249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1034 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1034  heat-inducible transcription repressor HrcA  100 
 
 		 348 aa  703    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00468429  hitchhiker  0.0007913 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  45.75 
 
 		 343 aa  339  5e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  47.52 
 
 		 342 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  45.59 
 
 		 343 aa  308  9e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  43.4 
 
 		 344 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  42.18 
 
 		 343 aa  299  6e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  40.87 
 
 		 357 aa  296  3e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3507  heat-inducible transcription repressor HrcA  43.82 
 
 		 343 aa  295  1e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848963  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3576  heat-inducible transcription repressor HrcA  43.82 
 
 		 343 aa  290  2e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2549  heat-inducible transcription repressor HrcA  39.89 
 
 		 357 aa  266  4e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0305  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.01 
 
 		 342 aa  263  4e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4476  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.44 
 
 		 354 aa  263  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.457422 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4330  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.86 
 
 		 355 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.54 
 
 		 347 aa  250  3e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4485  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.79 
 
 		 353 aa  248  8e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4466  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.79 
 
 		 353 aa  248  8e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.769802  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0458  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.57 
 
 		 351 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.482284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0868  negative regulator of class I heat shock protein  35.28 
 
 		 342 aa  239  5e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1478  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.5 
 
 		 351 aa  238  1e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1902  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.61 
 
 		 350 aa  235  1.0000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1514  heat-inducible transcription repressor  36.55 
 
 		 349 aa  233  3e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2813  negative regulator of class I heat shock protein  37.5 
 
 		 349 aa  230  2e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.222938  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1457  heat-inducible transcription repressor  35.96 
 
 		 349 aa  231  2e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0770785  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.04 
 
 		 351 aa  230  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3642  heat-inducible transcription repressor  35.17 
 
 		 352 aa  229  6e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175788  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.43 
 
 		 344 aa  227  2e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0970  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.3 
 
 		 350 aa  227  3e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477518  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  34.71 
 
 		 339 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1553  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.94 
 
 		 343 aa  225  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2164  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.76 
 
 		 355 aa  225  1e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.705839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.31 
 
 		 345 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1195  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.16 
 
 		 355 aa  223  3e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.300554 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01183  heat-inducible transcription repressor  34.69 
 
 		 343 aa  223  4e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.180018  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1598  heat-inducible transcription repressor  35.28 
 
 		 354 aa  223  4.9999999999999996e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.951274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.07 
 
 		 348 aa  223  4.9999999999999996e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.01 
 
 		 344 aa  222  8e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1663  heat-inducible transcription repressor  36.99 
 
 		 367 aa  222  8e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.971027  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.94 
 
 		 345 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2882  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.29 
 
 		 338 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.483845  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1998  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.04 
 
 		 344 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1026  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.91 
 
 		 354 aa  218  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.72 
 
 		 343 aa  217  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1036  heat-inducible transcription repressor  35.34 
 
 		 345 aa  218  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.672204  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.82 
 
 		 341 aa  216  5e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1772  heat-inducible transcription repressor  34.99 
 
 		 336 aa  214  9.999999999999999e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3966  heat-inducible transcription repressor  34.68 
 
 		 339 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0692211 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  34.36 
 
 		 339 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2331  heat-inducible transcription repressor  34.77 
 
 		 340 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3327  heat-inducible transcription repressor  34.77 
 
 		 340 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  34.36 
 
 		 339 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  32.75 
 
 		 344 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0494  heat-inducible transcription repressor  34.77 
 
 		 385 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0732  heat-inducible transcription repressor  35.34 
 
 		 339 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1105  heat-inducible transcription repressor  34.77 
 
 		 385 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.854557  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3284  heat-inducible transcription repressor  34.77 
 
 		 340 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245483  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3317  heat-inducible transcription repressor  34.77 
 
 		 340 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2212  heat-inducible transcription repressor  34.77 
 
 		 340 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2503  heat-inducible transcription repressor  34.77 
 
 		 339 aa  212  7e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0852  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.81 
 
 		 352 aa  212  7.999999999999999e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000798952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2423  heat-inducible transcription repressor  35 
 
 		 339 aa  212  7.999999999999999e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.557325  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0261  heat-inducible transcription repressor  36 
 
 		 340 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0745  heat-inducible transcription repressor  36 
 
 		 340 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.211832  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0715  heat-inducible transcription repressor  36 
 
 		 340 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0187  heat-inducible transcription repressor  36.96 
 
 		 362 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.476664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1487  heat-inducible transcription repressor  34.69 
 
 		 336 aa  211  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0930  heat-inducible transcription repressor  36.66 
 
 		 342 aa  210  3e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1302  heat-inducible transcription repressor  34.3 
 
 		 340 aa  210  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132578  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1584  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.52 
 
 		 355 aa  210  3e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0405407  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4063  heat-inducible transcription repressor  31.21 
 
 		 338 aa  210  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.526253  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4449  heat-inducible transcription repressor  31.52 
 
 		 338 aa  209  4e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000694366  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2639  heat-inducible transcription repressor  35.33 
 
 		 340 aa  209  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  31.3 
 
 		 344 aa  209  5e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1858  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.11 
 
 		 350 aa  209  6e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0663  heat-inducible transcription repressor  35.34 
 
 		 340 aa  209  8e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0639  heat-inducible transcription repressor  35.34 
 
 		 340 aa  209  8e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4053  heat-inducible transcription repressor  31.21 
 
 		 338 aa  208  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00744253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4338  heat-inducible transcription repressor  31.21 
 
 		 338 aa  208  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3771500000000003e-32 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4017  heat-inducible transcription repressor  36.57 
 
 		 356 aa  208  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4397  heat-inducible transcription repressor  31.21 
 
 		 338 aa  207  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.332663  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4215  heat-inducible transcription repressor  31.21 
 
 		 338 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0194  heat-inducible transcription repressor  36.49 
 
 		 362 aa  207  2e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.636083  normal  0.88181 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3042  heat-inducible transcription repressor  31.82 
 
 		 343 aa  207  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00211057  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4541  heat-inducible transcription repressor  31.21 
 
 		 338 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123825  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0426  heat-inducible transcription repressor  35.45 
 
 		 362 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0398  heat-inducible transcription repressor  35.55 
 
 		 360 aa  207  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4435  heat-inducible transcription repressor  31.21 
 
 		 338 aa  207  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000489937  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5419  heat-inducible transcription repressor  37.06 
 
 		 334 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0333  heat-inducible transcription repressor  36.31 
 
 		 362 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0187094  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1303  heat-inducible transcription repressor  35.19 
 
 		 338 aa  207  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2081  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.24 
 
 		 343 aa  207  3e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4167  heat-inducible transcription repressor  31.21 
 
 		 338 aa  206  4e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00317032  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1650  heat-inducible transcription repressor  34.41 
 
 		 334 aa  206  5e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0152  heat-inducible transcription repressor  36.21 
 
 		 362 aa  206  5e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1724  heat-inducible transcription repressor  34.59 
 
 		 342 aa  206  5e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0452003  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0801  heat-inducible transcription repressor  30.91 
 
 		 338 aa  205  8e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000436482  hitchhiker  4.70073e-19 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0566  heat-inducible transcription repressor  37.5 
 
 		 342 aa  205  9e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.360767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0394  heat-inducible transcription repressor  35.45 
 
 		 362 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3244  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.92 
 
 		 347 aa  205  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.488784  normal  0.0534413 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3579  heat-inducible transcription repressor  33.81 
 
 		 354 aa  205  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.621722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3333  heat-inducible transcription repressor  35.73 
 
 		 342 aa  205  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>