More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1045 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  100 
 
 
350 aa  714  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  5.96347e-06  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  44.24 
 
 
350 aa  297  2e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  46.33 
 
 
346 aa  289  4e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  45.76 
 
 
347 aa  288  1e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  41.39 
 
 
350 aa  285  6e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  42.63 
 
 
351 aa  284  2e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  40.75 
 
 
337 aa  280  2e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  41.39 
 
 
351 aa  280  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  42.64 
 
 
350 aa  277  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  42.64 
 
 
350 aa  276  3e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  43.27 
 
 
371 aa  276  5e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  43.26 
 
 
346 aa  274  2e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  41.59 
 
 
333 aa  263  3e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  40.25 
 
 
331 aa  255  1e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  40.79 
 
 
332 aa  252  7e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  40 
 
 
330 aa  247  3e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  38.41 
 
 
334 aa  238  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.93674e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  38.41 
 
 
334 aa  237  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  38.1 
 
 
330 aa  237  3e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  38.1 
 
 
330 aa  236  6e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  42.32 
 
 
350 aa  235  7e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  37.78 
 
 
330 aa  234  1e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  37.14 
 
 
330 aa  233  5e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  38.08 
 
 
337 aa  232  7e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  36.94 
 
 
341 aa  230  3e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  36.25 
 
 
354 aa  223  4e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  33.13 
 
 
335 aa  220  3e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  4.39413e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  36.78 
 
 
355 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.3583e-11 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  36.96 
 
 
345 aa  211  2e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  36.7 
 
 
338 aa  209  8e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  1.59336e-12  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  34.47 
 
 
335 aa  208  1e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  34.16 
 
 
335 aa  206  4e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  35.89 
 
 
356 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  35.96 
 
 
362 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  35.89 
 
 
356 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  33.23 
 
 
335 aa  201  1e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  34.47 
 
 
332 aa  199  5e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  35.58 
 
 
384 aa  198  1e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  32.71 
 
 
336 aa  197  2e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  31.38 
 
 
341 aa  197  3e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  31.6 
 
 
346 aa  194  2e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  32.92 
 
 
332 aa  192  5e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  34.41 
 
 
335 aa  192  9e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  34.63 
 
 
325 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  35.6 
 
 
357 aa  189  7e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  32.61 
 
 
337 aa  186  4e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  34.62 
 
 
351 aa  183  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  39.31 
 
 
341 aa  184  3e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  34.06 
 
 
355 aa  182  5e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  30.9 
 
 
368 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  34.29 
 
 
351 aa  177  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  34.29 
 
 
351 aa  177  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  34.29 
 
 
351 aa  176  5e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  31.6 
 
 
339 aa  176  8e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  32.42 
 
 
509 aa  175  1e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  30.21 
 
 
324 aa  170  3e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  32.29 
 
 
352 aa  169  7e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  34.26 
 
 
352 aa  168  1e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  33.33 
 
 
346 aa  164  2e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  33.33 
 
 
346 aa  164  2e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  33.65 
 
 
352 aa  164  2e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  34.38 
 
 
351 aa  158  2e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  32.27 
 
 
346 aa  157  4e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  33.23 
 
 
347 aa  155  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0972  hypothetical protein  29.63 
 
 
376 aa  147  3e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.625398  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  30.94 
 
 
359 aa  146  5e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2680  TrkA domain-containing protein  30 
 
 
397 aa  144  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  7.21375e-05  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  33.44 
 
 
366 aa  144  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1346  TrkA domain-containing protein  28.85 
 
 
376 aa  144  3e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.538374  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0721  hypothetical protein  28.85 
 
 
335 aa  144  3e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0771  hypothetical protein  31.13 
 
 
376 aa  141  2e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.94547  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5245  potassium channel protein, C-terminus  39.66 
 
 
182 aa  132  1e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.835427  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1030  conserved hypothetical protein (TrkA domain protein)  25.93 
 
 
375 aa  125  1e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.583921  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1601  hypothetical protein  27.21 
 
 
378 aa  125  1e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1743  TrkA-N domain protein  31.62 
 
 
256 aa  119  8e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.589845 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0419  TrkA-N domain protein  32.18 
 
 
313 aa  113  6e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  34.2 
 
 
395 aa  112  7e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  31.91 
 
 
388 aa  110  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  25.67 
 
 
531 aa  110  3e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5641  TrkA domain-containing protein  28.42 
 
 
364 aa  109  8e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.289182 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1025  putative potassium channel protein  27.69 
 
 
326 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0542  TrkA domain-containing protein  27.69 
 
 
326 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0270  putative potassium channel protein  27.69 
 
 
326 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.435171  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1293  TrkA domain-containing protein  27.69 
 
 
326 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5246  potassium channel protein, N-terminus  38.1 
 
 
146 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0630714  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2540  TrkA domain-containing protein  27.69 
 
 
369 aa  106  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0305515  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1286  putative potassium channel protein  27.69 
 
 
369 aa  106  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1364  TrkA domain-containing protein  27.69 
 
 
369 aa  106  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4504  TrkA domain-containing protein  28.03 
 
 
364 aa  106  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3710  TrkA-N  28.08 
 
 
364 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360814  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4658  TrkA domain-containing protein  28.08 
 
 
364 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.677832  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4046  TrkA domain-containing protein  28.03 
 
 
364 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.809582 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1162  TrkA-like protein  27.24 
 
 
386 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.30388 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1460  TrkA domain-containing protein  27.81 
 
 
413 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  32.56 
 
 
393 aa  103  5e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  32.79 
 
 
395 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4030  TrkA domain-containing protein  26.99 
 
 
364 aa  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.702941  normal  0.742816 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1993  TrkA-N domain protein  29.57 
 
 
399 aa  101  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0873902 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4906  TrkA-N domain protein  28.95 
 
 
368 aa  97.1  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0415092 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1138  TrkA-N domain protein  28.49 
 
 
366 aa  97.1  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.576747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>