More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1239 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  100 
 
 		 533 aa  1065    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  50.84 
 
 		 532 aa  547  1e-154  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  52.63 
 
 		 533 aa  543  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  50.47 
 
 		 532 aa  541  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  51.8 
 
 		 531 aa  543  1e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  51.14 
 
 		 533 aa  544  1e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0854  preprotein translocase subunit SecD  52.08 
 
 		 533 aa  537  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  50.38 
 
 		 530 aa  534  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  50.75 
 
 		 530 aa  523  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  50 
 
 		 530 aa  524  1e-147  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  50.48 
 
 		 532 aa  523  1e-147  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  50.38 
 
 		 533 aa  519  1e-146  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  49.34 
 
 		 532 aa  510  1e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  51.97 
 
 		 524 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000311445  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  52.06 
 
 		 533 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0503  preprotein translocase subunit SecD  47.65 
 
 		 534 aa  501  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153104  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1929  preprotein translocase subunit SecD  50.09 
 
 		 526 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  47.46 
 
 		 525 aa  478  1e-133  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  42.91 
 
 		 535 aa  417  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  42.59 
 
 		 533 aa  395  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  42.12 
 
 		 532 aa  394  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  41.04 
 
 		 856 aa  394  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  42.03 
 
 		 594 aa  392  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  42.03 
 
 		 594 aa  392  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4644  preprotein translocase subunit SecD  41.07 
 
 		 632 aa  386  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3355  preprotein translocase subunit SecD  41.27 
 
 		 632 aa  382  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  42.49 
 
 		 533 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4005  preprotein translocase subunit SecD  41.46 
 
 		 632 aa  385  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  42.67 
 
 		 533 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0838  preprotein translocase subunit SecD  40.5 
 
 		 640 aa  376  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2350  preprotein translocase subunit SecD  40.97 
 
 		 618 aa  377  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.951904  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  42.07 
 
 		 533 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  40.48 
 
 		 533 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1303  protein-export membrane protein SecD  41.52 
 
 		 622 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  40.77 
 
 		 534 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0512  protein-export membrane protein SecD  39.73 
 
 		 609 aa  371  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0707  preprotein translocase subunit SecD  42.64 
 
 		 521 aa  369  1e-101  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.907979  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2540  protein-export membrane protein SecD  38.22 
 
 		 613 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.712905  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  38.21 
 
 		 531 aa  362  1e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.82 
 
 		 856 aa  360  2e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3280  preprotein translocase subunit SecD  39.65 
 
 		 625 aa  361  2e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.527735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1714  preprotein translocase subunit SecD  39.71 
 
 		 537 aa  360  2e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0071  preprotein translocase subunit SecD  42.72 
 
 		 510 aa  361  2e-98  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0476  preprotein translocase subunit SecD  39.62 
 
 		 526 aa  360  4e-98  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2079  preprotein translocase protein SecD  41.76 
 
 		 604 aa  359  6e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2066  preprotein translocase subunit SecD  40.19 
 
 		 623 aa  359  8e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.666611  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2073  preprotein translocase subunit SecD  40.61 
 
 		 535 aa  358  9.999999999999999e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0728  preprotein translocase subunit SecD  40.95 
 
 		 529 aa  358  9.999999999999999e-98  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.347162  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  42.49 
 
 		 839 aa  358  1.9999999999999998e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1048  preprotein translocase subunit SecD  40.95 
 
 		 526 aa  358  1.9999999999999998e-97  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  39.64 
 
 		 535 aa  358  1.9999999999999998e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.46 
 
 		 853 aa  356  6.999999999999999e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0344  preprotein translocase subunit SecD  40.19 
 
 		 633 aa  355  8.999999999999999e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.296213 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  41.24 
 
 		 844 aa  354  2e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4087  preprotein translocase subunit SecD  39.39 
 
 		 636 aa  353  4e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.15751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1309  protein-export membrane protein SecD  37.4 
 
 		 613 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.198651  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  41.72 
 
