.459618  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1770  preprotein translocase subunit, YajC  42.86 
 
 
133 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.131308  decreased coverage  0.00406868 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  40.43 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2490  preprotein translocase, YajC subunit  42.68 
 
 
111 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  39.29 
 
 
110 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3886  preprotein translocase, YajC subunit  44.05 
 
 
93 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305651  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2777  preprotein translocase, YajC subunit  39.58 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.209285  normal  0.314245 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>