More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1103 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1103  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 
266 aa  536  1e-151  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2760  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  69.2 
 
 
250 aa  365  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1281  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  72.47 
 
 
249 aa  363  2e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.234909  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2439  cobalt transport protein ATP-binding subunit  72.06 
 
 
252 aa  358  6e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2004  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  67.21 
 
 
249 aa  336  2e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.25623e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2223  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  65.18 
 
 
249 aa  329  3e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  2.84786e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1801  ABC transporter related protein  61.51 
 
 
254 aa  325  4e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.447386  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1184  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  59.51 
 
 
254 aa  320  2e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116331  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2767  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  62.8 
 
 
255 aa  315  4e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1198  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  66.53 
 
 
256 aa  302  4e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0172513  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1807  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  60.87 
 
 
256 aa  266  3e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  7.2763e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4018  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  56.22 
 
 
259 aa  259  2e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0995  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  55.79 
 
 
243 aa  259  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0515  cobalt ABC transporter ATPase subunit  56.28 
 
 
271 aa  249  3e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0790003  normal  0.0377696 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  51.76 
 
 
270 aa  248  7e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1354  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  53.53 
 
 
252 aa  248  7e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1041  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  52.96 
 
 
270 aa  244  8e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.286064 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0484  ABC transporter related  47.9 
 
 
240 aa  244  1e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1119  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  52.77 
 
 
257 aa  243  3e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4263  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  51.05 
 
 
259 aa  241  7e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.493384 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0782  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  50.63 
 
 
244 aa  238  6e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0490  ABC transporter related  47.06 
 
 
239 aa  236  2e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1930  ABC transporter related protein  47.84 
 
 
258 aa  236  3e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2137  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  50.84 
 
 
264 aa  236  4e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2294  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  47.7 
 
 
246 aa  233  2e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.663382  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2007  ABC transporter related  45.61 
 
 
239 aa  232  5e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0936195  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0093  cobalt transporter ATP-binding subunit  46.86 
 
 
278 aa  231  6e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1009  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  51.49 
 
 
253 aa  231  6e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0648112  normal  0.387101 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0692  ABC transporter related  45.68 
 
 
244 aa  231  1e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0059  ABC transporter related  46 
 
 
255 aa  230  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4055  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  49.57 
 
 
250 aa  230  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.50741  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0057  ABC transporter related  45.6 
 
 
255 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0112195  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0542  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  49.38 
 
 
255 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5176  ABC transporter related  48.93 
 
 
246 aa  226  3e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0169  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  53.55 
 
 
252 aa  226  3e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 
256 aa  225  5e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286665  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2066  ABC transporter related  51.35 
 
 
247 aa  225  6e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0721765  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0793  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.19 
 
 
278 aa  225  6e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2112  ABC transporter related  51.35 
 
 
247 aa  225  6e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.703459  normal  0.0210861 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1572  cobalt ABC transporter ATPase subunit  48.29 
 
 
242 aa  224  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3208  cobalt transport protein ATP-binding subunit  46.09 
 
 
398 aa  224  1e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2049  ABC transporter related  52.07 
 
 
251 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2604  cobalt transporter ATP-binding subunit  47.54 
 
 
288 aa  223  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.573166  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1478  cobalt transporter ATP-binding subunit  46.67 
 
 
277 aa  223  2e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1151  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.45 
 
 
276 aa  223  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.949542  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0728  cobalt transporter ATP-binding subunit  44.77 
 
 
281 aa  224  2e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.216376  normal  0.366989 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1384  ABC transporter related  41.63 
 
 
283 aa  223  3e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1045  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.83 
 
 
277 aa  222  5e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  46.31 
 
 
403 aa  221  1e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.800126  normal  0.0150506 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1190  cobalt transporter ATP-binding subunit  44.77 
 
 
281 aa  221  1e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2149  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  43.62 
 
 
453 aa  218  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.585974 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0528  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  47.56 
 
 
402 aa  217  2e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1858  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  45.02 
 
 
541 aa  216  3e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3733  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.62 
 
 
283 aa  216  4e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000159277  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0577  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  45.08 
 
 
395 aa  214  9e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1759  ABC transporter related  44.06 
 
 
291 aa  212  4e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.807562  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1074  hypothetical protein  43.9 
 
 
380 aa  213  4e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1705  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.41 
 
 
411 aa  211  7e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1219  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  43.21 
 
 
456 aa  211  9e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1697  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39 
 
 
440 aa  211  1e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  2.92327e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0188  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.8 
 
 
285 aa  208  7e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.790607  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0185  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.39 
 
 
285 aa  207  2e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.74 
 
 
284 aa  205  6e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  1.76304e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1063  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.21 
 
 
284 aa  205  8e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0204485  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0713  ABC transporter related  43.15 
 
 
282 aa  204  9e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2472  ABC transporter related  40.08 
 
 
263 aa  203  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0143  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.19 
 
 
281 aa  203  2e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.13815  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1219  cobalt transport protein ATP-binding subunit  43.8 
 
 
284 aa  202  4e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0275  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  51.65 
 
 
270 aa  199  3e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1404  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.51 
 
 
277 aa  199  4e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2564  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.86 
 
 
273 aa  198  6e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  4.82859e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1391  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.92 
 
 
310 aa  198  9e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0500494  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0189  ABC transporter related  43.33 
 
 
242 aa  197  2e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000239046  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.86 
 
 
403 aa  196  4e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0326  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.78 
 
 
276 aa  195  6e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.339036  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1750  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  47.98 
 
 
248 aa  195  6e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79026  normal  0.0336767 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1269  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.15 
 
 
281 aa  195  6e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2562  ABC transporter, ATP-binding protein  42.68 
 
 
274 aa  194  9e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.196355 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0563  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  45.89 
 
 
243 aa  193  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0884  ABC transporter related protein  41.43 
 
 
255 aa  192  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0646  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  49.07 
 
 
244 aa  191  8e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2132  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.2 
 
 
261 aa  188  1e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1059  ABC transporter, ATP-binding protein  41.06 
 
 
276 aa  187  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2734  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.68 
 
 
285 aa  187  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.144622  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1011  ABC transporter related  38.11 
 
 
287 aa  187  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  8.09706e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  38.4 
 
 
568 aa  186  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0898  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.52 
 
 
286 aa  186  5e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  1.82138e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1861  ABC transporter related  43.7 
 
 
265 aa  186  5e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00288336  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0226  ABC transporter related  38.24 
 
 
290 aa  185  6e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00993646  normal  0.660997 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01480  ABC transporter related  41.05 
 
 
283 aa  185  6e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.23426e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02430  ABC transporter related  41.05 
 
 
283 aa  185  6e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.296301  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0791  ABC transporter related  39.58 
 
 
280 aa  185  8e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0233186  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1985  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.86 
 
 
276 aa  182  4e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1010  ABC transporter related  38.06 
 
 
272 aa  182  4e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000205509  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1086  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  39.22 
 
 
277 aa  182  5e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1639  ABC transporter related  41.39 
 
 
278 aa  182  7e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000187307 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0317  ABC transporter related  45.65 
 
 
283 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000872921  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1223  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.92 
 
 
285 aa  179  5e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000401598  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1006  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.18 
 
 
271 aa  178  7e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1687  ABC transporter related  38.31 
 
 
288 aa  178  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>