 		 554 aa  348  1e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  41.72 
 
 		 554 aa  348  1e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  38.07 
 
 		 531 aa  348  1e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3866  preprotein translocase subunit SecD  39.35 
 
 		 626 aa  347  2e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5119  preprotein translocase subunit SecD  39.04 
 
 		 627 aa  347  4e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1575  preprotein translocase subunit SecD  39.3 
 
 		 521 aa  347  4e-94  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1696  preprotein translocase subunit SecD  39.46 
 
 		 618 aa  347  4e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  40.35 
 
 		 554 aa  345  1e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_004310  BR1324  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.62 
 
 		 845 aa  344  2.9999999999999997e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0375911  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  38.02 
 
 		 532 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0878  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.48 
 
 		 834 aa  343  5e-93  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.335263  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2427  preprotein translocase subunit SecD  39.53 
 
 		 614 aa  343  5e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1230  preprotein translocase subunit SecD  37.15 
 
 		 614 aa  342  7e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181896  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2276  protein-export membrane protein SecD  39.07 
 
 		 534 aa  342  7e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.394363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  40.47 
 
 		 554 aa  342  8e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1437  preprotein translocase subunit SecD  39.08 
 
 		 616 aa  342  1e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013441  hitchhiker  0.000143717 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1284  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.44 
 
 		 844 aa  341  2e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1449  preprotein translocase subunit SecD  39.08 
 
 		 616 aa  341  2e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00202636  normal  0.0146122 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3108  preprotein translocase subunit SecD  36.95 
 
 		 532 aa  340  2.9999999999999998e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.2173 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  39.96 
 
 		 554 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  46.91 
 
 		 403 aa  340  2.9999999999999998e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2433  preprotein translocase subunit SecD  38.99 
 
 		 618 aa  340  4e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3409  preprotein translocase subunit SecD  38.96 
 
 		 621 aa  340  5e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.768129  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2191  preprotein translocase subunit SecD  38.66 
 
 		 616 aa  339  7e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111681  decreased coverage  0.00360319 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2491  protein-export membrane protein SecD  38.03 
 
 		 534 aa  339  8e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.743414  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004365  protein-export membrane protein SecD  38.96 
 
 		 607 aa  339  9e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.59973  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0146  protein-export membrane protein SecD  41.78 
 
 		 535 aa  339  9.999999999999999e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00836416  hitchhiker  0.00269224 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4747  protein-export membrane protein SecD  38.08 
 
 		 533 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122054  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2880  preprotein translocase subunit SecD  39.39 
 
 		 616 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000488716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4598  protein-export membrane protein SecD  38.48 
 
 		 532 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.278601  normal  0.122779 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2805  preprotein translocase subunit SecD  39.39 
 
 		 616 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000153559  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1291  protein-export membrane protein SecD  37.87 
 
 		 622 aa  337  1.9999999999999998e-91  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.00000000000000635694  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2785  preprotein translocase subunit SecD  39.39 
 
 		 616 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000401853  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4228  protein-export membrane protein SecD  38.48 
 
 		 532 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1410  protein-export membrane protein SecD  37.09 
 
 		 613 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.447303  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2184  protein-export membrane protein SecD  39.93 
 
 		 620 aa  337  3.9999999999999995e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1384  preprotein translocase subunit SecD  38.89 
 
 		 616 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000494152  hitchhiker  0.000000727457 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2188  protein-export membrane protein SecD  38.29 
 
 		 534 aa  336  7e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521622  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01048  preprotein translocase subunit SecD  38.58 
 
 		 607 aa  336  7e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1621  protein-export membrane protein SecD  38.81 
 
 		 522 aa  336  7e-91  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2835  preprotein translocase subunit SecD  36.78 
 
 		 616 aa  335  1e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1572  preprotein translocase subunit SecD  39.4 
 
 		 616 aa  335  1e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000232578  hitchhiker  0.00000015395 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1111  preprotein translocase subunit SecD  39.81 
 
 		 526 aa  335  1e-90  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.789718  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0277  preprotein translocase subunit SecD  38.85 
 
 		 626 aa  335  1e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.130868  normal  0.176148 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>