71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1146 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1146  nitrate reductase, gamma subunit  100 
 
 		 330 aa  662    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.247321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1602  nitrate reductase, gamma subunit  67.27 
 
 		 330 aa  462  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000153702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0235  Nitrate reductase gamma subunit  62.95 
 
 		 332 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.911573  normal  0.884852 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0256  Nitrate reductase gamma subunit  59.16 
 
 		 333 aa  422  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0070  Nitrate reductase gamma subunit  61.16 
 
 		 335 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.289973 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1849  Nitrate reductase gamma subunit  59.38 
 
 		 331 aa  404  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000160376  normal  0.155774 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0270  Nitrate reductase gamma subunit  60.78 
 
 		 337 aa  397  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00809754  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2271  nitrate reductase, gamma subunit, putative  58.54 
 
 		 334 aa  394  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.237982  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0450  nitrate reductase gamma subunit  55.82 
 
 		 342 aa  393  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00150566  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1775  nitrate reductase, gamma subunit  58.84 
 
 		 334 aa  387  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.377874  normal  0.253755 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0136  nitrate reductase, gamma subunit  53.4 
 
 		 331 aa  366  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00937433  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0703  Nitrate reductase gamma subunit  51.54 
 
 		 331 aa  355  7.999999999999999e-97  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0396835  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0044  DsrM protein  53.4 
 
 		 331 aa  352  7e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.877712 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2313  Nitrate reductase gamma subunit  51.23 
 
 		 331 aa  348  5e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0037  Nitrate reductase gamma subunit  50 
 
 		 331 aa  344  2e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1948  DsrM protein  50.62 
 
 		 332 aa  330  2e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.542498  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0451  Nitrate reductase gamma subunit  50.3 
 
 		 339 aa  301  1e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.213571  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0049  nitrate reductase, gamma subunit  31.39 
 
 		 233 aa  133  3.9999999999999996e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000306057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1659  nitrate reductase, gamma subunit  33.91 
 
 		 255 aa  126  5e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2191  Nitrate reductase gamma subunit  34.81 
 
 		 249 aa  122  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.258292  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1957  nitrate reductase, gamma subunit  31.9 
 
 		 248 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.344796  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2479  putative DsrM protein  32.71 
 
 		 244 aa  118  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2192  hypothetical protein  28.42 
 
 		 255 aa  72  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3199  nitrate reductase, gamma subunit  28.35 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0075  Nitrate reductase gamma subunit  27.46 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.506128  hitchhiker  0.00856354 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0033  Nitrate reductase gamma subunit  25.97 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0575  nitrate reductase gamma subunit  24.05 
 
 		 277 aa  55.8  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0435677  normal  0.0173061 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0343  nitrate reductase gamma subunit  26.36 
 
 		 256 aa  51.6  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0242574 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1507  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  24.49 
 
 		 233 aa  51.6  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0172  nitrate reductase, gamma subunit  25.57 
 
 		 255 aa  50.8  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2233  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.76 
 
 		 235 aa  49.7  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2312  respiratory nitrate reductase gamma subunit  31.36 
 
 		 225 aa  49.7  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1535  nitrate reductase, gamma subunit  27.08 
 
 		 262 aa  49.7  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2894  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.13 
 
 		 240 aa  49.3  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104655  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0248  Nitrate reductase gamma subunit  23 
 
 		 299 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2638  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  30.26 
 
 		 234 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2305  respiratory nitrate reductase gamma subunit  24.88 
 
 		 227 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.369875  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2229  respiratory nitrate reductase gamma subunit  24.76 
 
 		 227 aa  47.4  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.125271  normal  0.0229196 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0206  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  28.05 
 
 		 222 aa  46.6  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4233  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.26 
 
 		 233 aa  46.6  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0298613  normal  0.327714 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6187  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.49 
 
 		 242 aa  46.2  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0410952  hitchhiker  0.00730194 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1528  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.81 
 
 		 234 aa  46.2  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000209931  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0296  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  22.11 
 
 		 241 aa  46.2  0.0009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1974  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  28.42 
 
 		 229 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2278  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.89 
 
 		 229 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.339538  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1333  respiratory nitrate reductase gamma subunit  27.27 
 
 		 225 aa  45.4  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2703  respiratory nitrate reductase gamma subunit  23.56 
 
 		 234 aa  45.1  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.304029  normal  0.077943 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5681  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  24.12 
 
 		 254 aa  45.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2128  respiratory nitrate reductase subunit gamma  27.37 
 
 		 229 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.833335  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1935  nitrate reductase, gamma subunit  26.84 
 
 		 229 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.840407  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1957  nitrate reductase, gamma subunit  27.37 
 
 		 228 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0223608  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1980  respiratory nitrate reductase subunit gamma  27.37 
 
 		 229 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.689777  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0272  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  22.16 
 
 		 241 aa  44.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1774  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  23.6 
 
 		 225 aa  44.3  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.079326  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2161  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.37 
 
 		 229 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2125  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  24.12 
 
 		 254 aa  43.5  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0177  nitrate reductase, gamma subunit  23.31 
 
 		 302 aa  43.5  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.862434 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1634  hypothetical protein  25.51 
 
 		 220 aa  43.1  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13830  respiratory nitrate reductase gamma chain  24.39 
 
 		 227 aa  43.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.792747  normal  0.19596 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1237  respiratory nitrate reductase gamma chain  24.88 
 
 		 227 aa  43.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.928903  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2418  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.38 
 
 		 225 aa  43.1  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00170587  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2138  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.37 
 
 		 229 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1000  respiratory nitrate reductase gamma subunit  30.77 
 
 		 231 aa  43.1  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1711  respiratory nitrate reductase 1, gamma subunit  27.38 
 
 		 225 aa  42.7  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.163334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1395  respiratory nitrate reductase 1, gamma subunit  27.38 
 
 		 225 aa  42.7  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1912  respiratory nitrate reductase 1, gamma subunit  27.38 
 
 		 225 aa  42.7  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0870039  normal  0.196031 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01215  hypothetical protein  27.38 
 
 		 225 aa  42.7  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.316454  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2396  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.38 
 
 		 225 aa  42.7  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000178622 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1378  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.38 
 
 		 225 aa  42.7  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653452  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1337  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.38 
 
 		 225 aa  42.7  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00180394  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01205  nitrate reductase 1, gamma (cytochrome b(NR)) subunit  27.38 
 
 		 225 aa  42.7  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.372615  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>