More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1213 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  100 
 
 		 601 aa  1223    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  35.68 
 
 		 599 aa  317  3e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  32.46 
 
 		 613 aa  317  5e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  33.83 
 
 		 583 aa  317  5e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3370  DNA primase  39.24 
 
 		 674 aa  316  8e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  33 
 
 		 582 aa  316  9e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  43.32 
 
 		 619 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  38.24 
 
 		 600 aa  312  9e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  34.99 
 
 		 599 aa  310  5.9999999999999995e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  36.57 
 
 		 593 aa  308  1.0000000000000001e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  36.9 
 
 		 604 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  35.77 
 
 		 605 aa  303  4.0000000000000003e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  32.43 
 
 		 599 aa  303  8.000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  38.39 
 
 		 595 aa  301  2e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  38.15 
 
 		 595 aa  299  1e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0276  DNA primase  37.94 
 
 		 660 aa  297  4e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  34.75 
 
 		 601 aa  297  4e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  33.06 
 
 		 595 aa  297  4e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  33.33 
 
 		 588 aa  296  8e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  34.34 
 
 		 587 aa  296  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  36.61 
 
 		 600 aa  293  5e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  32.11 
 
 		 587 aa  293  6e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  30.26 
 
 		 626 aa  291  2e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  36.3 
 
 		 571 aa  291  3e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  36.3 
 
 		 598 aa  291  3e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  36.3 
 
 		 598 aa  291  3e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  36.3 
 
 		 598 aa  290  4e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  36.3 
 
 		 598 aa  290  4e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  38.74 
 
 		 651 aa  290  4e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  36.3 
 
 		 598 aa  290  4e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  34.86 
 
 		 544 aa  290  5.0000000000000004e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  38.74 
 
 		 652 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  36.73 
 
 		 598 aa  289  1e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0927  DNA primase  33.96 
 
 		 653 aa  288  1e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584516  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  36.16 
 
 		 598 aa  288  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  36.16 
 
 		 598 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  39.85 
 
 		 663 aa  287  4e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09410  DNA primase, catalytic core  39.32 
 
 		 618 aa  286  5e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.967138 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  39.85 
 
 		 664 aa  287  5e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  39.86 
 
 		 655 aa  286  8e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1807  DNA primase  40.58 
 
 		 576 aa  286  9e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000348842  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  41.97 
 
 		 613 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  38.65 
 
 		 638 aa  285  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  36.05 
 
 		 598 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 604 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4297  DNA primase  32.9 
 
 		 640 aa  284  3.0000000000000004e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.624136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  39.54 
 
 		 614 aa  284  4.0000000000000003e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5973  DNA primase  35.45 
 
 		 703 aa  284  4.0000000000000003e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  41.3 
 
 		 660 aa  282  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0271  DNA primase  34.73 
 
 		 675 aa  281  2e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.59752  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1835  DNA primase  32.58 
 
 		 623 aa  281  2e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15911  DNA primase  36.5 
 
 		 684 aa  281  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  37.5 
 
 		 663 aa  281  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  35.46 
 
 		 611 aa  281  3e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  33.27 
 
 		 601 aa  281  3e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2028  DNA primase  35.07 
 
 		 603 aa  281  4e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  33.05 
 
 		 604 aa  280  5e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  33.58 
 
 		 584 aa  280  7e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  39.45 
 
 		 660 aa  279  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  41.03 
 
 		 660 aa  279  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  33.72 
 
 		 582 aa  279  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  39.45 
 
 		 660 aa  279  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3400  DNA primase  33.81 
 
 		 581 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0281118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3396  DNA primase  33.81 
 
 		 581 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000108195  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3464  DNA primase  33.81 
 
 		 581 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0547765  hitchhiker  0.00925719 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10221  DNA primase  32.92 
 
 		 678 aa  278  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.081725  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3470  DNA primase  33.81 
 
 		 581 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00422758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  35.61 
 
 		 660 aa  277  4e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1128  DNA primase  29.13 
 
 		 598 aa  277  5e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012752  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  36.76 
 
 		 614 aa  276  5e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3566  DNA primase  36.62 
 
 		 581 aa  276  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0608711  normal  0.272103 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  37.05 
 
 		 676 aa  276  5e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0860  DNA primase  31.04 
 
 		 677 aa  276  6e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.262059  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  31.48 
 
 		 578 aa  276  6e-73  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09211  DNA primase  30.83 
 
 		 677 aa  276  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1295  DNA primase  36.27 
 
 		 686 aa  275  2.0000000000000002e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.830099  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09191  DNA primase  30.63 
 
 		 677 aa  275  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1716  DNA primase  37.9 
 
 		 626 aa  275  2.0000000000000002e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3369  DNA primase  34.39 
 
 		 584 aa  273  5.000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000957959  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0548  DNA primase  40.79 
 
 		 660 aa  273  8.000000000000001e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00859761  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2421  DNA primase  35.01 
 
 		 603 aa  272  1e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1427  DNA primase  33.13 
 
 		 602 aa  272  1e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0410677  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1620  DNA primase  32.4 
 
 		 605 aa  272  1e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0393306  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1589  DNA primase  37.73 
 
 		 633 aa  272  1e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.567407  normal  0.0206676 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1654  DNA primase  32.4 
 
 		 605 aa  272  1e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000285307  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3488  DNA primase  33.86 
 
 		 584 aa  272  1e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00314359  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  34.94 
 
 		 581 aa  271  2e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  34.94 
 
 		 581 aa  271  2e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7022  DNA primase  40.41 
 
 		 700 aa  271  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210771  normal  0.1359 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  34.94 
 
 		 581 aa  271  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1175  DNA primase  36.19 
 
 		 682 aa  271  2e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00198747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  34.94 
 
 		 581 aa  271  2e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  34.94 
 
 		 581 aa  271  2e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  34.94 
 
 		 581 aa  271  2e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3472  DNA primase  34.88 
 
 		 581 aa  270  4e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104863  normal  0.247756 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2216  DNA primase  35.05 
 
 		 603 aa  270  5e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  34.78 
 
 		 605 aa  270  5.9999999999999995e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  36.09 
 
 		 598 aa  270  5.9999999999999995e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  31.17 
 
 		 588 aa  270  7e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0554  DNA primase  33.67 
 
 		 582 aa  270  7e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000322663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>