44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0961 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0961  hypothetical protein  100 
 
 		 372 aa  772    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.605405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3584  hypothetical protein  29.04 
 
 		 366 aa  144  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0190  hypothetical protein  29.38 
 
 		 379 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  26.54 
 
 		 363 aa  89.4  8e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1611  Methicillin resistance protein  24.44 
 
 		 370 aa  89.4  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  23.42 
 
 		 360 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1415  methicillin resistance protein  27.49 
 
 		 366 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.89632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1256  Methicillin resistance protein  25.41 
 
 		 347 aa  70.5  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000274445 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4359  hypothetical protein  27.19 
 
 		 333 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651926  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5796  Methicillin resistance protein  28.74 
 
 		 370 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0083  methicillin resistance protein  24.53 
 
 		 354 aa  68.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2417  methicillin resistance protein  22.98 
 
 		 366 aa  67.8  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00836283  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5355  hypothetical protein  27.2 
 
 		 359 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0746954 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0801  Methicillin resistance protein  28.09 
 
 		 373 aa  66.6  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0340  Methicillin resistance protein  28.33 
 
 		 394 aa  64.7  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1247  femAB family protein  26.16 
 
 		 352 aa  63.9  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3975  methicillin resistance protein  22.58 
 
 		 366 aa  63.9  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2093  Methicillin resistance protein  25.6 
 
 		 346 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.801885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1294  Methicillin resistance protein  24.76 
 
 		 340 aa  62  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.402759 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3053  Methicillin resistance protein  24.46 
 
 		 354 aa  60.1  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000266593 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3925  hypothetical protein  24.07 
 
 		 334 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.117767  normal  0.0555776 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4293  hypothetical protein  24.07 
 
 		 334 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0525491 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16380  uncharacterized methicillin resistance protein  23.76 
 
 		 329 aa  59.3  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0062  putative FemAB family protein  24.53 
 
 		 323 aa  59.3  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.731343 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4584  hypothetical protein  27.17 
 
 		 332 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.91512 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5045  hypothetical protein  26.63 
 
 		 332 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.280998  normal  0.420218 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0792  methicillin resistance protein  28.14 
 
 		 337 aa  53.9  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4673  methicillin resistance protein  25.14 
 
 		 383 aa  52.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1598  Methicillin resistance protein  23.2 
 
 		 364 aa  52.8  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.075491  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0599  FemA protein  26.29 
 
 		 347 aa  52  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.33847  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1609  Methicillin resistance protein  24.83 
 
 		 347 aa  51.6  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0961  methicillin resistance protein  24.28 
 
 		 359 aa  50.1  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2858  methicillin resistance protein  23.3 
 
 		 342 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8162  Methicillin resistance protein  22.98 
 
 		 343 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848631  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2928  Methicillin resistance protein  29.21 
 
 		 410 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.651446 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1444  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  24.36 
 
 		 339 aa  47.8  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.593499  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2873  hypothetical protein  23.93 
 
 		 380 aa  45.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0739  methicillin resistance protein  23.66 
 
 		 368 aa  44.7  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.274792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2347  FemAB family protein  30.21 
 
 		 445 aa  43.9  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.439209  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2059  FemAB family protein  30.21 
 
 		 445 aa  43.9  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2216  FemAB-related protein, PEP-CTERM system- associated  23.6 
 
 		 342 aa  44.3  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1393  hypothetical protein  23.05 
 
 		 331 aa  43.9  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.238447  normal  0.393853 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5010  femAB family protein  19.82 
 
 		 341 aa  43.5  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.342142  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0771  methicillin resistance protein  20.89 
 
 		 377 aa  43.1  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.455727  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>