More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0935 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 225 aa  455  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  34.31 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  35.59 
 
 		 223 aa  123  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  32.86 
 
 		 214 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  33.65 
 
 		 232 aa  120  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  35.6 
 
 		 219 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  33.16 
 
 		 224 aa  111  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  33.33 
 
 		 208 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  37.21 
 
 		 209 aa  107  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2958  putative signal transduction protein with CBS domains  29.44 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  32.11 
 
 		 210 aa  103  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  33.18 
 
 		 214 aa  102  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1256  signal-transduction protein  34.81 
 
 		 210 aa  102  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0714  CBS domain containing protein  32.96 
 
 		 227 aa  102  6e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724637  normal  0.522786 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2731  CBS domain containing membrane protein  28.64 
 
 		 214 aa  102  6e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0309  CBS domain-containing protein  33.51 
 
 		 230 aa  100  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349467  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  35.87 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0462  acetoin utilization protein AcuB  30.05 
 
 		 214 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4777  acetoin utilization protein AcuB  30.05 
 
 		 214 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0707  CBS domain containing membrane protein  29.84 
 
 		 221 aa  99.8  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  31.55 
 
 		 211 aa  99.4  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4396  acetoin utilization protein  30.37 
 
 		 214 aa  99  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4413  acetoin utilization protein  30.37 
 
 		 214 aa  99  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4799  acetoin utilization protein AcuB  30.37 
 
 		 214 aa  99  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4782  acetoin utilization protein AcuB  30.37 
 
 		 214 aa  99  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4562  acetoin utilization protein AcuB  30.37 
 
 		 214 aa  98.6  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4917  acetoin utilization protein AcuB  30.37 
 
 		 214 aa  98.6  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4495  CBS domain-containing protein  29.91 
 
 		 214 aa  98.2  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4803  acetoin utilization protein AcuB  29.91 
 
 		 214 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  34.46 
 
 		 214 aa  97.4  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1915  CBS domain-containing protein  29.94 
 
 		 223 aa  97.4  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.451224  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1533  CBS domain containing membrane protein  32.62 
 
 		 223 aa  96.7  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.279871  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  31.19 
 
 		 215 aa  96.3  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3337  CBS domain-containing protein  27.15 
 
 		 214 aa  94.4  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.126622  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  30.69 
 
 		 215 aa  94.4  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2208  CBS domain-containing protein  32.46 
 
 		 221 aa  91.7  8e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000650498  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0990  acetoin utilization protein AcuB, putative  36.92 
 
 		 140 aa  91.3  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2076  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 202 aa  89.7  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.250965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  39.13 
 
 		 145 aa  88.6  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  29.44 
 
 		 216 aa  87.8  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  31.22 
 
 		 216 aa  87  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0178  CBS domain-containing protein  37.88 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1342  putative acetoin utilization protein AcuB  32 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1585  CBS domain containing protein  33.15 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2811  CBS domain-containing protein  35.07 
 
 		 143 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  36.69 
 
 		 149 aa  80.1  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  27.19 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  29.71 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3355  CBS domain-containing protein  34.35 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1158  CBS domain containing protein  35.07 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3209  CBS domain-containing protein  35.07 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.549448  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3348  CBS domain-containing protein  35.07 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3209  CBS domain-containing protein  35.07 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1059  CBS domain-containing protein  35.07 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1120  CBS domain-containing protein  35.07 
 
 		 143 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  32.39 
 
 		 155 aa  77  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2674  signal transduction protein  36.43 
 
 		 166 aa  77  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.184526  hitchhiker  0.0000000000000277355 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  36.64 
 
 		 166 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1055  CBS domain-containing protein  34.33 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.53863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5608  signal transduction protein  35 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2437  hypothetical protein  31.69 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02666  CBS domain containing membrane protein  34.85 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3837  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.31 
 
 		 520 aa  76.3  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1082  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.11 
 
 		 514 aa  75.9  0.0000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2551  signal transduction protein  31.07 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1395  CBS domain-containing protein  38.64 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1899  IMP dehydrogenase/GMP reductase  34.11 
 
 		 517 aa  75.1  0.0000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2521  signal transduction protein  35.34 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4227  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.54 
 
 		 520 aa  74.3  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.147199 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0638  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.56 
 
 		 504 aa  74.3  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.726913  normal  0.734007 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.33 
 
 		 488 aa  73.6  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  29.61 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04740  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.82 
 
 		 514 aa  73.9  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  31.11 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1237  acetoin utilization protein AcuB, putative  33.58 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1320  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  27.96 
 
 		 504 aa  72.4  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0931634  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  32.54 
 
 		 225 aa  72  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6535  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.51 
 
 		 503 aa  71.6  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1475  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.58 
 
 		 321 aa  71.6  0.000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1429  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.58 
 
 		 321 aa  71.6  0.000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28670  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.77 
 
 		 507 aa  70.9  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1097  hypothetical protein  27.59 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 225 aa  71.2  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  33.82 
 
 		 862 aa  70.5  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  33.33 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0164  CBS domain-containing protein  31.06 
 
 		 139 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00289218  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0172  homoserine O-acetyltransferase  29.6 
 
 		 492 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  38.81 
 
 		 427 aa  70.1  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0058  CBS domain containing membrane protein  32.56 
 
 		 140 aa  70.1  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  31.47 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0999  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.05 
 
 		 491 aa  69.3  0.00000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000499041  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2585  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.85 
 
 		 507 aa  69.7  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.817903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  30.6 
 
 		 503 aa  69.3  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  38.58 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0636  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.01 
 
 		 537 aa  69.3  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.644185 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  37.8 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0189  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  28.91 
 
 		 489 aa  68.9  0.00000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000133225  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  30.82 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  28.31 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3645  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.15 
 
 		 500 aa  68.6  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.808002  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>