More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0996 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0996  hypothetical protein  100 
 
 
249 aa  506  9.999999999999999e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140664  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  65.73 
 
 
247 aa  333  1e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  66.13 
 
 
247 aa  332  4e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0371  hypothetical protein  63.93 
 
 
246 aa  329  2e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00064064  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  64.11 
 
 
247 aa  326  3e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  62.5 
 
 
247 aa  324  8.000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  62.1 
 
 
247 aa  324  8.000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  63.31 
 
 
247 aa  322  3e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  62.1 
 
 
247 aa  320  9.999999999999999e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1103  hypothetical protein  60.33 
 
 
243 aa  301  4.0000000000000003e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000610466  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3547  protein of unknown function DUF28  58.37 
 
 
250 aa  297  1e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132193  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2125  hypothetical protein  57.03 
 
 
248 aa  296  3e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0685  hypothetical protein  56.22 
 
 
251 aa  295  7e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1800  hypothetical protein  55.82 
 
 
250 aa  294  1e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00453018 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12350  hypothetical protein  54.98 
 
 
253 aa  294  1e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242675  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0479  hypothetical protein  55.2 
 
 
250 aa  294  1e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000314446  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1151  hypothetical protein  53.01 
 
 
250 aa  292  3e-78  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  58.47 
 
 
248 aa  291  6e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1748  hypothetical protein  54.22 
 
 
249 aa  289  2e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.649879 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1615  hypothetical protein  58.4 
 
 
249 aa  283  1.0000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0469  hypothetical protein  55.12 
 
 
253 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0986  hypothetical protein  57.14 
 
 
247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1435  hypothetical protein  55.24 
 
 
251 aa  282  4.0000000000000003e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748903  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0454  hypothetical protein  54.72 
 
 
253 aa  281  8.000000000000001e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.588948  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  56.2 
 
 
247 aa  279  3e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3490  hypothetical protein  53.06 
 
 
246 aa  275  5e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0538  hypothetical protein  51.81 
 
 
250 aa  275  7e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  56.05 
 
 
250 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  56.05 
 
 
250 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1219  protein of unknown function DUF28  54.07 
 
 
250 aa  272  4.0000000000000004e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.100847  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0137  hypothetical protein  55.42 
 
 
248 aa  271  7e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.153689  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2325  hypothetical protein  55.1 
 
 
248 aa  270  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.667141  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0475  hypothetical protein  50.2 
 
 
250 aa  271  1e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3201  hypothetical protein  56.33 
 
 
247 aa  270  2e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.044565 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0542  hypothetical protein  49.8 
 
 
250 aa  269  4e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0165  hypothetical protein  49.2 
 
 
250 aa  268  8e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  55.28 
 
 
248 aa  267  1e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1634  protein of unknown function DUF28  52.4 
 
 
252 aa  265  5.999999999999999e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.642601  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0657  hypothetical protein  49 
 
 
250 aa  263  2e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1658  hypothetical protein  51.87 
 
 
242 aa  261  8.999999999999999e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1842  hypothetical protein  53.01 
 
 
248 aa  260  1e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  51.45 
 
 
246 aa  259  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0181  hypothetical protein  51.05 
 
 
248 aa  259  4e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3911  protein of unknown function DUF28  51.81 
 
 
249 aa  259  4e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.662224  normal  0.0433199 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2492  hypothetical protein  54.92 
 
 
250 aa  259  4e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1704  hypothetical protein  55.95 
 
 
252 aa  258  5.0000000000000005e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000609953  normal  0.531988 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3629  hypothetical protein  54.07 
 
 
252 aa  258  6e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000422691  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1793  protein of unknown function DUF28  51.63 
 
 
251 aa  258  6e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.209564  normal  0.104344 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1449  hypothetical protein  52.05 
 
 
246 aa  258  8e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1643  hypothetical protein  47.39 
 
 
250 aa  257  1e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  54.07 
 
 
248 aa  256  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0536  hypothetical protein  52.87 
 
