More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0918 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0918  hypothetical protein  100 
 
 
271 aa  561  1.0000000000000001e-159  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2990  hypothetical protein  48.09 
 
 
282 aa  277  2e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.262308  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1826  hypothetical protein  50.19 
 
 
282 aa  272  3e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542435  hitchhiker  0.00448531 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2092  hypothetical protein  44.83 
 
 
275 aa  250  1e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2029  hypothetical protein  49.61 
 
 
276 aa  251  1e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  42.35 
 
 
285 aa  225  6e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2535  hypothetical protein  42.48 
 
 
274 aa  219  3e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.851232  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1322  hypothetical protein  43.08 
 
 
274 aa  199  5e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2527  hypothetical protein  34.98 
 
 
265 aa  182  5.0000000000000004e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2657  hypothetical protein  34.6 
 
 
265 aa  182  6e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1787  hypothetical protein  35.25 
 
 
282 aa  177  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.568084  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0409  Alpha/beta hydrolase  33.71 
 
 
287 aa  154  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.140246 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0900  phospholipase/Carboxylesterase  36 
 
 
306 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4026  hypothetical protein  36.14 
 
 
278 aa  152  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.381754  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2614  phospholipase/Carboxylesterase  34.7 
 
 
307 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2424  putative enzyme (3.4.-)  34 
 
 
278 aa  150  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3502  phospholipase/Carboxylesterase  34.7 
 
 
307 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5033  hypothetical protein  33.18 
 
 
277 aa  149  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816657  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2467  hypothetical protein  35.12 
 
 
266 aa  148  8e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0772677  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3567  phospholipase/carboxylesterase  32.45 
 
 
290 aa  145  6e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.486808  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12329  hypothetical protein  37.15 
 
 
281 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4214  phospholipase/carboxylesterase  36.76 
 
 
295 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2384  Hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  34.21 
 
 
297 aa  137  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397135  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1023  hypothetical protein  35.66 
 
 
274 aa  136  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.0462853 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2325  hypothetical protein  35.08 
 
 
279 aa  136  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00039839  decreased coverage  0.00000132224 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0699  hypothetical protein  39.76 
 
 
275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.614085 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0705  hypothetical protein  39.76 
 
 
275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0719  hypothetical protein  39.76 
 
 
275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.757483  normal  0.0283787 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3343  putative lipoprotein  30.42 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911253  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2039  hypothetical protein  35.04 
 
 
279 aa  124  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7068  hypothetical protein  29.1 
 
 
267 aa  122  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2532  hypothetical protein  37.32 
 
 
292 aa  121  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39340  AB-hydrolase-lipoprotein  31.91 
 
 
295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10362  predicted protein  29.43 
 
 
299 aa  120  3e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.203022  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1314  putative lipoprotein  29.34 
 
 
298 aa  118  9e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1504  lipoprotein, putative  29.34 
 
 
298 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2450  hydrolase with alpha/beta fold  25.94 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.805173 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  33.05 
 
 
285 aa  116  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2421  hypothetical protein  32.08 
 
 
315 aa  114  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1304  hypothetical protein  33.19 
 
 
285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.196615  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6855  hypothetical protein  30.96 
 
 
266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.342359 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2695  hypothetical protein  32.79 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5147  hypothetical protein  32.51 
 
 
336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.252623 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1252  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  34.58 
 
 
294 aa  112  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.696042  normal  0.518884 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1064  putative lipoprotein  30.58 
 
 
304 aa  112  9e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0016  hypothetical protein  32.35 
 
 
272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652616  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2788  hypothetical protein  29.12 
 
 
292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0282632  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03757  BEM46 family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G04660)  32.18 
 
 
303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.913854 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1134  putative enzyme  28.27 
 
 
284 aa  110  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2702  hypothetical protein  28.74 
 
 
292 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0546858  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2809  hypothetical protein  28.74 
 
 
292 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522883  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16600  alpha/beta family hydrolase  30.71 
 
 
301 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579607  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2747  hypothetical protein  28.74 
 
 
292 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2687  hypothetical protein  28.27 
 
 
284 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.441932  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5537  Lysophospholipase-like protein  29.07 
 
 
266 aa  109  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.738502  normal  0.85419 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2200  putative lipoprotein  28.95 
 
 
296 aa  108  7.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.31625  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0720  hypothetical protein  30.23 
 
 
270 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0935769  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3365  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  28.69 
 
 
297 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.432106  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1143  putative enzyme  27.85 
 
 
284 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02426  predicted peptidase  27.85 
 
 
293 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.643238  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2686  hypothetical protein  27.85 
 
 
284 aa  108  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00504077  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02390  hypothetical protein  27.85 
 
 
293 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3766  hypothetical protein  27.85 
 
 
284 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147795  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119577  Protein bem46-like protein  31.91 
 
 
289 aa  108  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15434  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2819  hypothetical protein  27.85 
 
 
284 aa  108  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000321727  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3344  hypothetical protein  32.58 
 
 
296 aa  106  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00702344 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3572  hypothetical protein  31.05 
 
 
314 aa  105  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.455992  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1951  hypothetical protein  33.18 
 
 
314 aa  105  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.896568  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1156  hypothetical protein  28.42 
 
 
294 aa  105  7e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.40892  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1297  hypothetical protein  29.2 
 
 
324 aa  104  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12258  normal  0.997754 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2909  hypothetical protein  26.69 
 
 
284 aa  104  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00394962  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2887  hypothetical protein  32.88 
 
 
294 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1313  peptidase S15  26.44 
 
 
294 aa  103  4e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1443  putative lipoprotein  30.04 
 
 
301 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3451  hypothetical protein  31.56 
 
 
275 aa  102  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3210  hypothetical protein  27.4 
 
 
285 aa  102  8e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.287956  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1105  lipoprotein  28.79 
 
 
307 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2656  hypothetical protein  26.17 
 
 
276 aa  101  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.251758  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5044  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  27.11 
 
 
271 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.144689  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1500  putative lipoprotein  28.79 
 
 
307 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.313802  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4117  lipoprotein  29.75 
 
 
307 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4222  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  28.4 
 
 
286 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3467  hypothetical protein  29.37 
 
 
332 aa  97.4  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25166  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2205  hypothetical protein  26.94 
 
 
260 aa  97.8  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00108131  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2032  hypothetical protein  32.47 
 
 
294 aa  96.3  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.287773  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND02210  conserved hypothetical protein  26.47 
 
 
358 aa  95.9  7e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6077  hypothetical protein  28.46 
 
 
268 aa  94.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.326686  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1306  hypothetical protein  31.05 
 
 
280 aa  94  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2116  hypothetical protein  31.01 
 
 
286 aa  94  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.537851  normal  0.60451 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47043  predicted protein  28.57 
 
 
281 aa  93.2  5e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.33463  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40120  predicted protein  29.5 
 
 
304 aa  92.4  7e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.98867  normal  0.767485 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4295  hypothetical protein  31.35 
 
 
289 aa  92.4  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0269643  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0482  hydrolase of the alpha/beta superfamily  28.95 
 
 
272 aa  91.3  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0662813 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28215  predicted protein  34.65 
 
 
297 aa  91.3  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0358  hypothetical protein  31.02 
 
 
270 aa  89.4  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233875  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0443  hypothetical protein  29.06 
 
 
293 aa  88.6  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  25.95 
 
 
305 aa  86.3  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1129  bem46 protein  27.17 
 
 
295 aa  85.5  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.578173  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0920  hypothetical protein  30.09 
 
 
245 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.81019e-33 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_6846  predicted protein  32.29 
 
 
207 aa  82.8  0.000000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.175965  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>