More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1005 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  100 
 
 		 858 aa  1700    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  30.15 
 
 		 847 aa  295  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  30.12 
 
 		 847 aa  278  3e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  27.29 
 
 		 849 aa  273  1e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  28.6 
 
 		 870 aa  261  4e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  28.86 
 
 		 866 aa  256  9e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  28.15 
 
 		 850 aa  252  3e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  29.87 
 
 		 845 aa  248  4e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  29.56 
 
 		 839 aa  243  7.999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  26.3 
 
 		 855 aa  238  3e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  29.98 
 
 		 837 aa  224  4.9999999999999996e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1153  hypothetical protein  27.61 
 
 		 857 aa  208  4e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1773  hypothetical protein  29.2 
 
 		 841 aa  201  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00954847  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3224  hypothetical protein  26.98 
 
 		 868 aa  197  7e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  25.76 
 
 		 850 aa  197  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3114  hypothetical protein  27.58 
 
 		 877 aa  194  8e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2460  protein of unknown function DUF214  28.17 
 
 		 877 aa  193  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.764632  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1527  hypothetical protein  26.51 
 
 		 867 aa  193  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0654  ABC transporter, permease protein  27.55 
 
 		 835 aa  191  5e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0804  protein of unknown function DUF214  27.55 
 
 		 835 aa  191  5e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  24.63 
 
 		 851 aa  191  5.999999999999999e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  27.38 
 
 		 846 aa  188  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1416  hypothetical protein  29.28 
 
 		 843 aa  187  6e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.675366  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  27.39 
 
 		 843 aa  186  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  28.24 
 
 		 842 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  27.69 
 
 		 857 aa  185  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3477  protein of unknown function DUF214  27.24 
 
 		 884 aa  182  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5155  hypothetical protein  27.05 
 
 		 855 aa  177  7e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  26.87 
 
 		 844 aa  175  3.9999999999999995e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  26.32 
 
 		 858 aa  174  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  24.8 
 
 		 849 aa  174  5e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  27.31 
 
 		 842 aa  172  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  27.38 
 
 		 842 aa  169  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  26 
 
 		 849 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1291  hypothetical protein  27.47 
 
 		 866 aa  164  7e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  25.24 
 
 		 855 aa  155  4e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  25.86 
 
 		 848 aa  147  7.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1282  hypothetical protein  27.16 
 
 		 853 aa  145  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000146358 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  24.8 
 
 		 855 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2024  predicted permease  22.98 
 
 		 817 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003769  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  22.16 
 
 		 817 aa  121  6e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.660506  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02648  hypothetical protein  21.71 
 
 		 817 aa  120  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  25.26 
 
 		 843 aa  117  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3422  hypothetical protein  22.96 
 
 		 887 aa  111  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3310  hypothetical protein  23.34 
 
 		 887 aa  110  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  24.96 
 
 		 847 aa  110  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0832  hypothetical protein  22.42 
 
 		 889 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0867  hypothetical protein  22.34 
 
 		 889 aa  108  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0855  protein of unknown function DUF214  23.19 
 
 		 884 aa  107  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3508  hypothetical protein  22.62 
 
 		 879 aa  105  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2669  hypothetical protein  23.88 
 
 		 820 aa  103  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.243432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  25.84 
 
 		 821 aa  103  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  26.34 
 
 		 845 aa  103  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0626  hypothetical protein  22.61 
 
 		 845 aa  102  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3145  hypothetical protein  22.44 
 
 		 878 aa  102  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6018  protein of unknown function DUF214  24.33 
 
 		 800 aa  100  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  26.26 
 
 		 839 aa  99  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2144  protein of unknown function DUF214  31.21 
 
 		 408 aa  99  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  25.64 
 
 		 838 aa  95.5  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0256  hypothetical protein  24.38 
 
 		 793 aa  95.1  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1235  hypothetical protein  22.21 
 
 		 836 aa  95.1  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0042131  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0712  hypothetical protein  23.73 
 
 		 889 aa  94  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  22.99 
 
 		 842 aa  93.2  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  24.24 
 
 		 841 aa  92.4  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  23.58 
 
 		 836 aa  92.4  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5297  protein of unknown function DUF214  23.23 
 
 		 821 aa  90.1  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4107  hypothetical protein  25.63 
 
 		 840 aa  88.6  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  24.33 
 
 		 855 aa  87  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  22.53 
 
 		 834 aa  86.7  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3954  hypothetical protein  25.28 
 
 		 849 aa  82.4  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0372326 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  23.78 
 
 		 825 aa  80.5  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1688  protein of unknown function DUF214  24.7 
 
 		 846 aa  80.1  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.121796 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0685  hypothetical protein  23.8 
 
 		 820 aa  78.2  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1005  hypothetical protein  24.78 
 
 		 827 aa  77.8  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.870248 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3202  hypothetical protein  25.96 
 
 		 850 aa  77.4  0.0000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2641  putative ABC transporter, permease protein  21.83 
 
 		 803 aa  77.4  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  24.46 
 
 		 853 aa  77.4  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  23.84 
 
 		 859 aa  75.9  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2554  hypothetical protein  28.37 
 
 		 819 aa  74.3  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2172  hypothetical protein  27.98 
 
 		 820 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.78559 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  24.55 
 
 		 852 aa  73.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  24.12 
 
 		 873 aa  72.4  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001049  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  23.8 
 
 		 836 aa  72.8  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0345  hypothetical protein  24.73 
 
 		 819 aa  72.4  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427244  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04771  peptide ABC transporter permease  24.03 
 
 		 836 aa  72  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0653  hypothetical protein  27.27 
 
 		 407 aa  72  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0555  hypothetical protein  21.37 
 
 		 865 aa  71.6  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0079  hypothetical protein  26.3 
 
 		 821 aa  71.2  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  24.21 
 
 		 835 aa  68.9  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  23.3 
 
 		 856 aa  67.8  0.0000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1073  hypothetical protein  26.02 
 
 		 384 aa  67  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.418174 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2027  hypothetical protein  24.22 
 
 		 815 aa  67  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4397  hypothetical protein  26.28 
 
 		 821 aa  66.6  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.256206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2155  protein of unknown function DUF214  29.93 
 
 		 445 aa  67  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.755011  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  28.44 
 
 		 853 aa  65.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3021  hypothetical protein  27.36 
 
 		 795 aa  65.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00599694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  20.78 
 
 		 897 aa  65.1  0.000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1541  ABC transporter inner membrane protein  27.19 
 
 		 795 aa  65.1  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  18.47 
 
 		 856 aa  65.1  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0192  hypothetical protein  26.79 
 
 		 795 aa  63.9  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0431471  normal  0.319513 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>