 
245 aa  256  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.297552  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0025  hypothetical protein  50.82 
 
 
243 aa  256  2e-67  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0985  hypothetical protein  51.41 
 
 
252 aa  256  2e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2096  hypothetical protein  51.6 
 
 
249 aa  256  3e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.803403  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1779  hypothetical protein  50.2 
 
 
249 aa  255  6e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3521  hypothetical protein  53.11 
 
 
239 aa  255  6e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0483995  normal  0.126063 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  53.04 
 
 
247 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4273  hypothetical protein  51.41 
 
 
248 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.538279  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2075  hypothetical protein  51.88 
 
 
242 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.116774  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2574  hypothetical protein  51 
 
 
248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000592568  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2066  hypothetical protein  48.8 
 
 
250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6116  hypothetical protein  50.2 
 
 
250 aa  253  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.701892  normal  0.165467 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2570  hypothetical protein  51.43 
 
 
251 aa  252  3e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0816  hypothetical protein  50.42 
 
 
243 aa  252  4.0000000000000004e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.177048  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0807  hypothetical protein  52.19 
 
 
251 aa  252  4.0000000000000004e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1318  hypothetical protein  54.8 
 
 
250 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0714247  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0496  hypothetical protein  51.81 
 
 
250 aa  252  5.000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.813063  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17500  conserved hypothetical protein TIGR01033  50.41 
 
 
252 aa  252  5.000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.268105  normal  0.267307 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1989  hypothetical protein  51.6 
 
 
252 aa  251  7e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0129309 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  50.62 
 
 
246 aa  250  1e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0618  hypothetical protein  50.84 
 
 
239 aa  250  1e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.979417  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1106  hypothetical protein  51.41 
 
 
252 aa  250  1e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0422  hypothetical protein  52.85 
 
 
244 aa  249  2e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0951689  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1249  hypothetical protein  50.4 
 
 
247 aa  250  2e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2215  hypothetical protein  53.06 
 
 
243 aa  250  2e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0612934 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1792  hypothetical protein  49.4 
 
 
249 aa  249  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.165315  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2629  hypothetical protein  50 
 
 
251 aa  249  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1752  hypothetical protein  52.85 
 
 
244 aa  249  2e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000585673  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0661  hypothetical protein  52.4 
 
 
248 aa  249  3e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.135239  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1249  hypothetical protein  50.4 
 
 
247 aa  249  3e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2722  hypothetical protein  54.39 
 
 
240 aa  249  3e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2108  protein of unknown function DUF28  49.8 
 
 
249 aa  249  3e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00811013  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2183  hypothetical protein  51.22 
 
 
250 aa  249  3e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2554  protein of unknown function DUF28  51.81 
 
 
248 aa  249  4e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113083  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15040  conserved hypothetical protein TIGR01033  48.59 
 
 
249 aa  248  6e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.105495  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2355  hypothetical protein  59.31 
 
 
241 aa  247  1e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.377653 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36720  hypothetical protein  50.6 
 
 
249 aa  246  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2113  hypothetical protein  51.84 
 
 
246 aa  246  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00850732 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3179  protein of unknown function DUF28  48.8 
 
 
250 aa  246  2e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51810  hypothetical protein  50.6 
 
 
248 aa  247  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73043  hitchhiker  0.0000547975 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2351  protein of unknown function DUF28  47.6 
 
 
251 aa  246  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1407  hypothetical protein  51 
 
 
248 aa  246  3e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3828  hypothetical protein  49.8 
 
 
251 aa  246  3e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4544  hypothetical protein  50.2 
 
 
248 aa  246  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.528574  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0501  protein of unknown function DUF28  46.94 
 
 
249 aa  246  3e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3980  hypothetical protein  51.41 
 
 
248 aa  245  4e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1348  hypothetical protein  51.84 
 
 
246 aa  245  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00414949 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2058  hypothetical protein  51.84 
 
 
246 aa  245  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.074562 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2053  hypothetical protein  51.84 
 
 
246 aa  245  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>