49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1032 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1032  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 
522 aa  1052    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0108936 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2740  peptidase M48, Ste24p  37.92 
 
 
510 aa  290  3e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0437  peptidase M48 Ste24p  32.61 
 
 
503 aa  159  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3140  peptidase M48 Ste24p  30.99 
 
 
623 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0822769  hitchhiker  0.000295634 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3081  peptidase M48, Ste24p  27.89 
 
 
495 aa  99  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.264876  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2726  peptidase M48 Ste24p  30.38 
 
 
623 aa  94.4  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0179908  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3388  peptidase M48, Ste24p  30.09 
 
 
645 aa  93.6  8e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.247321 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3197  Zn-dependent protease with chaperone function-like  29.96 
 
 
634 aa  93.6  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000540143 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1278  peptidase M48 Ste24p  32.19 
 
 
617 aa  89.4  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589053  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0490  Zn-dependent protease with chaperone function  28.8 
 
 
615 aa  88.6  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3806  peptidase M48, Ste24p  30.56 
 
 
620 aa  85.9  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3182  peptidase M48 Ste24p  27.01 
 
 
495 aa  84.7  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.206612  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3604  hypothetical protein  26.64 
 
 
773 aa  77.8  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0522431  hitchhiker  0.00718988 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2984  peptidase M48, Ste24p  28.16 
 
 
495 aa  75.1  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.37325  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1714  peptidase M48 Ste24p  22.22 
 
 
708 aa  72.8  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.729234  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7083  Zn-dependent protease with chaperone function-like protein  27.57 
 
 
713 aa  66.6  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2898  peptidase M48 Ste24p  26.05 
 
 
621 aa  58.2  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0804382  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0247  heat shock protein HtpX  26.4 
 
 
298 aa  53.5  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0423  peptidase M48 Ste24p  26.4 
 
 
298 aa  53.5  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.666925  hitchhiker  0.00000193107 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3734  hypothetical protein  27.73 
 
 
432 aa  51.6  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1993  peptidase M48, Ste24p  29.35 
 
 
615 aa  51.2  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142251 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0632  Ste24 endopeptidase  30.88 
 
 
415 aa  50.8  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.035842  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3384  peptidase M48 Ste24p  25.68 
 
 
283 aa  48.5  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1916  heat shock protein HtpX  25.32 
 
 
288 aa  48.1  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078647 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8783  peptidase M48 Ste24p  25.94 
 
 
398 aa  47.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.589111 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2058  HtpX domain protein  23.2 
 
 
294 aa  47.4  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000452797  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2910  peptidase M48 Ste24p  24.03 
 
 
420 aa  47  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000466586  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0307  heat shock protein HtpX  24.55 
 
 
291 aa  46.6  0.001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.173543  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3151  hypothetical protein  26.38 
 
 
664 aa  45.8  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1981  peptidase M48, Ste24p  24.23 
 
 
297 aa  45.4  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.145585  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3569  peptidase M48, Ste24p  27.32 
 
 
285 aa  45.4  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000538861  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2454  Ste24 endopeptidase  30.3 
 
 
414 aa  45.1  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.958054  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01788  hypothetical protein  24.02 
 
 
293 aa  44.7  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0189  heat shock protein HtpX  27.13 
 
 
307 aa  44.7  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.160092  normal  0.264945 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1527  peptidase M48 Ste24p  29.55 
 
 
613 aa  44.7  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0376313  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01800  heat shock protein HtpX  24.02 
 
 
293 aa  44.7  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2561  heat shock protein HtpX  24.02 
 
 
293 aa  44.7  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000337122  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2097  heat shock protein HtpX  24.02 
 
 
293 aa  44.7  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000180088  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1358  heat shock protein HtpX  24.02 
 
 
293 aa  44.7  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00135277  normal  0.0441345 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1803  heat shock protein HtpX  24.02 
 
 
293 aa  44.7  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.436712  normal  0.04369 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2058  heat shock protein HtpX  24.02 
 
 
293 aa  44.7  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000183907  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1920  heat shock protein HtpX  24.02 
 
 
293 aa  44.7  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000729476  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1947  HtpX domain protein  23.04 
 
 
294 aa  44.3  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00129769  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2399  heat shock protein HtpX  23.58 
 
 
293 aa  43.9  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.792526  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2841  peptidase M48, Ste24p  34.38 
 
 
307 aa  44.3  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.353874 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1320  Ste24 endopeptidase  31.16 
 
 
433 aa  44.3  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.465026  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0852  heat shock protein HtpX  27.09 
 
 
287 aa  43.9  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.356452  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0774  heat shock protein HtpX  26.94 
 
 
315 aa  43.9  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2298  peptidase M48, Ste24p  34.57 
 
 
420 aa  43.9  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>