More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1035 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  100 
 
 
189 aa  384  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  48.54 
 
 
181 aa  150  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  47.65 
 
 
190 aa  150  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  49.31 
 
 
198 aa  143  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  50.35 
 
 
217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  50.38 
 
 
213 aa  138  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  48.91 
 
 
189 aa  136  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  47.97 
 
 
188 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  46.32 
 
 
199 aa  132  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  47.02 
 
 
186 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  44.68 
 
 
200 aa  130  9e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  43.15 
 
 
208 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  45.06 
 
 
210 aa  129  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  44.44 
 
 
210 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1025  heat shock protein GrpE  46.62 
 
 
194 aa  127  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  43.79 
 
 
201 aa  125  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1194  GrpE protein  49.62 
 
 
201 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422814 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  45.95 
 
 
194 aa  125  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2165  GrpE protein  43.75 
 
 
191 aa  125  5e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.281053  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  38.02 
 
 
206 aa  125  5e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  41.5 
 
 
200 aa  124  7e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  37.5 
 
 
203 aa  124  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  44.03 
 
 
210 aa  123  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  48.97 
 
 
189 aa  123  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  42.47 
 
 
213 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  44.29 
 
 
204 aa  122  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  40.41 
 
 
260 aa  120  9e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  41.72 
 
 
208 aa  120  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  42.86 
 
 
209 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3010  heat shock protein GrpE  38.46 
 
 
250 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2828  heat shock protein GrpE  38.46 
 
 
241 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000182531  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  36.36 
 
 
188 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  43.42 
 
 
211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  38.13 
 
 
192 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2897  heat shock protein GrpE  38.46 
 
 
196 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  42.95 
 
 
195 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2877  heat shock protein GrpE  38.46 
 
 
196 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  36.46 
 
 
203 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  40.61 
 
 
192 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2895  heat shock protein GrpE  38.46 
 
 
196 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.804576  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0304  GrpE protein  41.43 
 
 
195 aa  119  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2881  GrpE protein  40.74 
 
 
181 aa  119  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  36.57 
 
 
188 aa  119  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  36.57 
 
 
188 aa  119  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  42.57 
 
 
205 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000976111  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  40.38 
 
 
199 aa  118  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  43.36 
 
 
200 aa  118  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  36.57 
 
 
188 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  36.57 
 
 
188 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  36.57 
 
 
188 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  36.57 
 
 
188 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  36.57 
 
 
188 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4484  GrpE protein  46.72 
 
 
244 aa  118  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3094  heat shock protein GrpE  38.58 
 
 
197 aa  117  7e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000190441  normal  0.118238 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  36.79 
 
 
206 aa  117  7e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  37.41 
 
 
192 aa  117  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  43.26 
 
 
204 aa  117  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2974  heat shock protein GrpE  38.95 
 
 
192 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  38.13 
 
 
198 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  36.79 
 
 
206 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  43.33 
 
 
225 aa  117  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  36.79 
 
 
206 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  41.33 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  36.79 
 
 
206 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  36.79 
 
 
206 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1378  heat shock protein GrpE  38.95 
 
 
192 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000995394  normal  0.160188 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0649  heat shock protein GrpE  42.96 
 
 
195 aa  117  9.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.127631  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2887  heat shock protein GrpE  38.95 
 
 
192 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.654980000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02502  heat shock protein  38.46 
 
 
197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000506013  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1061  Ribulose-phosphate 3-epimerase  38.46 
 
 
197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000037652  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4506  heat shock protein GrpE  43.75 
 
 
187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.316473  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  44.44 
 
 
185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  39.74 
 
 
199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4196  heat shock protein GrpE  43.75 
 
 
187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00395445  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3002  heat shock protein GrpE  38.46 
 
 
197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  7.86694e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2772  heat shock protein GrpE  38.46 
 
 
197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.080719999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2766  heat shock protein GrpE  38.46 
 
 
196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000506874  normal  0.0900785 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02466  hypothetical protein  38.46 
 
 
197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000587917  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1070  heat shock protein GrpE  38.46 
 
 
197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  0.0707842 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2898  heat shock protein GrpE  38.46 
 
 
196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000538048  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  43.75 
 
 
185 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  35.94 
 
 
206 aa  115  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  40.82 
 
 
212 aa  115  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  39.39 
 
 
185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  40.82 
 
 
198 aa  115  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4729  heat shock protein GrpE  44.44 
 
 
184 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  41.13 
 
 
194 aa  115  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3853  heat shock protein GrpE  38.14 
 
 
197 aa  115  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000510847  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1053  GrpE protein  46.92 
 
 
207 aa  115  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  42.11 
 
 
222 aa  114  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  44.44 
 
 
195 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  42.13 
 
 
207 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  45.65 
 
 
204 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0016  GrpE protein  42.11 
 
 
174 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0339785  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  43.57 
 
 
230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  43.57 
 
 
230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62990  heat shock protein GrpE  43.92 
 
 
186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142705  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0704  heat shock protein GrpE  40.83 
 
 
184 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.94046  hitchhiker  0.000436359 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  40.88 
 
 
195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2812  GrpE protein  46.67 
 
 
210 aa  112  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0237715  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>